152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0763 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0763  thiamine biosynthesis protein ThiI  100 
 
 
389 aa  785  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00421556  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0130  thiamine biosynthesis protein ThiI  61.92 
 
 
389 aa  490  1e-137  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00491755  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0990  thiamine biosynthesis protein ThiI  50.65 
 
 
398 aa  378  1e-104  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0024577  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1140  thiamine biosynthesis protein ThiI  50.65 
 
 
385 aa  366  1e-100  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  9.1055e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0198  thiamine biosynthesis protein ThiI  44.81 
 
 
390 aa  306  3e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1683  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  43.43 
 
 
392 aa  303  4e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2024  thiamine biosynthesis protein ThiI  42.56 
 
 
380 aa  302  5e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0721  thiamine biosynthesis protein ThiI  42.6 
 
 
402 aa  301  1e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2718  thiamine biosynthesis protein ThiI  42.08 
 
 
401 aa  295  6e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1546  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  43.01 
 
 
392 aa  293  4e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4391  thiamine biosynthesis protein ThiI  42.35 
 
 
404 aa  291  1e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4545  thiamine biosynthesis protein ThiI  42.08 
 
 
404 aa  290  2e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1063  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  42.78 
 
 
392 aa  291  2e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4899  thiamine biosynthesis protein ThiI  42.08 
 
 
403 aa  290  2e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4784  thiamine biosynthesis protein ThiI  42.08 
 
 
404 aa  290  2e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4765  thiamine biosynthesis protein ThiI  42.08 
 
 
404 aa  290  2e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4782  thiamine biosynthesis protein ThiI  41.8 
 
 
404 aa  290  3e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4381  thiamine biosynthesis protein ThiI  41.8 
 
 
404 aa  290  3e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0479  thiamine biosynthesis protein ThiI  42.35 
 
 
404 aa  290  4e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  4.0209e-08 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4756  thiamine biosynthesis protein ThiI  41.8 
 
 
404 aa  289  7e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4478  thiamine biosynthesis protein ThiI  42.35 
 
 
403 aa  288  1e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3319  thiamine biosynthesis protein ThiI  42.52 
 
 
403 aa  286  5e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1223  thiamine biosynthesis protein ThiI  40.16 
 
 
405 aa  283  3e-75  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  1.64675e-06  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2351  thiamine biosynthesis protein ThiI  37.97 
 
 
413 aa  276  6e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22060  thiamine biosynthesis protein ThiI  42.96 
 
 
396 aa  273  4e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.733648  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1279  thiamine biosynthesis protein ThiI  40.05 
 
 
407 aa  273  5e-72  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0186014  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2758  thiamine biosynthesis protein ThiI  40.05 
 
 
400 aa  273  5e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0785401  normal  0.423621 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3042  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  41.22 
 
 
414 aa  272  7e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0001724  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1262  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  38.58 
 
 
400 aa  271  1e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.56541  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2301  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  40.73 
 
 
391 aa  267  2e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.297058  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1771  thiamine biosynthesis protein ThiI  38.86 
 
 
407 aa  264  2e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1806  thiamine biosynthesis protein ThiI  38.86 
 
 
407 aa  264  2e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.803384  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1327  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  39.73 
 
 
398 aa  258  2e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0906618  normal  0.041643 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1038  thiamine biosynthesis protein ThiI  39.52 
 
 
422 aa  257  3e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.16797  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0451  thiamine biosynthesis protein ThiI  38.25 
 
 
407 aa  253  6e-66  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1372  thiamine biosynthesis protein ThiI  37.43 
 
 
404 aa  251  2e-65  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000114319  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1272  thiamine biosynthesis protein ThiI  41.41 
 
 
392 aa  248  1e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  2.8573e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1330  thiamine biosynthesis protein ThiI  41.41 
 
 
392 aa  248  1e-64  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  5.22414e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0819  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  39.32 
 
 
394 aa  247  2e-64  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1666  thiamine biosynthesis protein ThiI  37.9 
 
 
385 aa  248  2e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.357019  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0806  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  37.84 
 
 
414 aa  247  2e-64  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.305799  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2546  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  38.89 
 
 
401 aa  246  4e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.661322  normal  0.66095 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1402  thiamine biosynthesis protein ThiI  36.57 
 
 
385 aa  245  9e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2568  thiamine biosynthesis protein ThiI  41.71 
 
 
387 aa  245  1e-63  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0463  thiamine biosynthesis protein ThiI  36.73 
 
 
392 aa  244  3e-63  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf098  thiamine biosynthesis protein ThiI  36.9 
 
