More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0907 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0907  methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 		 310 aa  629  1e-179  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000822843  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0236  methionyl-tRNA formyltransferase  58.82 
 
 		 303 aa  358  8e-98  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0409  methionyl-tRNA formyltransferase  49.35 
 
 		 313 aa  287  1e-76  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0393  methionyl-tRNA formyltransferase  50.32 
 
 		 313 aa  285  5e-76  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.691189  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0050  methionyl-tRNA formyltransferase  49.84 
 
 		 319 aa  281  1e-74  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.977686  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0864  methionyl-tRNA formyltransferase  45.54 
 
 		 311 aa  236  3e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000069502  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1529  methionyl-tRNA formyltransferase  39.03 
 
 		 312 aa  221  8e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1040  methionyl-tRNA formyltransferase  42.86 
 
 		 309 aa  211  1e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0858  methionyl-tRNA formyltransferase  39.32 
 
 		 311 aa  210  3e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  38.03 
 
 		 311 aa  209  5e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0649  methionyl-tRNA formyltransferase  40.19 
 
 		 318 aa  207  2e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95229e-24 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0244  methionyl-tRNA formyltransferase  40.07 
 
 		 315 aa  206  4e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0568  methionyl-tRNA formyltransferase  38.85 
 
 		 311 aa  205  7e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000116959  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0635  methionyl-tRNA formyltransferase  40.13 
 
 		 318 aa  205  8e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0157901  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0513  methionyl-tRNA formyltransferase  37.74 
 
 		 319 aa  205  9e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.690355  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3737  methionyl-tRNA formyltransferase  38.03 
 
 		 324 aa  203  2e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219855 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0143  methionyl-tRNA formyltransferase  37.94 
 
 		 312 aa  203  4e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0856282  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1176  methionyl-tRNA formyltransferase  38.22 
 
 		 309 aa  202  6e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0139658  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0130  methionyl-tRNA formyltransferase  37.5 
 
 		 317 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0054  methionyl-tRNA formyltransferase  37.37 
 
 		 314 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0090  methionyl-tRNA formyltransferase  36.71 
 
 		 314 aa  201  1.9999999999999998e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0186427  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  38.85 
 
 		 329 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0590691 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2491  methionyl-tRNA formyltransferase  39.33 
 
 		 319 aa  200  1.9999999999999998e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2582  methionyl-tRNA formyltransferase  36.84 
 
 		 328 aa  200  1.9999999999999998e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0097642  normal  0.0138205 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2096  methionyl-tRNA formyltransferase  36.71 
 
 		 314 aa  201  1.9999999999999998e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.156857  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4512  methionyl-tRNA formyltransferase  36.36 
 
 		 314 aa  200  3e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.017466  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1755  methionyl-tRNA formyltransferase  39.37 
 
 		 310 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3225  methionyl-tRNA formyltransferase  36.72 
 
 		 313 aa  199  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0188786 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3217  methionyl-tRNA formyltransferase  39.8 
 
 		 316 aa  199  7e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.163749  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  37.29 
 
 		 315 aa  198  9e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  37.95 
 
 		 318 aa  198  9e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1439  methionyl-tRNA formyltransferase  38.61 
 
 		 314 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0597  methionyl-tRNA formyltransferase  37.15 
 
 		 309 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.411489  normal  0.365023 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1705  methionyl-tRNA formyltransferase  36.74 
 
 		 317 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3920  methionyl-tRNA formyltransferase  36.07 
 
 		 325 aa  197  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00190  methionyl-tRNA formyltransferase  37.79 
 
 		 314 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.767541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0028  methionyl-tRNA formyltransferase  37.62 
 
 		 318 aa  196  3e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.709441  hitchhiker  0.00475764 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1592  methionyl-tRNA formyltransferase  38.44 
 
 		 359 aa  196  4.0000000000000005e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1275  methionyl-tRNA formyltransferase  37.11 
 
 		 311 aa  196  5.000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1300  methionyl-tRNA formyltransferase  37.11 
 
 		 311 aa  196  5.000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.247026  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  37.29 
 
 		 318 aa  195  6e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4610  methionyl-tRNA formyltransferase  37.04 
 
 		 315 aa  196  6e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0019  methionyl-tRNA formyltransferase  36.79 
 
 		 310 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.107334  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2383  methionyl-tRNA formyltransferase  35.14 
 
 		 348 aa  195  9e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.596014  normal  0.0248257 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03138  methionyl-tRNA formyltransferase  37.04 
 
 		 315 aa  194  1e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.511897  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  37.04 
 
 		 315 aa  194  1e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0819  methionyl-tRNA formyltransferase  38.18 
 
 		 313 aa  194  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3770  methionyl-tRNA formyltransferase  36.7 
 
