More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0743 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0743  MATE efflux family protein  100 
 
 		 454 aa  895    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193663  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0997  MATE efflux family protein  51.49 
 
 		 437 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.207525  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1133  MATE efflux family protein  51.49 
 
 		 437 aa  464  1e-129  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0784  MATE efflux family protein  42.95 
 
 		 460 aa  371  1e-101  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1509  MATE efflux family protein  41.8 
 
 		 460 aa  360  3e-98  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.712333  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1171  MATE efflux family protein  42.32 
 
 		 457 aa  353  4e-96  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1166  MATE efflux family protein  41.24 
 
 		 460 aa  353  5e-96  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1142  MATE efflux family protein  43.78 
 
 		 458 aa  343  5e-93  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1654  MATE efflux family protein  39.37 
 
 		 473 aa  323  6e-87  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2636  integral membrane protein  37.95 
 
 		 478 aa  316  5e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.117345 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3492  integral membrane protein  37.11 
 
 		 485 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0396785  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1953  MATE efflux family protein  37 
 
 		 454 aa  300  4e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1858  MATE efflux family protein  37.58 
 
 		 467 aa  298  2e-79  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0434953  normal  0.402686 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2029  MATE efflux family protein  36.47 
 
 		 455 aa  290  4e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.139982  normal  0.342387 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1708  MATE efflux family protein  37.25 
 
 		 470 aa  271  2e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  30.67 
 
 		 455 aa  192  2e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  29.67 
 
 		 460 aa  184  3e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0814  MATE efflux family protein subfamily  30.51 
 
 		 451 aa  166  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0013446  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1652  MATE efflux family protein  29.35 
 
 		 454 aa  164  3e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000778713  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  30.56 
 
 		 452 aa  160  3e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  30.25 
 
 		 468 aa  160  3e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  31.98 
 
 		 456 aa  161  3e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  29.01 
 
 		 477 aa  160  4e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  29.62 
 
 		 447 aa  160  6e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  29.79 
 
 		 447 aa  159  8e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1446  MATE efflux family protein  30.61 
 
 		 439 aa  159  1e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.484247 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  29.79 
 
 		 449 aa  157  3e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  28.29 
 
 		 455 aa  157  4e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1483  MATE efflux family protein  31.03 
 
 		 456 aa  155  1e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  28.54 
 
 		 462 aa  154  2.9999999999999998e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  28.06 
 
 		 455 aa  154  4e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1662  MATE efflux family protein  28.51 
 
 		 453 aa  150  4e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.226136  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4310  MATE efflux family protein  31.07 
 
 		 451 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03665  C-5 cytosine-specific DNA methylase:Multi antimicrobial extrusion (MatE) protein  26.42 
 
 		 455 aa  148  2.0000000000000003e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1577  MATE efflux family protein  30 
 
 		 447 aa  145  1e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.283423  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1497  MATE efflux family protein  29.05 
 
 		 460 aa  145  2e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00584213  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2060  MATE efflux family protein  26.83 
 
 		 456 aa  145  2e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000022927  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2612  MATE efflux family protein  27.15 
 
 		 459 aa  144  3e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0381  MATE efflux family protein  27.27 
 
 		 451 aa  144  4e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00954667  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  29.46 
 
 		 454 aa  144  4e-33  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3395  MATE efflux family protein  28.73 
 
 		 461 aa  143  7e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0255  MATE efflux family protein  26.5 
 
 		 448 aa  143  8e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.392054  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1800  MATE efflux family protein  26.76 
 
 		 455 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1409  MATE efflux family protein  27.18 
 
 		 460 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.851568  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  25.22 
 
 		 453 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0333  MATE efflux family protein  29.34 
 
 		 451 aa  138  2e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0189347  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  25.17 
 
 		 462 aa  139  2e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0091  MATE efflux family protein  28.09 
 
 		 454 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  25.45 
 
 		 462 aa  137  4e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5639  MATE efflux family protein  26.06 
 
 		 450 aa  137  4e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.75001  normal  0.399325 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1813  MATE efflux family protein  27.63 
 
 		 461 aa  136  8e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.000000145997  normal  0.0820418 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  28.6 
 
