More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0770 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0770  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 324 aa  647    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.031653  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1507  cation diffusion facilitator family transporter  44.64 
 
 		 306 aa  236  4e-61  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0924835  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0911  cation diffusion facilitator family transporter  42.91 
 
 		 311 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.344987  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1952  cation diffusion facilitator family transporter  41.94 
 
 		 298 aa  234  2.0000000000000002e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.110398  normal  0.0228516 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0383  cation diffusion facilitator family transporter  42.65 
 
 		 284 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0330741  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0329  Co/Zn/Cd efflux system component  42.91 
 
 		 294 aa  231  1e-59  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000706414  hitchhiker  0.000000000000071766 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0399  cation diffusion facilitator family transporter  41.94 
 
 		 284 aa  229  3e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00682032  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1245  cation diffusion facilitator family transporter  38.38 
 
 		 294 aa  226  6e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0088  cation diffusion facilitator family transporter  38.16 
 
 		 300 aa  217  2e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1122  cation diffusion facilitator family transporter  37.41 
 
 		 317 aa  194  2e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000327537  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3626  cation diffusion facilitator family transporter  35.43 
 
 		 321 aa  193  3e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.89177 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3964  cation diffusion facilitator family transporter  35.43 
 
 		 321 aa  193  3e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0559635  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1900  cation efflux family protein  31.05 
 
 		 314 aa  187  1e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.137192  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3467  cation diffusion facilitator family transporter  36.64 
 
 		 300 aa  186  3e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1136  cation diffusion facilitator family transporter  39.64 
 
 		 342 aa  186  4e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0978  cation diffusion facilitator family transporter  33.22 
 
 		 317 aa  186  6e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0892489  normal  0.0362171 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0067  cation diffusion facilitator transporter family protein  34.78 
 
 		 306 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1042  cation efflux family protein  35.07 
 
 		 298 aa  182  9.000000000000001e-45  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0815398  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2198  cation diffusion facilitator family transporter  35.64 
 
 		 307 aa  182  9.000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0545  cation diffusion facilitator family transporter  38.91 
 
 		 315 aa  181  1e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0039  cation efflux protein  33.82 
 
 		 312 aa  180  2e-44  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.747433  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0595  cation efflux protein  31.29 
 
 		 298 aa  180  2e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1756  cation efflux family protein  38.95 
 
 		 317 aa  179  4e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.799686  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4582  cation diffusion facilitator family transporter  32 
 
 		 311 aa  179  4e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1243  zinc transporter ZitB  34.32 
 
 		 312 aa  177  1e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00653762  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03787  Co/Zn/Cd efflux system component  31.23 
 
 		 320 aa  178  1e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00228734  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2884  cation diffusion facilitator family transporter  30.61 
 
 		 307 aa  176  4e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1405  zinc transporter ZitB  34.86 
 
 		 312 aa  175  8e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2863  zinc transporter ZitB  34.86 
 
 		 312 aa  175  8e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00819873  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3275  cation diffusion facilitator family transporter  33.68 
 
 		 302 aa  175  8e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0220502  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  30.95 
 
 		 312 aa  174  9.999999999999999e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0487  cation efflux family protein  30.87 
 
 		 331 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0280  cation diffusion facilitator family transporter  36.36 
 
 		 291 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1852  cation diffusion facilitator family transporter  30.13 
 
 		 311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.63223  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0868  cation diffusion facilitator family transporter  31.71 
 
 		 309 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4476  cation diffusion facilitator family transporter  32.88 
 
 		 312 aa  173  5e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1196  cation diffusion facilitator family transporter  31.02 
 
 		 326 aa  173  5e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.114985 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2951  zinc transporter ZitB  34.51 
 
 		 312 aa  171  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.278393  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2182  cation diffusion facilitator family transporter  35.87 
 
 		 325 aa  170  3e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1014  cation diffusion facilitator family transporter  34.26 
 
 		 300 aa  170  3e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0149205  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2220  cation diffusion facilitator family transporter  35.87 
 
 		 325 aa  170  3e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.157536  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3226  cation diffusion facilitator family transporter  37.23 
 
 		 352 aa  169  5e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0672  zinc transporter ZitB  34.14 
 
 		 313 aa  169  6e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00307439  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1452  zinc transporter ZitB  33.21 
 
 		 378 aa  168  1e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00926601  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4080  cation diffusion facilitator family transporter  36.36 
 
 		 295 aa  168  1e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  33.56 
 
 		 299 aa  167  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0153  cation diffusion facilitator family transporter  38.65 
 
 		 307 aa  167  2e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0646969  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  33.22 
 
 		 299 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1581  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  34.85 
 
