47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0941 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0941  CRISPR-associated Cas4 family protein  100 
 
 		 163 aa  334  2.9999999999999997e-91  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2660  CRISPR-associated protein Cas4  55.76 
 
 		 185 aa  207  7e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0309  CRISPR-associated protein Cas4  51.53 
 
 		 165 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2318  CRISPR-associated Cas4 family protein  51.23 
 
 		 165 aa  171  2.9999999999999996e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2517  hypothetical protein  51.85 
 
 		 168 aa  170  7.999999999999999e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0540  CRISPR-associated Cas4 family protein  49.07 
 
 		 168 aa  166  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1187  CRISPR-associated protein Cas4  50.31 
 
 		 169 aa  165  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3932  CRISPR-associated protein Cas4  47.85 
 
 		 169 aa  160  8.000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4287  CRISPR-associated protein Cas4  47.56 
 
 		 169 aa  159  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2298  CRISPR-associated Cas4 family protein  50.93 
 
 		 170 aa  157  8e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0976  CRISPR-associated protein Cas4  38.51 
 
 		 177 aa  141  4e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2429  CRISPR-associated protein Cas4  37.89 
 
 		 165 aa  140  7e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0620  CRISPR-associated protein Cas4  44.44 
 
 		 168 aa  131  3e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0266  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  34.16 
 
 		 162 aa  127  8.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1812  CRISPR-associated Cas4 family protein  34.78 
 
 		 178 aa  126  1.0000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.233304  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0672  CRISPR-associated protein Cas4  40.49 
 
 		 169 aa  124  7e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1878  CRISPR-associated Cas4 family protein  37.2 
 
 		 170 aa  119  1.9999999999999998e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0126  CRISPR-associated protein Cas4  36.25 
 
 		 171 aa  114  7.999999999999999e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2023  CRISPR-associated Cas4 family protein  35.8 
 
 		 165 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.84369  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0664  CRISPR-associated protein Cas4  36.53 
 
 		 161 aa  108  2.0000000000000002e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0807388  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1423  CRISPR-associated protein Cas4  37.74 
 
 		 166 aa  108  3e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.283584  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0349  CRISPR-associated Cas4 family protein  33.54 
 
 		 158 aa  107  5e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.177576  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1083  CRISPR-associated Cas4 family protein  36.14 
 
 		 172 aa  107  7.000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1638  CRISPR-associated protein Cas4  32.97 
 
 		 180 aa  106  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.270939  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0302  hypothetical protein  35.62 
 
 		 199 aa  106  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00784243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1022  CRISPR-associated Cas4 family protein  36.81 
 
 		 159 aa  104  5e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1289  CRISPR-associated protein Cas4  36.25 
 
 		 165 aa  102  3e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1126  CRISPR-associated Cas4 family protein  33.13 
 
 		 199 aa  102  3e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00956788  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0447  CRISPR-associated protein Cas4  36.42 
 
 		 166 aa  100  1e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1728  CRISPR-associated Cas4 family protein  32.32 
 
 		 177 aa  99.8  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.855022 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2004  CRISPR-associated protein Cas4  33.74 
 
 		 165 aa  99.4  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0918  CRISPR-associated protein Cas4  35.58 
 
 		 162 aa  97.1  8e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000176613 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3328  CRISPR-associated protein Cas4  32.72 
 
 		 189 aa  97.4  8e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1020  CRISPR-associated protein Cas4  33.74 
 
 		 161 aa  97.1  9e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000334057  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0902  CRISPR-associated protein Cas4  33.73 
 
 		 163 aa  96.7  1e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.057649  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2837  CRISPR-associated protein Cas4  29.19 
 
 		 186 aa  91.3  5e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.679978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1450  CRISPR-associated protein Cas4  32.1 
 
 		 192 aa  87.4  7e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2015  CRISPR-associated Cas4 family protein  35.76 
 
 		 170 aa  87  9e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3001  CRISPR-associated protein Cas4  31.93 
 
 		 162 aa  87  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0454064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0914  CRISPR-associated Cas4 family protein  30.12 
 
 		 173 aa  86.7  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0131013  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0395  CRISPR-associated protein Cas4  39.1 
 
 		 127 aa  85.9  2e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0424779  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1229  CRISPR-associated protein Cas4  32.92 
 
 		 167 aa  83.6  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1804  RecB family exonuclease  36.36 
 
 		 162 aa  79  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0936  CRISPR-associated protein Cas4  25.93 
 
 		 169 aa  78.6  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1000  hypothetical protein  23.31 
 
 		 172 aa  70.1  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1391  hypothetical protein  24.07 
 
 		 171 aa  58.2  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.268781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1722  CRISPR-associated Cas4 family protein  28.89 
 
 		 218 aa  42.4  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.523221 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>