 		 454 aa  135  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02728  MATE efflux family protein  27.53 
 
 		 460 aa  135  9.999999999999999e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0324679  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0313  hypothetical protein  26.93 
 
 		 455 aa  135  1.9999999999999998e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00088835  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  28.11 
 
 		 477 aa  134  3.9999999999999996e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1218  Na+ driven multidrug efflux pump  26.48 
 
 		 464 aa  133  5e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.530621  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  28.09 
 
 		 462 aa  133  6e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2347  MATE efflux family protein  25.96 
 
 		 466 aa  133  6e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000304243  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2080  MATE efflux family protein  26.57 
 
 		 454 aa  132  9e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.634791 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2315  MATE efflux family protein  25.39 
 
 		 470 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.1458  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0383  MATE efflux family protein  28.2 
 
 		 451 aa  131  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.504119  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1225  MATE efflux family protein  26.5 
 
 		 452 aa  131  3e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0393  MATE efflux family protein  28.2 
 
 		 451 aa  131  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.530968  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0828  MATE efflux family protein  28.91 
 
 		 438 aa  130  5.0000000000000004e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.478729  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  27.39 
 
 		 500 aa  129  7.000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  24.73 
 
 		 460 aa  129  8.000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1732  MATE efflux family protein, putative  26.7 
 
 		 451 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0426272  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0835  MATE efflux family protein  28.32 
 
 		 438 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0006  MATE efflux family protein  25.53 
 
 		 442 aa  128  2.0000000000000002e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0243937 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  24.78 
 
 		 458 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3319  MATE efflux family protein  25.65 
 
 		 460 aa  129  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00330578  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1353  MATE efflux family protein  26.89 
 
 		 453 aa  127  3e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  27.9 
 
 		 448 aa  127  3e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000170892  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1822  MATE efflux family protein  29.04 
 
 		 440 aa  127  3e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.286977  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0350  MATE efflux family protein  28.15 
 
 		 455 aa  127  4.0000000000000003e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0640  MATE efflux family protein  27.88 
 
 		 454 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.690668  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  25.39 
 
 		 458 aa  127  5e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2656  MATE efflux family protein  26.41 
 
 		 455 aa  127  5e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000320959  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0470  MATE efflux family protein  27.98 
 
 		 455 aa  126  7e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.11231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3666  putative MATE efflux family protein  26.23 
 
 		 451 aa  125  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.269496  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1524  MATE efflux family protein  26.46 
 
 		 451 aa  125  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.942742  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1709  putative MATE efflux family protein  26.46 
 
 		 451 aa  125  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1642  MATE efflux family protein  26.46 
 
 		 451 aa  125  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0111  MATE efflux family protein  28.05 
 
 		 464 aa  125  2e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1783  putative MATE efflux family protein  26.23 
 
 		 451 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1678  putative MATE efflux family protein  26 
 
 		 451 aa  125  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131479  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1371  MATE efflux family protein  26.27 
 
 		 463 aa  124  3e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1496  Na+ driven multidrug efflux pump  26.46 
 
 		 451 aa  124  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00660126  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0849  multi antimicrobial extrusion protein MatE  33.15 
 
 		 190 aa  124  3e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.471879  normal  0.497237 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1528  MATE efflux family protein  26 
 
 		 452 aa  124  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0577  Na+-driven multidrug efflux pump  25.52 
 
 		 454 aa  124  3e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00131825  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1387  MATE efflux family protein  27.72 
 
 		 454 aa  124  4e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00032817  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1486  Na+ driven multidrug efflux pump  26.23 
 
 		 451 aa  124  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3019  MATE efflux family protein  29.97 
 
 		 453 aa  124  4e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000108454  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2651  MATE efflux family protein  26.23 
 
 		 449 aa  123  6e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000524124  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  26.45 
 
 		 469 aa  123  7e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0931  MATE efflux family protein  27.77 
 
 		 448 aa  122  9.999999999999999e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  24.5 
 
 		 525 aa  121  1.9999999999999998e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0548  MATE efflux family protein  28.07 
 
 		 459 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000824418  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0293  MATE efflux family protein  25.39 
 
 		 467 aa  121  3e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>