More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0800 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0800  TatD family hydrolase  100 
 
 
274 aa  555  1e-157  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0910  TatD family hydrolase  56.75 
 
 
251 aa  294  1e-78  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0264  TatD family hydrolase  47.62 
 
 
256 aa  261  8e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.281145  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0262  TatD family hydrolase  48.02 
 
 
256 aa  260  2e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0578567  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  41.76 
 
 
464 aa  216  2e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  41.18 
 
 
256 aa  209  3e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  40.15 
 
 
462 aa  206  3e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  40.86 
 
 
462 aa  204  1e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  40.62 
 
 
256 aa  202  4e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  40.39 
 
 
606 aa  202  7e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1702  TatD family hydrolase  39.37 
 
 
461 aa  201  7e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00243326  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  38.98 
 
 
458 aa  199  3e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2114  hydrolase, TatD family  40.85 
 
 
261 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  38.19 
 
 
458 aa  195  6e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  39.45 
 
 
457 aa  194  1e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  42.92 
 
 
257 aa  192  3e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0051  TatD family hydrolase  40.39 
 
 
255 aa  192  6e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.563269  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  35.97 
 
 
257 aa  187  1e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0818  TatD family hydrolase  39 
 
 
264 aa  186  4e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1010  hydrolase, TatD family  40.26 
 
 
258 aa  185  8e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0246  TatD family hydrolase  33.86 
 
 
258 aa  181  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0168  hydrolase, TatD family  38.58 
 
 
255 aa  181  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.61634  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0067  TatD family hydrolase  40.69 
 
 
255 aa  180  2e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000334455  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  36.33 
 
 
256 aa  180  2e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  35.69 
 
 
256 aa  179  4.999999999999999e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3626  TatD family hydrolase  34.6 
 
 
264 aa  177  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000292684  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0068  hydrolase, TatD family  37.97 
 
 
253 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00105138  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  37.25 
 
 
255 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  36.86 
 
 
255 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  36.86 
 
 
255 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  36.86 
 
 
255 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  36.86 
 
 
255 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  36.47 
 
 
255 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  36.86 
 
 
256 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  37.35 
 
 
255 aa  172  5e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0934  TatD family hydrolase  40 
 
 
264 aa  172  6.999999999999999e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0016009  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0042  TatD family hydrolase  37.97 
 
 
261 aa  172  6.999999999999999e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.804298  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  36.86 
 
 
255 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2095  TatD family hydrolase  36.61 
 
 
255 aa  171  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0049  TatD-related deoxyribonuclease  37.4 
 
 
256 aa  170  2e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000233797 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  36.95 
 
 
255 aa  171  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0774  hydrolase, TatD family  35.08 
 
 
271 aa  169  3e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  36.47 
 
 
255 aa  169  4e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_805  hydrolase, TatD family, Mg-dependent DNase  36.54 
 
 
264 aa  169  4e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  36.95 
 
 
255 aa  169  5e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0129  hydrolase, TatD family  37.4 
 
 
259 aa  168  8e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0130316  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0316  TatD family hydrolase  34.65 
 
 
257 aa  168  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207917  normal  0.040307 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0090  hydrolase, TatD family  34.78 
 
 
255 aa  167  2e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00880503  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0185  TatD family hydrolase  33.72 
 
 
278 aa  167  2e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  36.61 
 
 
256 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1347  TatD-related deoxyribonuclease  36.9 
 
 
268 aa  166  5e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2230  hydrolase, TatD family  30.43 
 
 
273 aa  166  5e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  36.22 
 
 
256 aa  166  5e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1315  TatD-related deoxyribonuclease  32.3 
 
 
258 aa  162  6e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288431  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2545  hydrolase, TatD family  31.91 
 
 
258 aa  162  7e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0902937  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2641  hydrolase, TatD family  31.91 
 
 
258 aa  161  9e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0861989  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  35.69 
 
 
256 aa  160  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1485  hypothetical protein  38.22 
 
