80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0849 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0849  preprotein translocase, SecE subunit  100 
 
 		 63 aa  122  2e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000235049  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0640  preprotein translocase, SecE subunit  62.9 
 
 		 62 aa  82  0.000000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000226614  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0483  preprotein translocase, SecE subunit  58.33 
 
 		 65 aa  76.6  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000407474  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0468  preprotein translocase, SecE subunit  58.33 
 
 		 65 aa  76.6  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000605579  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0179  preprotein translocase, SecE subunit  40.98 
 
 		 63 aa  57  0.00000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000111498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1026  preprotein translocase, SecE subunit  53.49 
 
 		 64 aa  52.8  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1333  preprotein translocase subunit SecE  44.23 
 
 		 60 aa  52.8  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0318216  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0361  preprotein translocase, SecE subunit  54.17 
 
 		 72 aa  51.6  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000000871663  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2348  preprotein translocase subunit SecE  44.26 
 
 		 80 aa  51.2  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00842063  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1543  preprotein translocase, SecE subunit  47.92 
 
 		 115 aa  49.7  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.273014  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0696  preprotein translocase, SecE subunit  45.45 
 
 		 130 aa  50.1  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00247694  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2078  preprotein translocase, SecE subunit  43.86 
 
 		 82 aa  48.9  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0834  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  32.2 
 
 		 63 aa  48.5  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00337314  normal  0.0903052 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1320  preprotein translocase, SecE subunit  42.55 
 
 		 76 aa  48.1  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4015  preprotein translocase subunit SecE  42.55 
 
 		 83 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0367352  hitchhiker  0.00000028669 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0437  preprotein translocase, SecE subunit  45.1 
 
 		 160 aa  47.4  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0741  preprotein translocase, SecE subunit  34.55 
 
 		 81 aa  46.6  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0155553 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2869  preprotein translocase subunit SecE  39.62 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.07093  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0351  preprotein translocase subunit SecE  35.59 
 
 		 63 aa  45.8  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000000092456  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2168  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  41.67 
 
 		 86 aa  45.1  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.124432  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0267  preprotein translocase subunit SecE  43.48 
 
 		 74 aa  45.4  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00826635  normal  0.0562332 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0853  preprotein translocase, SecE subunit  38.64 
 
 		 51 aa  45.1  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000244118  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1182  preprotein translocase subunit SecE  36.73 
 
 		 72 aa  44.7  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00132443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0227  preprotein translocase subunit SecE  36.84 
 
 		 63 aa  45.1  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0635972  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1513  preprotein translocase, SecE subunit  35 
 
 		 60 aa  43.9  0.0007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000908707  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2718  preprotein translocase, SecE subunit  38.6 
 
 		 80 aa  43.5  0.0009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00287397  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0313  preprotein translocase, SecE subunit  39.62 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.663429  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2548  preprotein translocase subunit SecE  37.5 
 
 		 64 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1042  preprotein translocase subunit SecE  38.78 
 
 		 73 aa  43.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000810239  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0092  preprotein translocase subunit SecE  42.86 
 
 		 60 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0096  preprotein translocase subunit SecE  38.78 
 
 		 60 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000178196  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0089  preprotein translocase subunit SecE  34.48 
 
 		 59 aa  43.5  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000139585  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0484  preprotein translocase, SecE subunit  39.62 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00122537  hitchhiker  0.00000162097 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2685  preprotein translocase subunit SecE  36.84 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000176795  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1493  preprotein translocase, SecE subunit  32.79 
 
 		 63 aa  43.5  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.394674  normal  0.332847 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1808  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  37.04 
 
 		 85 aa  43.5  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.480842  normal  0.242423 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0091  preprotein translocase subunit SecE  35.09 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.58206e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3203  preprotein translocase subunit SecE  39.53 
 
 		 62 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0559  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  33.33 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0636  preprotein translocase subunit SecE  34 
 
 		 81 aa  43.5  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0204461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2275  preprotein translocase subunit SecE  39.53 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.39962  normal  0.730245 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0095  preprotein translocase subunit SecE  38 
 
 		 59 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000231467  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1022  preprotein translocase, SecE subunit  32.14 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0060109 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5211  preprotein translocase subunit SecE  38 
 
 		 59 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000209683  unclonable  2.82699e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0115  preprotein translocase subunit SecE  38 
 
 		 59 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000539908  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3862  preprotein translocase, SecE subunit  37.21 
 
 		 63 aa  42.4  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0603678 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0125  preprotein translocase subunit SecE  38 
 
 		 59 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000332702  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0105  preprotein translocase subunit SecE  38 
 
 		 59 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.53288e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0095  preprotein translocase subunit SecE  38 
 
 		 59 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000233788  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1102  preprotein translocase, SecE subunit  33.93 
 
 		 62 aa  42.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000145064  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0089.1  preprotein translocase subunit SecE  38 
 
 		 59 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000332974  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0095  preprotein translocase subunit SecE  38 
 
 		 59 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000184804  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0445  preprotein translocase subunit SecE  32.76 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.172809  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2688  preprotein translocase, SecE subunit  32.73 
 
 		 73 aa  42.4  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00149434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1344  preprotein translocase subunit SecE  37.21 
 
 		 63 aa  42  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.755781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2550  preprotein translocase subunit SecE  38.3 
 
 		 73 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000058162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0190  preprotein translocase subunit SecE  33.9 
 
 		 63 aa  42  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000126022  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0753  preprotein translocase subunit SecE  40.43 
 
 		 114 aa  42  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0282  preprotein translocase subunit SecE  33.9 
 
 		 63 aa  42  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000441013  hitchhiker  0.00342924 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0090  preprotein translocase subunit SecE  38 
 
 		 59 aa  42  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000140466  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3474  preprotein translocase subunit SecE  37.21 
 
 		 63 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.261673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1705  preprotein translocase subunit SecE  37.5 
 
 		 64 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.431782  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0333  preprotein translocase subunit SecE  37.5 
 
 		 64 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.06103  normal  0.779327 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1449  preprotein translocase subunit SecE  38.78 
 
 		 83 aa  41.2  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1968  preprotein translocase subunit SecE  36.84 
 
 		 63 aa  41.6  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.51744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3694  preprotein translocase subunit SecE  37.04 
 
 		 62 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2723  preprotein translocase, SecE subunit  38.3 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0148464  normal  0.502256 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0347  preprotein translocase subunit SecE  37.5 
 
 		 64 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.423362  normal  0.683866 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0831  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  38.18 
 
 		 64 aa  41.2  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3358  preprotein translocase, SecE subunit  34.88 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.234306 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1525  preprotein translocase subunit SecE  37.21 
 
 		 63 aa  41.2  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1742  preprotein translocase, SecE subunit  35.19 
 
 		 78 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1766  preprotein translocase, SecE subunit  35.19 
 
 		 78 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000113804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2990  preprotein translocase subunit SecE  40.82 
 
 		 83 aa  40.8  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2701  preprotein translocase subunit SecE  36.17 
 
 		 65 aa  40.4  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0565  preprotein translocase subunit SecE  40.48 
 
 		 67 aa  40.4  0.008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000153213  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1533  preprotein translocase, SecE subunit  35.71 
 
 		 89 aa  40  0.01  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000234675  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3341  preprotein translocase subunit SecE  34.43 
 
 		 61 aa  40  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00101417 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1341  preprotein translocase, SecE subunit  37.21 
 
 		 63 aa  40  0.01  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0600697  normal  0.152691 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0306  preprotein translocase subunit SecE  40 
 
 		 117 aa  40  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000970626  normal  0.0458537 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>