More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0968 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0968  aminotransferase class IV  100 
 
 		 249 aa  510  1e-144  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0673  aminotransferase, class IV  50.42 
 
 		 247 aa  223  3e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0096  aminotransferase, class IV  44.49 
 
 		 273 aa  178  8e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.198329  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0096  aminotransferase class IV  44.07 
 
 		 273 aa  176  4e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.609842  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0179  aminotransferase class IV  31.39 
 
 		 271 aa  102  4e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.613423  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0082  4-amino-4-deoxychorismate lyase  32.9 
 
 		 290 aa  99.4  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0066  4-amino-4-deoxychorismate lyase  32.89 
 
 		 290 aa  98.6  9e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2639  aminotransferase class IV  27.84 
 
 		 298 aa  98.2  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.30047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1195  branched-chain amino acid aminotransferase  32.27 
 
 		 286 aa  97.8  1e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3544  branched-chain amino acid aminotransferase  32.16 
 
 		 288 aa  97.4  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.08959  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2786  branched-chain amino acid aminotransferase  28.31 
 
 		 288 aa  97.1  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0664  branched-chain amino acid aminotransferase  30.35 
 
 		 293 aa  95.5  7e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000154508  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1444  branched-chain amino acid aminotransferase  27.56 
 
 		 299 aa  95.5  7e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.224106  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2480  branched-chain amino acid aminotransferase  28.63 
 
 		 293 aa  95.1  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000254665  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0576  branched-chain amino acid aminotransferase  32.03 
 
 		 292 aa  94.4  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1706  branched-chain amino acid aminotransferase  27.95 
 
 		 299 aa  94  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.966018  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2223  branched-chain amino acid aminotransferase  28.68 
 
 		 303 aa  94.4  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0820  branched-chain amino acid aminotransferase  33.19 
 
 		 287 aa  94  2e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.354842  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1131  branched-chain amino acid aminotransferase  31.88 
 
 		 287 aa  94  2e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1713  branched-chain amino acid aminotransferase  27.95 
 
 		 299 aa  93.2  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1690  branched-chain amino acid aminotransferase  27.95 
 
 		 299 aa  93.2  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1665  branched-chain amino acid aminotransferase  27.95 
 
 		 299 aa  93.2  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.291613  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1850  branched-chain amino acid aminotransferase  27.95 
 
 		 299 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3492  branched-chain amino acid aminotransferase  27.95 
 
 		 299 aa  93.2  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.892659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1887  branched-chain amino acid aminotransferase  27.95 
 
 		 299 aa  93.2  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1849  branched-chain amino acid aminotransferase  27.95 
 
 		 299 aa  93.2  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4682  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10810  branched-chain amino acid aminotransferase  28.06 
 
 		 299 aa  93.2  4e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0069  4-amino-4-deoxychorismate lyase  31.6 
 
 		 290 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1933  branched-chain amino acid aminotransferase  27.95 
 
 		 299 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.595721  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5238  4-amino-4-deoxychorismate lyase  31 
 
 		 290 aa  92.4  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127403 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1965  branched-chain amino acid aminotransferase  27.95 
 
 		 299 aa  92.8  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1140  branched-chain amino acid aminotransferase  28.15 
 
 		 288 aa  92.4  6e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.817897  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2801  branched-chain amino acid aminotransferase  28.15 
 
 		 288 aa  92.4  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.581296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1137  branched-chain amino acid aminotransferase  30.83 
 
 		 286 aa  92  7e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1364  branched-chain amino acid aminotransferase  32.56 
 
 		 295 aa  92  7e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000849481  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2926  branched-chain amino acid aminotransferase  26.77 
 
 		 288 aa  91.7  9e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.458427  normal  0.684158 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3086  D-amino acid aminotransferase  31.92 
 
 		 291 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10616  hitchhiker  0.00000000000000346975 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1546  branched-chain amino acid aminotransferase  31.87 
 
 		 287 aa  90.5  2e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.452382  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0078  4-amino-4-deoxychorismate lyase  31.6 
 
 		 290 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.199927  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3057  branched chain amino acid aminotransferase  25.56 
 
 		 282 aa  90.9  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000762588 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0588  branched-chain amino acid aminotransferase  30.77 
 
 		 293 aa  90.5  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000572339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2602  branched-chain amino acid aminotransferase  27.61 
 
 		 289 aa  90.5  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.647835 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0723  branched-chain amino acid aminotransferase  28.63 
 
 		 288 aa  90.5  2e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.863889 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2238  D-amino acid aminotransferase  31.92 
 
 		 291 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0579393  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1280  branched-chain amino acid aminotransferase  29.64 
 
 		 298 aa  90.1  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.668596  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1307  branched-chain amino acid aminotransferase  29.64 
 
 		 298 aa  89.7  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.898461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1281  branched-chain amino acid aminotransferase  29.64 
 
 		 298 aa  89.7  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00322304  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1416  branched-chain amino acid aminotransferase  29.64 
 
 		 298 aa  89.7  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.493343  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1487  branched-chain amino acid aminotransferase  29.64 
 
 		 298 aa  89.7  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1516  branched-chain amino acid aminotransferase  29.64 
 