 		 299 aa  165  8e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0909  cation diffusion facilitator family transporter  32.9 
 
 		 327 aa  165  1.0000000000000001e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0096451  hitchhiker  0.0000000000204317 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0822  zinc transporter ZitB  32.11 
 
 		 312 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0794  zinc transporter ZitB  32.11 
 
 		 312 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00320778  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0853  Hsp12 variant C  34.7 
 
 		 306 aa  164  1.0000000000000001e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.401096  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0853  zinc transporter ZitB  32.11 
 
 		 312 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.106853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0917  zinc transporter ZitB  31.49 
 
 		 312 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1629  cation efflux family protein  34.85 
 
 		 299 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1607  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  34.85 
 
 		 299 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0977421  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1756  cation efflux family protein  34.85 
 
 		 299 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0464766  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0395  cation diffusion facilitator family transporter  32.18 
 
 		 327 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.309924  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1889  cation efflux family protein  34.85 
 
 		 299 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0368031  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  33.79 
 
 		 299 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0885  zinc transporter ZitB  31.17 
 
 		 312 aa  163  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.288903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  32.88 
 
 		 299 aa  163  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1806  cation efflux family protein  35.23 
 
 		 295 aa  163  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4034  cation diffusion facilitator family transporter  29.02 
 
 		 326 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0471983  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0974  cation diffusion facilitator family transporter  34.53 
 
 		 314 aa  163  4.0000000000000004e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3071  cation efflux protein  28.67 
 
 		 334 aa  162  8.000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2470  cation diffusion facilitator family transporter  32.03 
 
 		 310 aa  161  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.843602  normal  0.377619 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1284  zinc transporter ZitB  33.22 
 
 		 316 aa  159  4e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000026139  hitchhiker  0.00172679 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0853  zinc transporter ZitB  34.48 
 
 		 313 aa  160  4e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0287649  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2890  cation diffusion facilitator family transporter  34.14 
 
 		 313 aa  159  5e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00172729  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0806  zinc transporter ZitB  34.14 
 
 		 313 aa  159  5e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.002525  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1191  cation diffusion facilitator family transporter  30.31 
 
 		 309 aa  159  5e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0778  zinc transporter ZitB  34.14 
 
 		 313 aa  159  5e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000446188  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2910  zinc transporter ZitB  34.14 
 
 		 313 aa  159  5e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.248313  normal  0.320086 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3267  cation efflux system protein  32.99 
 
 		 301 aa  159  6e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.496954  normal  0.224541 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0572  cation diffusion facilitator family transporter  32.57 
 
 		 359 aa  159  6e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0111845 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0693  cation diffusion facilitator family transporter  29.51 
 
 		 312 aa  159  7e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00705  zinc transporter ZitB  33.79 
 
 		 313 aa  158  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0137871  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00694  hypothetical protein  33.79 
 
 		 313 aa  158  1e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0161088  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1256  zinc transporter ZitB  35.15 
 
 		 321 aa  158  1e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.139102  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  32.27 
 
 		 316 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01708  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  29.02 
 
 		 304 aa  157  2e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193736  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2008  cation diffusion facilitator family transporter  29.34 
 
 		 398 aa  157  2e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0398491 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0215  cation diffusion facilitator family transporter  31.85 
 
 		 299 aa  157  2e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2062  cation diffusion facilitator family transporter  30.19 
 
 		 342 aa  158  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.118305  normal  0.587349 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6782  cation diffusion facilitator family transporter  29.18 
 
 		 305 aa  157  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337377  normal  0.84699 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1954  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 293 aa  156  3e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000254131  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5979  cation diffusion facilitator CzcD  32.23 
 
 		 316 aa  157  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000910181  normal  0.0784096 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1761  cation diffusion facilitator family transporter  32.23 
 
 		 316 aa  157  3e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0169574  normal  0.529338 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0328  cation diffusion facilitator family transporter  30.34 
 
 		 298 aa  157  3e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3783  cation diffusion facilitator family transporter  30.38 
 
 		 341 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3463  cation diffusion facilitator family transporter  29.6 
 
 		 293 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0712  cation diffusion facilitator family transporter  36.13 
 
 		 301 aa  155  7e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0026  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  28.57 
 
 		 301 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000390702 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0040  cation diffusion facilitator family transporter  28.57 
 
 		 301 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0020  cation efflux family protein  35.85 
 
 		 314 aa  154  1e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0040  cation diffusion facilitator family transporter  28.57 
 
 		 301 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142458 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0043  cation diffusion facilitator family transporter  28.57 
 
 		 301 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1802  cation diffusion facilitator family transporter  32.44 
 
 		 298 aa  154  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>