More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0702 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0702  HflK protein  100 
 
 
306 aa  615  1e-175  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0630  HflK protein  58.97 
 
 
309 aa  358  8e-98  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1107  HflK protein  52.12 
 
 
308 aa  320  2e-86  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0999  HflK protein  51.79 
 
 
308 aa  318  7e-86  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1321  HflK protein  50.17 
 
 
331 aa  298  6e-80  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.132959  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0866  HflK protein  39.33 
 
 
387 aa  223  2e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0134837  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0263  HflK protein  38.41 
 
 
360 aa  216  6e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2262  HflK protein  41.24 
 
 
333 aa  213  2e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.5812e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1090  HflK protein  36.27 
 
 
405 aa  213  3e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1573  HflK protein  36.02 
 
 
367 aa  212  6e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  4.27817e-07  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2674  HflK protein  35.79 
 
 
388 aa  208  9e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0162976 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0575  HflK protein  35.5 
 
 
459 aa  208  1e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.289879  hitchhiker  3.63385e-10 
 
 
-
 
NC_002978  WD0831  hflK protein  37.72 
 
 
344 aa  206  3e-52  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.604081  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5012  HflK protein  36.54 
 
 
464 aa  206  5e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.967957  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0665  HflK protein  38.23 
 
 
322 aa  204  1e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0843  HflK  37.72 
 
 
355 aa  203  3e-51  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2978  HflK  37.54 
 
 
436 aa  203  3e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.750881  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3613  HflK protein  38.93 
 
 
350 aa  202  4e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3678  HflK protein  38.93 
 
 
350 aa  202  5e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1050  hflK protein  37.89 
 
 
357 aa  202  5e-51  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1177  HflK protein  36.45 
 
 
451 aa  202  8e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.621922 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1097  HflK protein  36.45 
 
 
451 aa  202  8e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1743  HflK protein  34.44 
 
 
453 aa  201  9e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1716  HflK protein  34.44 
 
 
441 aa  201  9e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.40222  normal  0.183963 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2588  HflK-like protein  38.16 
 
 
413 aa  201  1e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0268051  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0664  HflK protein  36 
 
 
395 aa  201  1e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119349  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2203  HflK  36.11 
 
 
407 aa  201  1e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2946  HflK protein  38.11 
 
 
359 aa  201  1e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0486  HflK protein  35.84 
 
 
361 aa  201  2e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.333714 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1664  HflK protein  36.49 
 
 
385 aa  200  2e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0743516 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1413  HflK protein  35.33 
 
 
465 aa  200  2e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.843638  hitchhiker  7.6277e-06 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3383  HflK protein  34.14 
 
 
433 aa  201  2e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3522  HflK protein  39.93 
 
 
378 aa  199  6e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2279  HflK protein  37.36 
 
 
378 aa  198  8e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2241  ftsH protease activity modulator HflK  35.33 
 
 
445 aa  198  8e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.753349  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0899  HflK protein  36.18 
 
 
393 aa  198  8e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0975444  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0073  HflK protein  35.6 
 
 
452 aa  197  1e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.715541  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2665  heat shock protein HslU  36.36 
 
 
386 aa  198  1e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.288159  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2601  HflK protein  38.31 
 
 
474 aa  198  1e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.373557  normal  0.662751 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2300  HflK protein  38.11 
 
 
464 aa  197  2e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.194929  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1089  HflK protein  38.13 
 
 
386 aa  196  3e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0604271 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0701  HflK protein  38.93 
 
 
389 aa  196  5e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.704502  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0184  HflK protein  36.94 
 
 
350 aa  196  5e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.464888  normal  0.739242 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0445  HflK protein  36.84 
 
 
399 aa  195  8e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.713082  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1431  HflK protein  36.67 
 
 
471 aa  194  1e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.936066 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1879  HflK protein  37.63 
 
 
471 aa  194  2e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239775  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1353  band 7 protein:stomatin  36 
 
 
384 aa  194  2e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.792313  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0604  HflK protein  37.5 
 
 
368 aa  193  2e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0450848 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1749  HflK protein  35.99 
 