 		 298 aa  89.4  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1555  branched-chain amino acid aminotransferase  29.64 
 
 		 298 aa  89.4  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.285962  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2140  branched-chain amino acid aminotransferase  28.14 
 
 		 322 aa  89  6e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0846884  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1099  branched-chain amino acid aminotransferase  29.58 
 
 		 307 aa  89  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2285  D-amino acid aminotransferase  30.43 
 
 		 291 aa  89  7e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0817941  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3895  branched-chain amino acid aminotransferase  29.64 
 
 		 298 aa  89  7e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3547  branched-chain amino acid aminotransferase  29.81 
 
 		 311 aa  89  7e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1449  branched-chain amino acid aminotransferase  29.64 
 
 		 298 aa  89  7e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0221  branched-chain amino acid aminotransferase  29.18 
 
 		 297 aa  87.8  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000534273  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2366  D-amino acid aminotransferase  30.43 
 
 		 291 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00514849  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3367  Branched-chain-amino-acid transaminase  26.05 
 
 		 291 aa  88.2  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.118271 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1655  D-amino acid aminotransferase  31.03 
 
 		 291 aa  87.8  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0405674  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0009  branched-chain amino acid aminotransferase  31.98 
 
 		 306 aa  87.4  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2046  aminotransferase class IV  30.13 
 
 		 274 aa  87.4  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0165127  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2148  branched-chain amino acid aminotransferase  26.72 
 
 		 292 aa  87.4  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0066  4-amino-4-deoxychorismate lyase  27.8 
 
 		 285 aa  86.7  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1318  branched-chain amino acid aminotransferase  28.97 
 
 		 298 aa  86.7  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0438396  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2039  D-amino acid aminotransferase  29.25 
 
 		 291 aa  85.9  5e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000658861  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1615  branched-chain amino acid aminotransferase  28.19 
 
 		 290 aa  86.3  5e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0066  4-amino-4-deoxychorismate lyase  31.58 
 
 		 290 aa  86.3  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0351  branched-chain amino acid aminotransferase  27.34 
 
 		 293 aa  85.9  5e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.544925  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0616  aminotransferase, class IV  29.46 
 
 		 252 aa  85.9  5e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.27072  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2281  D-amino acid aminotransferase  29.25 
 
 		 291 aa  85.9  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.3532299999999998e-35 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2100  D-amino acid aminotransferase  29.25 
 
 		 291 aa  85.9  6e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0135621  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2256  D-amino acid aminotransferase  29.25 
 
 		 291 aa  85.9  6e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.162413  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2260  branched-chain amino acid aminotransferase  28.57 
 
 		 292 aa  85.9  6e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.576365 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4079  branched-chain amino acid aminotransferase  24.72 
 
 		 294 aa  85.9  6e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.445103 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2488  aminotransferase class IV  26.12 
 
 		 284 aa  84.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2037  D-amino acid aminotransferase  28.85 
 
 		 291 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00430829  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2079  D-amino acid aminotransferase  32.42 
 
 		 291 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.281204  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0094  branched-chain amino acid aminotransferase  26.92 
 
 		 288 aa  84.7  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1646  branched-chain amino acid aminotransferase  28.21 
 
 		 296 aa  84.3  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1421  branched-chain amino acid aminotransferase  28.02 
 
 		 347 aa  83.6  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0222648 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1735  branched-chain amino acid aminotransferase  28.51 
 
 		 289 aa  84  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_9  branched-chain amino acid aminotransferase  32.26 
 
 		 306 aa  84  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0672  branched-chain amino acid aminotransferase  29.44 
 
 		 297 aa  83.6  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0850  branched-chain amino acid aminotransferase  26.59 
 
 		 299 aa  83.6  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.169673  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1039  branched-chain amino acid aminotransferase  26.78 
 
 		 320 aa  82.8  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3301  branched-chain amino acid aminotransferase  26.64 
 
 		 289 aa  82.8  0.000000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2654  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / branched chain amino acid aminotransferase  31.54 
 
 		 307 aa  82.4  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2744  aminotransferase class IV  34.88 
 
 		 307 aa  82.4  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.549293  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0071  4-amino-4-deoxychorismate lyase  28.7 
 
 		 290 aa  82  0.000000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2099  branched-chain amino acid aminotransferase  28.29 
 
 		 291 aa  81.6  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1543  branched-chain amino acid aminotransferase  28.03 
 
 		 292 aa  81.6  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1109  branched-chain amino acid aminotransferase  28.07 
 
 		 312 aa  80.5  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.00000000000646452  normal  0.0889333 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3631  branched chain amino acid aminotransferase / branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  28.57 
 
 		 308 aa  80.9  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.331322 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1545  aminotransferase class IV  28.81 
 
 		 298 aa  81.3  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0009  branched-chain amino acid aminotransferase  31.05 
 
 		 306 aa  79.7  0.00000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7270  branched-chain amino acid aminotransferase  26.39 
 
 		 295 aa  79.7  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1228  branched-chain amino acid aminotransferase  30.54 
 
 		 302 aa  79.7  0.00000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000631212  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2839  aminotransferase class IV  32.21 
 
 		 307 aa  79.7  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0464301  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>