43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0962 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0962  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 290 aa  604  9.999999999999999e-173  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0033  radical SAM domain-containing protein  47.22 
 
 		 296 aa  269  5e-71  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.531209  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0705  radical SAM domain-containing protein  40.69 
 
 		 283 aa  230  2e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0681  radical SAM domain-containing protein  41.38 
 
 		 283 aa  225  6e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0912  radical SAM domain-containing protein  40 
 
 		 295 aa  196  4.0000000000000005e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1520  Radical SAM domain protein  34.42 
 
 		 310 aa  163  4.0000000000000004e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1508  radical SAM domain-containing protein  31.82 
 
 		 266 aa  153  4e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0919  Radical SAM domain protein  32.97 
 
 		 308 aa  143  3e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000116556  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0445  radical SAM family protein  27.64 
 
 		 349 aa  122  5e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1558  radical SAM domain-containing protein  28.52 
 
 		 355 aa  115  1.0000000000000001e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0417812 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0592  Radical SAM domain protein  25.36 
 
 		 371 aa  109  5e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000649486  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2088  Radical SAM domain protein  28.03 
 
 		 351 aa  107  2e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1052  Radical SAM domain protein  25.98 
 
 		 366 aa  100  3e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2543  radical SAM domain protein  23.4 
 
 		 378 aa  97.8  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2171  Radical SAM domain protein  23.4 
 
 		 378 aa  97.8  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00159358  decreased coverage  0.000000000651126 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2204  radical SAM domain protein  22.57 
 
 		 383 aa  92  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0644  Radical SAM domain protein  20.83 
 
 		 390 aa  86.7  5e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.14053  normal  0.0928811 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2053  biotin synthase  23.94 
 
 		 328 aa  50.4  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2164  biotin synthase  23.94 
 
 		 328 aa  49.7  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1978  biotin synthase  21.97 
 
 		 338 aa  49.7  0.00006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2714  Radical SAM domain protein  28.57 
 
 		 356 aa  48.9  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3477  hypothetical protein  27.62 
 
 		 359 aa  48.9  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0183  lipoyl synthase  25.28 
 
 		 306 aa  47.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.604682  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1409  hypothetical protein  28.57 
 
 		 356 aa  48.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0682  biotin synthase  22.97 
 
 		 334 aa  47.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0107  biotin synthase  19.23 
 
 		 344 aa  46.2  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.156568  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1109  Elongator protein 3/MiaB/NifB  28 
 
 		 362 aa  46.2  0.0007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.370435 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0604  biotin synthase  23.36 
 
 		 333 aa  45.1  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1175  biotin synthase  25.23 
 
 		 328 aa  45.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0717742  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2647  biotin synthase  25 
 
 		 351 aa  45.4  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000036845  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0464  biotin synthetase  24.19 
 
 		 330 aa  44.7  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7577  Biotin synthase-related enzyme  18.04 
 
 		 323 aa  44.3  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.146272  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0217  lipoyl synthase  24.87 
 
 		 334 aa  44.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4750  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 379 aa  44.3  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2103  radical SAM domain-containing protein  27.72 
 
 		 362 aa  43.9  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.938739  normal  0.248825 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0838  Elongator protein 3/MiaB/NifB  19.61 
 
 		 365 aa  43.9  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.195743  normal  0.168484 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2168  biotin synthase  21.15 
 
 		 335 aa  44.3  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.444037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4562  radical SAM domain-containing protein  26.53 
 
 		 360 aa  43.5  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.343645  normal  0.720303 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13141  hypothetical protein  22.73 
 
 		 362 aa  43.5  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0841  biotin synthase  25.24 
 
 		 344 aa  43.1  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0057  Radical SAM domain protein  27 
 
 		 367 aa  43.1  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.615692  normal  0.0888986 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0631  radical SAM domain-containing protein  20.8 
 
 		 314 aa  42.7  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0187035  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0242  lipoyl synthase  24.08 
 
 		 332 aa  42.7  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>