73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0881 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0881  hypothetical protein  100 
 
 
462 aa  921    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000540176  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1534  hypothetical protein  46.97 
 
 
456 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.196772  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0194  hypothetical protein  39.22 
 
 
455 aa  298  9e-80  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0192  hypothetical protein  40.17 
 
 
455 aa  294  2e-78  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1231  hypothetical protein  33.88 
 
 
462 aa  214  2.9999999999999995e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1663  hypothetical protein  36.39 
 
 
459 aa  212  1e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000175912  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0498  hypothetical protein  30.42 
 
 
542 aa  193  6e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.578621  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2021  protein of unknown function DUF342  29.09 
 
 
463 aa  192  1e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2682  hypothetical protein  28.3 
 
 
656 aa  186  7e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.254687  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1423  protein of unknown function DUF342  29.98 
 
 
622 aa  182  1e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000579847  normal  0.370296 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16620  predicted polymerase, contains PALM domain, HD hydrolase domain and Zn-ribbon domain  28.48 
 
 
611 aa  175  1.9999999999999998e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2143  protein of unknown function DUF342  27.99 
 
 
461 aa  170  4e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0160634  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2246  protein of unknown function DUF342  32.8 
 
 
520 aa  164  3e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0879  hypothetical protein  29.66 
 
 
467 aa  162  1e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00425584  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1511  hypothetical protein  31.05 
 
 
527 aa  152  1e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0473  hypothetical protein  27.04 
 
 
467 aa  150  6e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2684  hypothetical protein  27.99 
 
 
532 aa  147  5e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1305  protein of unknown function DUF342  26 
 
 
530 aa  145  2e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.431943  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0512  hypothetical protein  26.36 
 
 
546 aa  143  8e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0176  protein of unknown function DUF342  27.35 
 
 
660 aa  142  9e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000513292  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3025  hypothetical protein  27.91 
 
 
546 aa  140  6e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.487513  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2234  hypothetical protein  28.73 
 
 
484 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.260747  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2410  hypothetical protein  34.46 
 
 
530 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0657  hypothetical protein  33.66 
 
 
509 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3642  hypothetical protein  26.91 
 
 
544 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000393022  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1534  polymerase  30.45 
 
 
629 aa  123  8e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.451593  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3231  hypothetical protein  26.55 
 
 
556 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0090  protein of unknown function DUF342  27.87 
 
 
565 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1695  hypothetical protein  25.68 
 
 
562 aa  113  6e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0219  protein of unknown function DUF342  25 
 
 
501 aa  113  7.000000000000001e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.102298  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0671  protein of unknown function DUF342  27.68 
 
 
545 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.38243e-32 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0539  hypothetical protein  26.99 
 
 
555 aa  107  3e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0273  hypothetical protein  26.8 
 
 
634 aa  107  4e-22  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1709  hypothetical protein  27.03 
 
 
534 aa  107  6e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3178  hypothetical protein  32.03 
 
 
529 aa  106  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3165  hypothetical protein  25.12 
 
 
562 aa  105  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0596  hypothetical protein  24.5 
 
 
554 aa  103  8e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1361  polymerase  24.47 
 
 
653 aa  101  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4141  hypothetical protein  23.02 
 
 
556 aa  101  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.5265 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0028  protein of unknown function DUF342  25.96 
 
 
525 aa  100  4e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0389  protein of unknown function DUF342  27.62 
 
 
578 aa  100  4e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3684  hypothetical protein  26.46 
 
 
562 aa  100  6e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3979  hypothetical protein  24.46 
 
 
556 aa  99.4  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0805  hypothetical protein  25.65 
 
 
562 aa  98.2  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2978  hypothetical protein  26.88 
 
 
555 aa  98.2  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0830  protein of unknown function DUF342  25.65 
 
 
562 aa  97.8  4e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000204321 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0837  hypothetical protein  25.65 
 
 
562 aa  97.4  5e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3531  hypothetical protein  25.65 
 
 
562 aa  96.7  9e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0823  hypothetical protein  30.66 
 
 
691 aa  94  6e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00604121  normal  0.0176105 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0826  hypothetical protein  24.94 
 
 
563 aa  93.6  7e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3451  hypothetical protein  23.75 
 
 
563 aa  92  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0113855 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0674  hypothetical protein  23.75 
 
 
563 aa  92.4  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0199689 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3273  hypothetical protein  23.75 
 
 
563 aa  92.4  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00316716 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0452  protein of unknown function DUF342  30.57 
 
 
603 aa  91.3  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0568  hypothetical protein  24.61 
 
 
556 aa  90.5  6e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.235837 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0394  hypothetical protein  30.09 
 
 
543 aa  89.7  9e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000249945  normal  0.153411 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1398  hypothetical protein  24.16 
 
 
728 aa  86.7  9e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4099  protein of unknown function DUF342  40.68 
 
 
598 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000308473  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0158  hypothetical protein  26.97 
 
 
556 aa  85.1  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02406  hypothetical protein  22.9 
 
 
551 aa  83.6  0.000000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.122562  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0872  hypothetical protein  22.71 
 
 
541 aa  79.7  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0262539  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2173  hypothetical protein  23.57 
 
 
552 aa  79  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.819375  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1859  hypothetical protein  29.11 
 
 
603 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1718  hypothetical protein  23.1 
 
 
371 aa  76.6  0.0000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0679747  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07053  hypothetical protein  22.06 
 
 
566 aa  74.7  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0429  hypothetical protein  26.69 
 
 
574 aa  74.3  0.000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0010  hypothetical protein  24.07 
 
 
547 aa  73.9  0.000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.736924  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0251  protein of unknown function DUF342  27.98 
 
 
381 aa  72.8  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0226778 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2455  hypothetical protein  22.73 
 
 
538 aa  70.9  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000996  predicted polymerase  21.58 
 
 
559 aa  68.9  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.717686  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2318  hypothetical protein  22.22 
 
 
371 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00575561 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1256  protein of unknown function DUF342  22.71 
 
 
378 aa  54.7  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.912515  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1631  hypothetical protein  22.95 
 
 
378 aa  53.9  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.83823  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>