More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0771 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0771  regulatory protein ArsR  100 
 
 
98 aa  194  4e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00625866  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1244  regulatory protein, ArsR  50 
 
 
109 aa  95.9  2e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0802  regulatory protein ArsR  49.44 
 
 
125 aa  92  2e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2461  transcriptional regulator, ArsR family  44.68 
 
 
118 aa  89.7  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.813526  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2588  putative cadmium resistance transcriptional regulator CadC  46.07 
 
 
119 aa  89.4  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1689  transcriptional regulator, ArsR family  49.44 
 
 
141 aa  89.7  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1741  transcriptional regulator, ArsR family  48.35 
 
 
119 aa  89.4  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.953205  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2129  ArsR family transcriptional regulator  47.83 
 
 
121 aa  87.8  4e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  3.91654e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1382  ArsR family transcriptional regulator  47.78 
 
 
117 aa  86.7  9e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0747  ArsR family transcriptional regulator  43.96 
 
 
120 aa  86.7  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2290  transcription repressor SmtB-like protein  44.94 
 
 
119 aa  86.3  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0771617  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0544  transcriptional regulator, ArsR family  48.24 
 
 
102 aa  85.9  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1161  regulatory protein, ArsR  47.19 
 
 
121 aa  85.5  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.358448  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0131  transcriptional regulator, ArsR family  47.06 
 
 
122 aa  85.5  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  5.86793e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0925  transcriptional regulator, ArsR family  40.22 
 
 
122 aa  85.1  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  9.39466e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2087  transcriptional regulator  42.7 
 
 
119 aa  84.7  4e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.570352  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0236  transcriptional regulator, ArsR family  42.7 
 
 
120 aa  84  6e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  1.6781e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0245  ArsR family transcriptional regulator  41.57 
 
 
125 aa  84  6e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22370  regulatory protein ArsR  43.01 
 
 
123 aa  84  7e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1516  transcriptional regulator, ArsR family  39.77 
 
 
111 aa  83.6  8e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  6.59197e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1408  transcriptional regulator, ArsR family  42.53 
 
 
100 aa  82.8  1e-15  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0525  regulatory protein, ArsR  41.11 
 
 
120 aa  83.2  1e-15  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.150899 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0517  transcriptional regulator, ArsR family  47.13 
 
 
122 aa  82.8  1e-15  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0769  regulatory protein, ArsR  44.94 
 
 
121 aa  82.8  1e-15  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1470  transcriptional regulator, ArsR family  42.55 
 
 
119 aa  81.3  4e-15  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.967801  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0315  transcriptional regulator, ArsR family  44.94 
 
 
125 aa  81.3  4e-15  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0516242  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0758  ArsR family transcriptional regulator  44.71 
 
 
122 aa  80.9  6e-15  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1827  transcriptional regulator, ArsR family  44.32 
 
 
93 aa  80.5  7e-15  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0470  transcriptional regulator, ArsR family  43.62 
 
 
120 aa  80.1  1e-14  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  4.66347e-06  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0432  ArsR family transcriptional regulator  42.7 
 
 
124 aa  79.3  2e-14  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.35069  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2262  transcriptional regulator, ArsR family  39.77 
 
 
119 aa  79.3  2e-14  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1755  transcriptional regulator CzrA  42.11 
 
 
113 aa  79  2e-14  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.952937  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1613  regulatory protein ArsR  42.7 
 
 
124 aa  78.2  3e-14  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2197  transcriptional regulator, ArsR family  43.68 
 
 
102 aa  78.6  3e-14  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1275  regulatory protein, ArsR  42.7 
 
 
124 aa  78.2  3e-14  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0149892  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0723  ArsR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
126 aa  78.6  3e-14  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.425262 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1207  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 
173 aa  77.8  4e-14  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112354 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3693  ArsR family transcriptional regulator  39.78 
 
 
123 aa  77.4  7e-14  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3027  transcriptional regulator, ArsR family  36.08 
 
 
130 aa  77  8e-14  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.291968  normal  0.013855 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4447  ArsR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
139 aa  76.6  9e-14  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0928  transcriptional regulator, ArsR family  39.77 
 
 
125 aa  76.3  1e-13  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0511  regulatory protein ArsR  40.45 
 
 
125 aa  76.3  1e-13  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0960  ArsR family transcriptional regulator  35.05 
 
 
130 aa  76.6  1e-13  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.766559  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2471  regulatory protein ArsR  37.08 
 
 
113 aa  75.5  2e-13  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.411264  normal  0.730529 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0509  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
125 aa  75.9  2e-13  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0563  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
125 aa  75.9  2e-13  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0722  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 
125 aa  75.9  2e-13  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0633  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 
125 aa  75.9  2e-13  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0507  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
125 aa  75.9  2e-13  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1546  transcriptional regulator, ArsR family  39.33 
 