 		 315 aa  195  1e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0147386  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0037  methionyl-tRNA formyltransferase  38.05 
 
 		 320 aa  194  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.553222 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3672  methionyl-tRNA formyltransferase  37.04 
 
 		 315 aa  194  1e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3481  methionyl-tRNA formyltransferase  37.04 
 
 		 315 aa  194  1e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000745387  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03089  hypothetical protein  37.04 
 
 		 315 aa  194  1e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  37.04 
 
 		 315 aa  194  1e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3719  methionyl-tRNA formyltransferase  36.03 
 
 		 315 aa  195  1e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.236435  hitchhiker  0.00730816 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3604  methionyl-tRNA formyltransferase  37.71 
 
 		 315 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3676  methionyl-tRNA formyltransferase  37.71 
 
 		 315 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2313  methionyl-tRNA formyltransferase  41.53 
 
 		 312 aa  194  2e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490925  hitchhiker  0.0006759 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3603  methionyl-tRNA formyltransferase  37.71 
 
 		 315 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.109792  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3711  methionyl-tRNA formyltransferase  37.71 
 
 		 315 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.734888  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00021  methionyl-tRNA formyltransferase  36.73 
 
 		 312 aa  193  3e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1467  methionyl-tRNA formyltransferase  38.26 
 
 		 306 aa  193  3e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0397972  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3774  methionyl-tRNA formyltransferase  37.37 
 
 		 315 aa  192  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  37.97 
 
 		 318 aa  193  4e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  37.29 
 
 		 318 aa  193  4e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000257015 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  37.62 
 
 		 309 aa  192  5e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0547193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3339  methionyl-tRNA formyltransferase  36.91 
 
 		 311 aa  192  5e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.376602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0196  methionyl-tRNA formyltransferase  36.7 
 
 		 318 aa  192  5e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00869838  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3583  methionyl-tRNA formyltransferase  36.7 
 
 		 315 aa  192  6e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.291651  normal  0.0987748 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2322  methionyl-tRNA formyltransferase  36.09 
 
 		 310 aa  192  6e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.103056  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2272  methionyl-tRNA formyltransferase  36.27 
 
 		 320 aa  192  9e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00775496 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  37.79 
 
 		 321 aa  191  1e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  37.37 
 
 		 319 aa  191  1e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0943  methionyl-tRNA formyltransferase  38.23 
 
 		 326 aa  191  1e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1714  methionyl-tRNA formyltransferase  38.29 
 
 		 309 aa  191  1e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0086  methionyl-tRNA formyltransferase  37.79 
 
 		 310 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2251  hitchhiker  0.0000000986218 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  36.79 
 
 		 310 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417966  decreased coverage  0.00000000000000611556 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  37.97 
 
 		 318 aa  190  2e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1231  methionyl-tRNA formyltransferase  35.35 
 
 		 314 aa  190  2e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000178496  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0438  methionyl-tRNA formyltransferase  36.7 
 
 		 313 aa  189  4e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2084  methionyl-tRNA formyltransferase  36.36 
 
 		 311 aa  189  4e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.198796  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04056  methionyl-tRNA formyltransferase  37.66 
 
 		 307 aa  189  4e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  37.97 
 
 		 318 aa  189  4e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109779 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  37.97 
 
 		 318 aa  189  5e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000188499 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  36.45 
 
 		 310 aa  189  5e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.217446 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  38.85 
 
 		 318 aa  189  5e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  38.57 
 
 		 320 aa  188  9e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.601603  normal  0.144256 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3015  methionyl-tRNA formyltransferase  33.97 
 
 		 323 aa  188  1e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  37.63 
 
 		 318 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0067  methionyl-tRNA formyltransferase  36.45 
 
 		 310 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.196453  unclonable  0.000000439837 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2844  methionyl-tRNA formyltransferase  36.51 
 
 		 308 aa  187  2e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1572  methionyl-tRNA formyltransferase  35.12 
 
 		 332 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0094  methionyl-tRNA formyltransferase  36.36 
 
 		 320 aa  187  2e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.922112  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0898  methionyl-tRNA formyltransferase  38 
 
 		 311 aa  187  2e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.212157  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0355  methionyl-tRNA formyltransferase  36.36 
 
 		 313 aa  187  2e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.36252  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0148  methionyl-tRNA formyltransferase  38.84 
 
 		 305 aa  186  3e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.576123 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0020  methionyl-tRNA formyltransferase  37.66 
 
 		 322 aa  186  4e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2647  hypothetical protein  35.41 
 
 		 314 aa  186  5e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0036  methionyl-tRNA formyltransferase  35.09 
 
 		 327 aa  186  5e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2517  hypothetical protein  35.74 
 
 		 314 aa  186  6e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3177  methionyl-tRNA formyltransferase  42.74 
 
 		 315 aa  185  8e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000345004  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>