241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0971 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0971  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 
318 aa  647    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0676  ribokinase-like domain-containing protein  53.33 
 
 
317 aa  358  8e-98  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0182  ribokinase-like domain-containing protein  38.92 
 
 
320 aa  228  1e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0099  ribokinase-like domain-containing protein  39.5 
 
 
319 aa  225  7e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0099  ribokinase-like domain-containing protein  39.18 
 
 
319 aa  225  1e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0824  1-phosphofructokinase  31.11 
 
 
310 aa  149  6e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1956  tagatose-6-phosphate kinase  29.97 
 
 
310 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247641  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1873  1-phosphofructokinase  26.98 
 
 
320 aa  124  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00509321 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22720  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  29.54 
 
 
315 aa  121  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.727681  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1715  1-phosphofructokinase  30.03 
 
 
324 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0551  1-phosphofructokinase  29.43 
 
 
306 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0565  1-phosphofructokinase  29.11 
 
 
306 aa  119  4.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3817  1-phosphofructokinase  28.06 
 
 
303 aa  117  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00128432  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1485  1-phosphofructokinase  28.06 
 
 
303 aa  116  6e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.211736  normal  0.0136163 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2174  1-phosphofructokinase  27.13 
 
 
326 aa  115  6.9999999999999995e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0866  1-phosphofructokinase  28.87 
 
 
310 aa  112  8.000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00871601  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2395  1-phosphofructokinase  27.1 
 
 
303 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378006  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0012  1-phosphofructokinase  26.72 
 
 
308 aa  112  9e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00179205  unclonable  0.0000000067569 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3768  1-phosphofructokinase  26.13 
 
 
303 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000270139  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0435  1-phosphofructokinase  27.99 
 
 
310 aa  108  1e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3477  1-phosphofructokinase  25.48 
 
 
303 aa  107  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000168948  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3483  1-phosphofructokinase  25.81 
 
 
303 aa  107  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.622893  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1929  tagatose-6-phosphate kinase  27.78 
 
 
310 aa  106  5e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3463  1-phosphofructokinase  26.13 
 
 
303 aa  106  6e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00127204  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1157  1-phosphofructokinase  27.27 
 
 
310 aa  106  6e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3745  1-phosphofructokinase  25.48 
 
 
303 aa  106  7e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0550156  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3727  1-phosphofructokinase  25.81 
 
 
303 aa  105  8e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5453300000000002e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3564  1-phosphofructokinase  25.81 
 
 
303 aa  105  8e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0892785  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3847  1-phosphofructokinase  25.81 
 
 
303 aa  105  8e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000858241  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1128  carbohydrate kinase, PfkB family  27.44 
 
 
310 aa  105  1e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0576  1-phosphofructokinase  28.12 
 
 
310 aa  105  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000336585  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4713  1-phosphofructokinase  29.13 
 
 
330 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2297  1-phosphofructokinase  26.24 
 
 
319 aa  103  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1788  1-phosphofructokinase  25.87 
 
 
311 aa  103  5e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.468548  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1351  ribokinase-like domain-containing protein  25 
 
 
309 aa  102  6e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1346  carbohydrate kinase  26.81 
 
 
310 aa  100  2e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0589  1-phosphofructokinase  28.94 
 
 
305 aa  101  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2224  tagatose-6-phosphate kinase  27.37 
 
 
310 aa  100  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2263  tagatose-6-phosphate kinase  27.37 
 
 
310 aa  100  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.925431  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0358  1-phosphofructokinase  26.52 
 
 
306 aa  100  3e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2110  1-phosphofructokinase  25.31 
 
 
311 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0175  1-phosphofructokinase  26.87 
 
 
306 aa  99  9e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1727  tagatose-6-phosphate kinase  26.35 
 
 
304 aa  99  1e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.209721  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1642  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  26.13 
 
 
307 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0723  1-phosphofructokinase  24.68 
 
 
306 aa  97.1  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0739  1-phosphofructokinase  24.68 
 
 
306 aa  97.1  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0650  1-phosphofructokinase  26.99 
 
 
307 aa  96.3  7e-19  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0686  1-phosphofructokinase  25.87 
 
 
316 aa  95.9  7e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.020594  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1907  tagatose-6-phosphate kinase  26.04 
 
 
307 aa  95.9  8e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.961969  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0794  1-phosphofructokinase  26.89 
 
 
315 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0702264  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0382  1-phosphofructokinase  28.48 
 
 
302 aa  94  3e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000931152  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5875  1-phosphofructokinase  25.24 
 
