More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0772 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0772  homocysteine S-methyltransferase  100 
 
 		 780 aa  1571    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0538889  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1792  homocysteine S-methyltransferase  51.79 
 
 		 774 aa  770    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.709712  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0682  homocysteine S-methyltransferase  44.81 
 
 		 793 aa  651    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0680  homocysteine S-methyltransferase  45.1 
 
 		 768 aa  640    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.412837  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0729  homocysteine S-methyltransferase  54.93 
 
 		 781 aa  852    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0656  homocysteine S-methyltransferase  44.72 
 
 		 768 aa  622  1e-176  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.79655  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0645  methionine synthase (B12-dependent)  36.87 
 
 		 804 aa  495  9.999999999999999e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.474097  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1211  homocysteine S-methyltransferase  37.07 
 
 		 807 aa  480  1e-134  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0179968  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0489  homocysteine S-methyltransferase  35.11 
 
 		 804 aa  478  1e-133  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3081  homocysteine S-methyltransferase  36.49 
 
 		 791 aa  476  1e-133  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2722  methionine synthase I (cobalamin-dependent) methyltransferase subunit  35.31 
 
 		 801 aa  457  1e-127  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3258  homocysteine S-methyltransferase  34 
 
 		 841 aa  458  1e-127  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.728955  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0549  methionine synthase (B12-dependent)  33.37 
 
 		 804 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2921  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  32.88 
 
 		 804 aa  450  1e-125  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0262  homocysteine S-methyltransferase  33.66 
 
 		 813 aa  450  1e-125  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00180962 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2207  homocysteine S-methyltransferase  34.5 
 
 		 800 aa  443  1e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0270016  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19590  homocysteine S-methyltransferase  34.63 
 
 		 819 aa  444  1e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.399567  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1413  homocysteine S-methyltransferase  33.91 
 
 		 806 aa  441  9.999999999999999e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0607109  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0277  homocysteine S-methyltransferase  33.54 
 
 		 811 aa  434  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.357222  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2941  homocysteine S-methyltransferase  33.38 
 
 		 801 aa  431  1e-119  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.651468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23490  methionine synthase (B12-dependent)  33.66 
 
 		 820 aa  421  1e-116  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.136684  hitchhiker  0.0000158862 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1442  homocysteine S-methyltransferase  33.29 
 
 		 802 aa  412  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.195548  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2115  methionine synthase (B12-dependent)  32.92 
 
 		 841 aa  409  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.356238  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0141  homocysteine S-methyltransferase  32.88 
 
 		 816 aa  403  1e-111  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000403798  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0476  homocysteine S-methyltransferase  33.05 
 
 		 818 aa  406  1e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0411261 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0859  homocysteine S-methyltransferase  33.46 
 
 		 804 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000329444  normal  0.146867 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1548  homocysteine S-methyltransferase  33.5 
 
 		 804 aa  402  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0662443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1442  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  30.99 
 
 		 839 aa  394  1e-108  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.955782  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1858  homocysteine S-methyltransferase  30.67 
 
 		 803 aa  374  1e-102  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1138  methionine synthase  28.79 
 
 		 1215 aa  337  3.9999999999999995e-91  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.537288  normal  0.145457 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3878  methionine synthase  28.2 
 
 		 1208 aa  328  3e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00387489  normal  0.106452 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2983  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  28.86 
 
 		 1132 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0085  methionine synthase (B12-dependent)  30.16 
 
 		 1150 aa  327  6e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.497685  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1947  methionine synthase  28.15 
 
 		 1223 aa  326  9e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0537124  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0092  methionine synthase  30.28 
 
 		 1150 aa  326  1e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0102  methionine synthase  30.16 
 
 		 1150 aa  325  3e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2544  methionine synthase  28.62 
 
 		 1180 aa  324  5e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00356448  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4156  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  28.45 
 
 		 1132 aa  322  1.9999999999999998e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4478  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  28.45 
 
 		 1132 aa  322  1.9999999999999998e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4005  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  28.45 
 
 		 1133 aa  321  3e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0087  methionine synthase  29.86 
 
 		 1149 aa  321  3e-86  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.834345  normal  0.210518 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4274  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  28.45 
 
 		 1132 aa  321  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3995  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  28.45 
 
 		 1133 aa  320  6e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0868  methionine synthase  28.64 
 
 		 1132 aa  320  7.999999999999999e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3230  methionine synthase  28.86 
 
 		 1183 aa  319  1e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4366  methionine synthase  28.45 
 
 		 1132 aa  319  1e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2881  methionine synthase  27.36 
 
 		 1168 aa  318  2e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0934972 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4332  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  28.26 
 
 		 1132 aa  318  3e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4385  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  28.09 
 
 		 1132 aa  317  4e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4108  methionine synthase  28.26 
 
 		 1132 aa  316  8e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3611  methionine synthase  28.43 
 