 
381 aa  242  9e-63  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  2.38711e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11930  thiazole biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  35.68 
 
 
420 aa  237  2e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000175625  normal  0.0434054 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0503  thiamine biosynthesis protein ThiI  36.24 
 
 
406 aa  235  9e-61  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  1.16963e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl584  thiamin biosynthesis protein  35.01 
 
 
400 aa  228  1e-58  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.662181  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0731  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  36.1 
 
 
388 aa  228  2e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000207137  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1319  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  37.6 
 
 
383 aa  227  3e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0599  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  37.08 
 
 
383 aa  227  3e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.27457  normal  0.481972 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1658  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  36.44 
 
 
405 aa  226  4e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.151293  hitchhiker  0.00140445 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3122  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  37.23 
 
 
429 aa  226  7e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26980  thiamine biosynthesis protein ThiI  38.24 
 
 
393 aa  226  8e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.121036  normal  0.93751 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07780  thiazole biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  34.39 
 
 
410 aa  224  3e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.452417  normal  0.680526 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0224  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  37.77 
 
 
383 aa  223  5e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0925  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  38.18 
 
 
387 aa  221  2e-56  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  1.71827e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0664  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  37.86 
 
 
385 aa  220  4e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0239  thiamine biosynthesis protein ThiI  38.15 
 
 
395 aa  216  6e-55  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0302483  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0796  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  37.43 
 
 
406 aa  210  4e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.235177  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2184  thiamine biosynthesis protein  35.33 
 
 
369 aa  200  4e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.72421  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0320  thiamine biosynthesis protein ThiI  35.54 
 
 
484 aa  196  5e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2042  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  32.98 
 
 
370 aa  186  4e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.389674 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0367  hypothetical protein  32.99 
 
 
404 aa  180  4e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1035  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  32.89 
 
 
422 aa  180  5e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.533687  normal  0.416754 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1110  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  34.85 
 
 
376 aa  177  3e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.142781  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1613  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  33.6 
 
 
392 aa  175  1e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.166004  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1206  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  32.27 
 
 
361 aa  173  5e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00578978  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0070  thiamine biosynthesis protein  32.44 
 
 
387 aa  167  4e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.090437 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1882  thiamine biosynthesis protein ThiI  34.68 
 
 
474 aa  166  7e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.379133  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0972  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.6 
 
 
472 aa  164  2e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.493614 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1380  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  33.6 
 
 
493 aa  161  2e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.698571 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1308  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  35.58 
 
 
371 aa  157  4e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0892  thiamine biosynthesis protein  34.06 
 
 
335 aa  156  6e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.122669  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0010  thiazole biosynthesis protein  29.4 
 
 
436 aa  152  9e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0479704  normal  0.171831 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2806  thiamine biosynthesis protein  32.38 
 
 
502 aa  149  1e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0596  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  34.89 
 
 
500 aa  144  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.461448  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2431  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.34 
 
 
484 aa  141  2e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1938  hypothetical protein  40.21 
 
 
212 aa  140  4e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.186563  normal  0.681719 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2766  thiamine biosynthesis protein ThiI  29.89 
 
 
485 aa  139  6e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.43799 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2566  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.61 
 
 
486 aa  139  9e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.813354  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3460  Thiamine biosynthesis protein-like protein  28.17 
 
 
392 aa  138  1e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.883021  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0455  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.51 
 
 
482 aa  139  1e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0495  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.59 
 
 
482 aa  138  1e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00371  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.59 
 
 
482 aa  138  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1320  thiamine biosynthesis protein  29.81 
 
 
309 aa  138  1e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00375  hypothetical protein  31.59 
 
 
482 aa  138  1e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3210  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.59 
 
 
482 aa  138  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  7.78782e-05 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2785  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.87 
 
 
484 aa  138  2e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.22936  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0345  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.59 
 
 
482 aa  138  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1531  thiamine biosynthesis protein ThiI  29.69 
 
 
484 aa  138  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0014  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  30.65 
 
 
416 aa  138  2e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.735237  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3186  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  31.33 
 
 
482 aa  137  3e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.304423  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0459  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.33 
 
 
482 aa  137  4e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.882891 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004253  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.33 
 
 
465 aa  137  4e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  6.09097e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1362  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.21 
 
 
484 aa  136  7e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.412717  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1348  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.21 
 
 
484 aa  136  7e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1387  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.21 
 
 
484 aa  136  7e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.158282 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2998  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.21 
 
 
484 aa  136  7e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.174595  hitchhiker  7.07392e-07 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>