 
133 aa  75.5  2e-13  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0234857  normal  0.041632 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0505  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
125 aa  75.9  2e-13  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4705  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 
125 aa  75.9  2e-13  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.22146 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0651  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 
125 aa  75.9  2e-13  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6978e-06 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0594  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
125 aa  75.9  2e-13  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0662  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
125 aa  75.9  2e-13  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1149  transcriptional regulator, ArsR family  36.96 
 
 
125 aa  75.1  3e-13  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.161631  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0553  transcriptional regulator, ArsR family  45.24 
 
 
122 aa  75.1  3e-13  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1123  transcriptional regulator, ArsR family  41.86 
 
 
126 aa  75.1  3e-13  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  2.69044e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1541  cadmium efflux system accessory protein  39.36 
 
 
125 aa  75.1  3e-13  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.558701  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2149  ArsR family transcriptional regulator  40.22 
 
 
124 aa  75.5  3e-13  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.267681  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13760  transcriptional regulator, ArsR family  38.89 
 
 
125 aa  74.7  4e-13  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.933244  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05920  transcriptional regulator, ArsR family  37.78 
 
 
123 aa  74.7  4e-13  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.560602 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4437  ArsR family transcriptional regulator  42.53 
 
 
120 aa  74.7  4e-13  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.352064  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2544  transcriptional regulator, ArsR family  44.05 
 
 
130 aa  74.7  4e-13  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2202  ArsR family transcriptional regulator  45.12 
 
 
117 aa  72  2e-12  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.975415  normal  0.398004 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2181  regulatory protein, ArsR  36.08 
 
 
106 aa  71.2  4e-12  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2219  regulatory protein ArsR  36.08 
 
 
106 aa  71.2  4e-12  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.372168  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0886  transcriptional regulator, ArsR family  40.48 
 
 
129 aa  71.2  4e-12  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0860  transcriptional regulator, ArsR family  40.48 
 
 
129 aa  71.2  4e-12  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1139  transcriptional regulator, ArsR family  36.26 
 
 
118 aa  71.2  4e-12  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.485889  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4581  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
132 aa  70.9  5e-12  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0595  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
125 aa  71.2  5e-12  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.91052  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2654  ArsR family transcriptional regulator  36.56 
 
 
109 aa  70.9  6e-12  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9265  putative transcriptional regulator, ArsR family  34.04 
 
 
122 aa  70.5  7e-12  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1126  ArsR family transcriptional regulator  34.07 
 
 
131 aa  69.7  1e-11  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0458599  normal  0.0698866 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3225  regulatory protein ArsR  35.48 
 
 
104 aa  69.7  1e-11  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.151023  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09790  predicted transcriptional regulator  34.04 
 
 
145 aa  69.3  2e-11  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.829992  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4451  ArsR family transcriptional regulator  32.98 
 
 
133 aa  68.9  2e-11  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1371  ArsR family transcriptional regulator  36.78 
 
 
117 aa  68.6  3e-11  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1168  transcriptional regulator, ArsR family  37.89 
 
 
122 aa  68.6  3e-11  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  3.15565e-08  unclonable  2.65454e-08 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2559  transcriptional regulator, ArsR family  37.65 
 
 
106 aa  68.2  4e-11  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  1.03934e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4462  transcriptional regulator, ArsR family  38.1 
 
 
174 aa  68.2  4e-11  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0894  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 
141 aa  67.8  4e-11  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.360757  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36710  transcriptional regulator, ArsR family  38.04 
 
 
144 aa  68.2  4e-11  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.944272 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1965  ArsR family transcriptional regulator  35.96 
 
 
120 aa  66.2  1e-10  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0581  ArsR family transcriptional regulator  36.26 
 
 
115 aa  66.2  1e-10  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0451  transcriptional regulator, ArsR family  29.47 
 
 
115 aa  66.6  1e-10  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.115679  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4984  transcriptional regulator, ArsR family  31.58 
 
 
135 aa  64.7  4e-10  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.452478  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1628  transcriptional regulator, ArsR family  35.29 
 
 
122 aa  63.9  7e-10  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.548833  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0341  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
114 aa  63.5  8e-10  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  8.27961e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0480  ArsR family transcriptional regulator  36.05 
 
 
120 aa  63.2  1e-09  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0108431  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1528  regulatory protein, ArsR  38.37 
 
 
120 aa  63.5  1e-09  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  3.097e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13776  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
135 aa  62.8  1e-09  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.355542 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1048  hypothetical protein  37.78 
 
 
98 aa  62.4  2e-09  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1005  ArsR family transcriptional regulator  41.86 
 
 
116 aa  62.8  2e-09  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0103223  normal  0.0233709 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1508  regulatory protein ArsR  41.18 
 
 
112 aa  62.4  2e-09  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.531192 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1291  ArsR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
122 aa  61.6  4e-09  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.217446 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0502  transcriptional regulator, ArsR family  40.7 
 
 
115 aa  61.2  4e-09  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3728  regulatory protein, ArsR  33.33 
 
 
119 aa  60.8  6e-09  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.369834  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3817  ArsR family transcriptional regulator  32.98 
 
 
101 aa  60.8  6e-09  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0450751 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>