 		 1191 aa  312  2e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.134345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1617  homocysteine S-methyltransferase  28.27 
 
 		 1189 aa  311  2.9999999999999997e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2495  methionine synthase  28.43 
 
 		 1191 aa  311  2.9999999999999997e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2093  B12-dependent methionine synthase  29.66 
 
 		 1227 aa  310  6.999999999999999e-83  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.883808 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1372  methionine synthase (B12-dependent)  27.92 
 
 		 1190 aa  305  2.0000000000000002e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.477278 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1661  methionine synthase  27.59 
 
 		 1176 aa  304  4.0000000000000003e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.158089  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0923  putative methionine synthase  28.2 
 
 		 1188 aa  304  5.000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.554379  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27020  methionine synthase (B12-dependent)  26.95 
 
 		 1184 aa  303  6.000000000000001e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.12372  normal  0.910685 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5917  methionine synthase  27.3 
 
 		 1154 aa  302  1e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0712476  normal  0.0446229 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1854  methionine synthase  27.18 
 
 		 1154 aa  303  1e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.516902 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3282  B12-dependent methionine synthase  28.28 
 
 		 1244 aa  301  4e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1355  methionine synthase (B12-dependent)  27.61 
 
 		 1208 aa  300  5e-80  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.290102  normal  0.418289 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1073  methionine synthase (B12-dependent)  27.83 
 
 		 1197 aa  300  5e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1825  methionine synthase (B12-dependent)  28.69 
 
 		 1158 aa  300  7e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2965  B12-dependent methionine synthase  27.95 
 
 		 1244 aa  299  1e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3503  methionine synthase  27.17 
 
 		 1212 aa  300  1e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.929135  normal  0.479801 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09841  putative methionine synthase  28.26 
 
 		 1188 aa  298  2e-79  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3184  B12-dependent methionine synthase  28.17 
 
 		 1244 aa  299  2e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1549  methionine synthase  27.81 
 
 		 1156 aa  298  4e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.217391 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2492  methionine synthase (B12-dependent)  28.26 
 
 		 1224 aa  298  4e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.494606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4250  methionine synthase  28.1 
 
 		 1261 aa  297  5e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.49174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0838  B12-dependent methionine synthase  28.17 
 
 		 1244 aa  297  6e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2031  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  27.74 
 
 		 1163 aa  296  7e-79  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1894  B12-dependent methionine synthase  28.13 
 
 		 1229 aa  296  8e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3052  methionine synthase (B12-dependent)  27.42 
 
 		 1178 aa  296  9e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3690  B12-dependent methionine synthase  27.39 
 
 		 1220 aa  296  9e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12156  5-methyltetrahydrofolate-homocystein methyltransferase metH  28.34 
 
 		 1192 aa  296  9e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.726643 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2154  B12-dependent methionine synthase  28.46 
 
 		 1228 aa  296  1e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0872  B12-dependent methionine synthase  28.36 
 
 		 1238 aa  293  7e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2132  B12-dependent methionine synthase  27.73 
 
 		 1245 aa  293  1e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.638146 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1700  methionine synthase  27.68 
 
 		 1171 aa  291  3e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0182  methionine synthase  26.6 
 
 		 1263 aa  290  6e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0973  B12-dependent methionine synthase  28.15 
 
 		 1244 aa  290  6e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1007  B12-dependent methionine synthase  28.15 
 
 		 1244 aa  290  7e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2325  methionine synthase  26.86 
 
 		 1171 aa  290  7e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0940297  hitchhiker  0.00240742 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1123  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  27.09 
 
 		 1208 aa  290  7e-77  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.00712875  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2133  methionine synthase  27.04 
 
 		 1169 aa  290  7e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2292  methionine synthase  26.55 
 
 		 1157 aa  290  8e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0622799  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4088  B12-dependent methionine synthase  28.28 
 
 		 1251 aa  290  8e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.611508 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1030  B12-dependent methionine synthase  27.73 
 
 		 1244 aa  290  9e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0333  putative methionine synthase  27.65 
 
 		 1182 aa  289  1e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0707  methionine synthase  27.63 
 
 		 1136 aa  289  1e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3368  B12-dependent methionine synthase  28.04 
 
 		 1233 aa  288  2e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4499  methionine synthase  26.05 
 
 		 1173 aa  289  2e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.629663  hitchhiker  0.00843884 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1523  methionine synthase  27.53 
 
 		 1136 aa  288  2.9999999999999996e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0995  B12-dependent methionine synthase  27.93 
 
 		 1244 aa  288  4e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0391552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5287  methionine synthase  26.96 
 
 		 1266 aa  287  5.999999999999999e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2211  methionine synthase  26.28 
 
 		 1178 aa  286  7e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0650  B12-dependent methionine synthase  26.75 
 
 		 1250 aa  286  1.0000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0606  B12-dependent methionine synthase  27.75 
 
 		 1232 aa  286  1.0000000000000001e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>