 
376 aa  194  2e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.254466  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1601  FtsH protease activity modulator HflK  34.33 
 
 
460 aa  194  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.559516  normal  0.13244 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2099  HflK protein  34.31 
 
 
447 aa  193  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.080069 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1470  HflK protein  33.77 
 
 
446 aa  193  3e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.407344  normal  0.172273 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1989  hypothetical protein  34.68 
 
 
435 aa  192  5e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.757808  normal  0.0447269 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2347  ftsH protease activity modulator HflK  35 
 
 
442 aa  192  6e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2728  HflK protein  38.06 
 
 
385 aa  192  6e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2220  HflK protein  35 
 
 
454 aa  192  6e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1099  HflK protein  35 
 
 
437 aa  192  7e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1338  ftsH protease activity modulator HflK  35 
 
 
437 aa  192  7e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.123813  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1827  HflK protein  35 
 
 
437 aa  192  7e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0069  ftsH protease activity modulator HflK  35 
 
 
449 aa  192  7e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.255254  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1397  hflK protein  36 
 
 
382 aa  191  9e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0603  HflK  35.29 
 
 
395 aa  191  1e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2194  HflK protein  34.78 
 
 
456 aa  191  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2182  HflK protein  34.67 
 
 
454 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1794  HflK protein  35 
 
 
383 aa  191  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.301305  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2798  HflK protein  34.44 
 
 
357 aa  190  2e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.786571  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1284  HflK protein  33.45 
 
 
503 aa  191  2e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2534  HflK protein  34 
 
 
466 aa  190  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0683686  hitchhiker  3.21559e-05 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2349  HflK  37.02 
 
 
382 aa  188  7e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.384267  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1730  HflK protein  39.05 
 
 
389 aa  189  7e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000348315 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4527  HflK protein  38.27 
 
 
394 aa  188  9e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1981  hflK protein  34.11 
 
 
403 aa  188  1e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.245892  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5106  membrane protein, HflK  33.55 
 
 
434 aa  187  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167659  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3352  HflK protein  38.95 
 
 
389 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.154635 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2038  HflK protein  39.3 
 
 
390 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989603  normal  0.793303 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1942  HflK protein  34.69 
 
 
406 aa  186  5e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0673  HflK protein  32.67 
 
 
498 aa  186  6e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6274  HflK protein  33 
 
 
462 aa  185  7e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.321519  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1805  HflK protein  33 
 
 
462 aa  185  7e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.644359  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2079  HflK  34.71 
 
 
457 aa  185  8e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1886  hflK protein  32.99 
 
 
397 aa  185  8e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1561  HflK protein  32.99 
 
 
397 aa  185  8e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.920628  hitchhiker  1.45898e-09 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2018  HflK protein  35.94 
 
 
362 aa  185  1e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2861  HflK protein  36.05 
 
 
393 aa  184  2e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0003  HflK protein  41.28 
 
 
329 aa  183  2e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1829  HflK protein  32.67 
 
 
436 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.51115  normal  0.182699 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1066  HflK protein  33.67 
 
 
477 aa  183  3e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.544735  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4005  HflK protein  36.25 
 
 
383 aa  183  3e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.906349  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4768  HflK protein  35.47 
 
 
393 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0579  HflK protein  33.78 
 
 
386 aa  183  3e-45  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4892  HflK protein  35.47 
 
 
405 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.42676  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1158  HflK protein  34.01 
 
 
475 aa  183  3e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4683  HflK protein  35.49 
 
 
393 aa  182  6e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0494  HflK protein  34.55 
 
 
420 aa  182  7e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0869387  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0574  HflK  35.96 
 
 
400 aa  182  7e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07560  membrane bound protease regulator HflK  36.52 
 
 
351 aa  181  1e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0164  HflK protein  35.07 
 
 
347 aa  181  1e-44  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  5.64548e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2780  HflK protein  37.23 
 
 
379 aa  181  1e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.224376 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3262  HflK protein  38.38 
 
 
383 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.264682  normal  0.260183 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4940  hflK protein  35.62 
 
 
395 aa  179  5e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>