 
257 aa  160  3e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.507354  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0262  hydrolase, TatD family  35.57 
 
 
251 aa  158  7e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000135646  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0525  TatD family hydrolase  36.82 
 
 
257 aa  157  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.117566  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0512  TatD family hydrolase  36.82 
 
 
257 aa  157  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.155633  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0103  TatD family hydrolase  32.83 
 
 
269 aa  157  2e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0970628  normal  0.125784 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2448  TatD family hydrolase  31.66 
 
 
259 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0109125  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1989  hydrolase, TatD family  36.63 
 
 
260 aa  156  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.727306  normal  0.0188315 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1801  hydrolase, TatD family  35.97 
 
 
260 aa  156  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.164417  normal  0.0298218 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2068  hydrolase, TatD family  35.55 
 
 
257 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3146  TatD-related deoxyribonuclease  35.04 
 
 
256 aa  155  6e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.30888  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0167  deoxyribonuclease TatD  34.98 
 
 
270 aa  154  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  32.31 
 
 
268 aa  154  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1776  hydrolase, TatD family  36.44 
 
 
263 aa  154  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2068  TatD-related deoxyribonuclease  33.2 
 
 
262 aa  153  2e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0468  hydrolase, TatD family  30.5 
 
 
264 aa  154  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.573991 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1782  TatD family deoxyribonuclease  33.2 
 
 
260 aa  152  5.9999999999999996e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0074  TatD-related deoxyribonuclease  29.53 
 
 
276 aa  152  7e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16081  TatD family deoxyribonuclease  34.32 
 
 
261 aa  152  7e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0194  hydrolase, TatD family protein  36.9 
 
 
269 aa  151  8.999999999999999e-36  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0500604  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1227  hydrolase, TatD family  35.59 
 
 
253 aa  151  1e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2718  TatD-related deoxyribonuclease  33.73 
 
 
263 aa  150  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13665  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0129  TatD family deoxyribonuclease  34.52 
 
 
256 aa  150  2e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1511  hydrolase, TatD family  37.29 
 
 
253 aa  150  2e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000902805  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0540  hydrolase, TatD family  33.33 
 
 
267 aa  150  2e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0604  TatD-related deoxyribonuclease  31.4 
 
 
262 aa  150  2e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1239  hydrolase, TatD family  36.48 
 
 
454 aa  150  2e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0964  TatD family hydrolase  35.18 
 
 
263 aa  150  2e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.913879  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0715  Mg-dependent DNase  36.13 
 
 
258 aa  150  3e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.514357  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0807  TatD-related deoxyribonuclease  33.72 
 
 
267 aa  150  3e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.333261  normal  0.0140186 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2007  TatD-related deoxyribonuclease  32.94 
 
 
263 aa  149  4e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0669101  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3117  hydrolase, TatD family  32.28 
 
 
262 aa  149  5e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0535409  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1289  TatD family hydrolase  32.56 
 
 
259 aa  149  6e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2184  hydrolase, TatD family  32.7 
 
 
263 aa  148  7e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124679  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1355  TatD family hydrolase  34.23 
 
 
271 aa  148  1.0000000000000001e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.300834  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1799  hydrolase, TatD family  34.91 
 
 
257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.339563  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1700  TatD-related deoxyribonuclease  31.47 
 
 
270 aa  147  3e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.294138  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0740  hydrolase, TatD family  34.04 
 
 
270 aa  146  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1581  hypothetical protein  33.2 
 
 
259 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1867  TatD family hydrolase  30.08 
 
 
459 aa  146  4.0000000000000006e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0284119  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1461  TatD-related deoxyribonuclease  32.94 
 
 
263 aa  145  5e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3632  hydrolase, TatD family  33.72 
 
 
262 aa  146  5e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.508824  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1533  TatD family hydrolase  33.33 
 
 
271 aa  145  6e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.714911  normal  0.473764 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1018  TatD family hydrolase  32.51 
 
 
261 aa  145  7.0000000000000006e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.195274  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>