59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0957 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0957  hypothetical protein  100 
 
 		 254 aa  509  1e-143  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1997  hypothetical protein  38.82 
 
 		 261 aa  149  4e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000736742  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1996  protein of unknown function DUF541  36.63 
 
 		 246 aa  144  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.278766 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0472  protein of unknown function DUF541  35.04 
 
 		 244 aa  144  1e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000443999  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0370  putative periplasmic protein  35.97 
 
 		 260 aa  136  4e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04361  periplasmic protein  35.97 
 
 		 260 aa  135  6.0000000000000005e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0399272  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1567  hypothetical protein  34.3 
 
 		 246 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04251  periplasmic protein  35.18 
 
 		 260 aa  133  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17101  periplasmic protein  32.26 
 
 		 259 aa  127  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.689704 
 
 
-
 
NC_002950  PG0356  hypothetical protein  31.87 
 
 		 260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.187061 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2326  hypothetical protein  34.05 
 
 		 250 aa  116  3e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10868  hypothetical protein  29.22 
 
 		 242 aa  107  1e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1796  hypothetical protein  29.41 
 
 		 249 aa  97.8  1e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.193183  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1832  hypothetical protein  29.41 
 
 		 249 aa  97.8  1e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2255  protein of unknown function DUF541  27.69 
 
 		 238 aa  80.5  0.00000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0374125  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1140  hypothetical protein  27.56 
 
 		 241 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.114572 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0525  hypothetical protein  25.65 
 
 		 241 aa  65.9  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.426488  normal  0.0754297 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1109  hypothetical protein  25.85 
 
 		 262 aa  65.5  0.0000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2154  hypothetical protein  26.79 
 
 		 239 aa  63.9  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1910  protein of unknown function DUF541  27.4 
 
 		 239 aa  64.3  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3101  hypothetical protein  26.51 
 
 		 238 aa  62.8  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0087  hypothetical protein  25.12 
 
 		 239 aa  62.8  0.000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1426  hypothetical protein  26.09 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.174066 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3473  hypothetical protein  24.04 
 
 		 236 aa  62  0.000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0048  hypothetical protein  26.92 
 
 		 253 aa  60.8  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.411196  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1748  hypothetical protein  24.88 
 
 		 232 aa  60.5  0.00000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1448  hypothetical protein  24.54 
 
 		 250 aa  59.7  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000347149  unclonable  0.0000000000712925 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1460  hypothetical protein  25.12 
 
 		 238 aa  59.3  0.00000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000634241  unclonable  0.0000276255 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1395  hypothetical protein  25.12 
 
 		 238 aa  59.3  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000811634  unclonable  0.0000000000143355 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00837  hypothetical protein  22.79 
 
 		 239 aa  58.9  0.00000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2438  hypothetical protein  26.92 
 
 		 236 aa  58.9  0.00000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000355318  hitchhiker  0.00106606 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2472  hypothetical protein  26.87 
 
 		 238 aa  58.5  0.00000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000142  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0072  hypothetical protein  25.96 
 
 		 233 aa  58.5  0.00000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0108792  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2773  hypothetical protein  25.48 
 
 		 238 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000968246  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1585  protein of unknown function DUF541  25.46 
 
 		 238 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000124406  hitchhiker  0.000000000106275 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2868  hypothetical protein  25.46 
 
 		 238 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000991605  normal  0.689534 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2793  hypothetical protein  25 
 
 		 238 aa  57  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000363399  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0033  hypothetical protein  25.59 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001628  putative periplasmic protein  22.33 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2778  hypothetical protein  27.33 
 
 		 240 aa  54.3  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0418246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2104  hypothetical protein  23.19 
 
 		 239 aa  53.9  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2180  hypothetical protein  23.47 
 
 		 238 aa  53.5  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000267555  normal  0.0119048 
 
 
-
 
NC_011778  BbuZS7_K09  hypothetical protein  26.55 
 
 		 231 aa  52.8  0.000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.000018961  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2487  hypothetical protein  23.64 
 
 		 236 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.375164 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1305  hypothetical protein  25.63 
 
 		 251 aa  50.4  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.706284  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2109  protein of unknown function DUF541  22.75 
 
 		 228 aa  50.4  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.184422 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2301  hypothetical protein  22.86 
 
 		 238 aa  50.1  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1932  hypothetical protein  23.36 
 
 		 281 aa  49.7  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.828306  normal  0.011783 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1616  hypothetical protein  24.64 
 
 		 238 aa  48.9  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000200247  decreased coverage  0.000000163604 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0569  protein of unknown function DUF541  22.22 
 
 		 241 aa  48.9  0.00007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0339808  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0217  hypothetical protein  27.08 
 
 		 237 aa  48.9  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.330993  hitchhiker  0.00697303 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2321  hypothetical protein  23.89 
 
 		 251 aa  48.5  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00571862 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1293  outer membrane protein  27.5 
 
 		 251 aa  48.1  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.269819 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1759  protein of unknown function DUF541  28.66 
 
 		 236 aa  47.4  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.339895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3577  hypothetical protein  27.81 
 
 		 239 aa  47  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3039  hypothetical protein  24.29 
 
 		 238 aa  45.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0172868  normal  0.01799 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2412  hypothetical protein  21.28 
 
 		 245 aa  44.7  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.377805  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0965  26 kDa periplasmic immunogenic protein  26.46 
 
 		 248 aa  44.3  0.002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.152524  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1869  hypothetical protein  26.8 
 
 		 247 aa  44.3  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>