 
326 aa  94.4  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412228  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0445  fructose-1-phosphate kinase  27.4 
 
 
303 aa  93.6  4e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00359315  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3109  1-phosphofructokinase  24.45 
 
 
318 aa  93.6  5e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2862  1-phosphofructokinase protein  23.12 
 
 
316 aa  92.4  8e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.558464  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2744  1-phosphofructokinase  25.23 
 
 
318 aa  92.4  8e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656221  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0828  1-phosphofructokinase  25.24 
 
 
315 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.904747 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0611  tagatose-6-phosphate kinase  25.84 
 
 
311 aa  92  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4520  1-phosphofructokinase  25.57 
 
 
310 aa  92  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.491603  normal  0.561084 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4388  1-phosphofructokinase  25.57 
 
 
310 aa  92  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.758839  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1347  1-phosphofructokinase  27.36 
 
 
303 aa  91.7  2e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.50692  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0794  PfkB  26.56 
 
 
313 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0909395  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4399  1-phosphofructokinase  25.81 
 
 
315 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1069  1-phosphofructokinase  24.92 
 
 
311 aa  91.3  2e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0817  1-phosphofructokinase  26.23 
 
 
315 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6213  1-phosphofructokinase  24.06 
 
 
311 aa  90.1  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.175632  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1188  1-phosphofructokinase  27.5 
 
 
315 aa  89.7  6e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.95293  normal  0.994697 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3759  1-phosphofructokinase  27.05 
 
 
304 aa  89.7  6e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0599  1-phosphofructokinase  26.45 
 
 
338 aa  89.4  7e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0298214  normal  0.491276 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0147  1-phosphofructokinase  26.81 
 
 
315 aa  89  9e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110184  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1268  1-phosphofructokinase  26.79 
 
 
314 aa  89  9e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.955109  normal  0.500032 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0907  1-phosphofructokinase  25.89 
 
 
349 aa  88.6  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.364327  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D04  tagatose-6-phosphate kinase  28.97 
 
 
286 aa  89  1e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0175284  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1834  ribokinase-like domain-containing protein  24.19 
 
 
306 aa  88.6  1e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1031  1-phosphofructokinase  22.65 
 
 
311 aa  88.2  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1793  tagatose-6-phosphate kinase  32.5 
 
 
310 aa  87.4  3e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.354584  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3234  1-phosphofructokinase  22.65 
 
 
311 aa  87.4  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1252  1-phosphofructokinase  25 
 
 
312 aa  87.4  3e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1453  1-phosphofructokinase  26.3 
 
 
312 aa  86.7  4e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00181905  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3541  1-phosphofructokinase  22.36 
 
 
332 aa  86.3  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1511  1-phosphofructokinase  24.61 
 
 
303 aa  85.9  9e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000166616  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1164  1-phosphofructokinase  26.23 
 
 
353 aa  85.5  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1715  1-phosphofructokinase  26.28 
 
 
310 aa  85.1  0.000000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0124399  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6208  1-phosphofructokinase  26.35 
 
 
312 aa  85.5  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.315032 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12200  1-phosphofructokinase  23.81 
 
 
308 aa  84.3  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.378131  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0641  1-phosphofructokinase  25.32 
 
 
311 aa  84.3  0.000000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.021814  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3382  1-phosphofructokinase  26.94 
 
 
308 aa  84  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000263995  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2031  1-phosphofructokinase  23.55 
 
 
318 aa  83.6  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.832407  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23410  6-phosphofructokinase II  23.87 
 
 
312 aa  83.6  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.479216  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0744  1-phosphofructokinase  25.17 
 
 
315 aa  83.2  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0611075  normal  0.168241 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2896  1-phosphofructokinase  23.72 
 
 
322 aa  83.2  0.000000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.931372  hitchhiker  0.00747036 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0450  1-phosphofructokinase  24.26 
 
 
317 aa  83.2  0.000000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00488  1-phosphofructokinase  24.31 
 
 
318 aa  82.4  0.000000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0347  PfkB  21.97 
 
 
312 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0042233 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4226  1-phosphofructokinase  23.93 
 
 
313 aa  80.9  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1098  1-phosphofructokinase  26.18 
 
 
334 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.424863  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18260  1-phosphofructokinase  24.25 
 
 
314 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00550374  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4105  ribokinase-like domain-containing protein  23.49 
 
 
332 aa  79.7  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0415  6-phosphofructokinase  23.55 
 
 
350 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4987  ribokinase-like domain-containing protein  26.67 
 
 
315 aa  79.3  0.00000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>