More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0901 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0901  queuine tRNA-ribosyltransferase  100 
 
 		 373 aa  778    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000294135  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1416  queuine tRNA-ribosyltransferase  66.12 
 
 		 367 aa  527  1e-148  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000679599  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1224  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.69 
 
 		 369 aa  442  1e-123  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.736515  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1231  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.42 
 
 		 369 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.579512  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0399  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.55 
 
 		 375 aa  406  1.0000000000000001e-112  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0382  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.97 
 
 		 357 aa  401  9.999999999999999e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2573  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.28 
 
 		 397 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1165  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.28 
 
 		 397 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.179436  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2387  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.28 
 
 		 397 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3810  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.75 
 
 		 395 aa  395  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0303  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.28 
 
 		 397 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3361  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.01 
 
 		 472 aa  396  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0872044  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2808  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.92 
 
 		 376 aa  392  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.634866  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3371  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.01 
 
 		 397 aa  393  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0637  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.75 
 
 		 395 aa  394  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1278  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.3 
 
 		 394 aa  392  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0690  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.2 
 
 		 395 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.265074  normal  0.561084 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3328  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.28 
 
 		 397 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.162119  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2664  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.02 
 
 		 399 aa  394  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.241217 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0238  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.2 
 
 		 447 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0722  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.2 
 
 		 395 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1259  queuine tRNA-ribosyltransferase  50 
 
 		 379 aa  391  1e-107  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3990  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.92 
 
 		 396 aa  389  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.259551 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2944  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.2 
 
 		 376 aa  389  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.765199 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0699  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.47 
 
 		 404 aa  389  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0612  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.47 
 
 		 395 aa  391  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.895388  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0958  queuine tRNA-ribosyltransferase  50 
 
 		 374 aa  390  1e-107  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0452051  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2525  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.92 
 
 		 400 aa  385  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1729  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.14 
 
 		 379 aa  386  1e-106  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37523  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1457  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.05 
 
 		 375 aa  385  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000844701  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1696  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.14 
 
 		 379 aa  386  1e-106  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3622  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.58 
 
 		 372 aa  387  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00110996  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3407  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.14 
 
 		 370 aa  378  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.38542  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12290  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.45 
 
 		 373 aa  379  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000356741  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1428  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.83 
 
 		 369 aa  379  1e-104  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00175971  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1410  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.08 
 
 		 362 aa  375  1e-103  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1120  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.23 
 
 		 369 aa  378  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0231453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0907  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.05 
 
 		 372 aa  376  1e-103  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0530  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.34 
 
 		 373 aa  376  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00176978  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1666  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.71 
 
 		 370 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.098612  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3733  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.59 
 
 		 375 aa  376  1e-103  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.812012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1694  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.14 
 
 		 373 aa  376  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.556038 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1203  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.78 
 
 		 379 aa  374  1e-102  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.261953  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3278  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.76 
 
 		 369 aa  372  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.275264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0514  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.96 
 
 		 370 aa  371  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1470  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.3 
 
 		 377 aa  370  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00097364  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4264  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.61 
 
 		 379 aa  371  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000851523  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4502  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.07 
 
 		 379 aa  369  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000575969  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4312  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.07 
 
 		 379 aa  369  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000048864  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4150  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.07 
 
 		 379 aa  369  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000148017  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4161  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.07 
 
 		 379 aa  369  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000310592  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2075  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.88 
 
 		 367 aa  370  1e-101  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.698983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0699  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.34 
 
 		 379 aa  370  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000227158  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3097  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.74 
 
 		 387 aa  368  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.141745  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4647  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.07 
 
 		 379 aa  369  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000256565  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1791  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.45 
 
 		 370 aa  371  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000378979  hitchhiker  0.00274251 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4497  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.07 
 
 		 379 aa  369  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000628432 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2518  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.72 
 
 		 380 aa  371  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00624233  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4536  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.34 
 
 		 379 aa  370  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000578318  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4551  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.07 
 
 		 379 aa  369  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000170513  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3134  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.53 
 
 		 379 aa  369  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.212476  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5071  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.22 
 
 		 399 aa  368  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.906893  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0930  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.72 
 
 		 380 aa  370  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2619  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.09 
 
 		 373 aa  367  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1019  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.02 
 
 		 381 aa  367  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1120  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.88 
 
 		 385 aa  365  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.38532  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1567  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.64 
 
 		 390 aa  365  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.841551 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0852  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.21 
 
 		 370 aa  368  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1401  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.3 
 
 		 377 aa  365  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000397481  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3520  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.28 
 
 		 377 aa  366  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1241  normal  0.323798 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1382  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.47 
 
 		 374 aa  365  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000246245  hitchhiker  0.0000118913 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1447  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.47 
 
 		 374 aa  365  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000328041  normal  0.0357414 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1435  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.47 
 
 		 374 aa  365  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000652098  hitchhiker  0.000858372 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2193  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.02 
 
 		 374 aa  368  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0616046  normal  0.0257357 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0320  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.27 
 
 		 387 aa  364  1e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0464887 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3291  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.74 
 
 		 381 aa  364  1e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1524  queuine tRNA-ribosyltransferase  51 
 
 		 383 aa  363  2e-99  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000558338  normal  0.0203734 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2906  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.15 
 
 		 387 aa  364  2e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.905549  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00354  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.3 
 
 		 375 aa  363  3e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.520405  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3203  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.3 
 
 		 375 aa  363  3e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.372376  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3227  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.3 
 
 		 375 aa  363  3e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000187089 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0438  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.3 
 
 		 375 aa  363  3e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0436  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.3 
 
 		 375 aa  363  3e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1703  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.28 
 
 		 383 aa  363  3e-99  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108277  normal  0.62465 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0476  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.3 
 
 		 375 aa  363  3e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0325  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.3 
 
 		 375 aa  363  3e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00358  hypothetical protein  49.3 
 
 		 375 aa  363  3e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.575633  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0486  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.3 
 
 		 375 aa  363  3e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2892  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.18 
 
 		 377 aa  362  4e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.103545  hitchhiker  0.000645764 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2484  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.74 
 
 		 374 aa  363  4e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000574895  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0451  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.74 
 
 		 375 aa  362  5.0000000000000005e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0945287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0505  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.74 
 
 		 375 aa  362  5.0000000000000005e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0444  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.74 
 
 		 375 aa  362  5.0000000000000005e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0464  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.74 
 
 		 375 aa  362  5.0000000000000005e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.992026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2214  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.18 
 
 		 374 aa  362  5.0000000000000005e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00238944  normal  0.155586 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2011  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.78 
 
 		 380 aa  362  6e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.638578  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1800  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.99 
 
 		 374 aa  362  6e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0681  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.72 
 
 		 370 aa  362  8e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.111123  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0445  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.46 
 
 		 375 aa  362  8e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1359  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.59 
 
 		 372 aa  361  9e-99  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000569759  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>