More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0691 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0691  putative CheW protein  100 
 
 		 148 aa  283  7e-76  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0932  putative CheW protein  59.31 
 
 		 151 aa  161  3e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.432309  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0229  putative CheW protein  47.26 
 
 		 151 aa  135  1e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0227  CheW protein  47.26 
 
 		 148 aa  135  1e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1391  CheW protein  44.78 
 
 		 141 aa  105  2e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0209  CheW protein  37.5 
 
 		 150 aa  79  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1135  CheW protein  36.03 
 
 		 145 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0211  putative CheW protein  35.29 
 
 		 150 aa  72.4  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  33.81 
 
 		 147 aa  71.6  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1560  putative CheW protein  34.75 
 
 		 146 aa  70.9  0.000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.918027  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  31.16 
 
 		 162 aa  70.1  0.000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  33.58 
 
 		 164 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  33.83 
 
 		 170 aa  68.9  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  37.14 
 
 		 167 aa  68.9  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0875  CheW protein  38 
 
 		 154 aa  68.9  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2609  chemotaxis protein  28.15 
 
 		 157 aa  68.2  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.112886  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  34.97 
 
 		 163 aa  68.2  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  34.35 
 
 		 163 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1730  CheW protein  32.35 
 
 		 146 aa  67.4  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.996579  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0732  putative CheW protein  32.59 
 
 		 146 aa  67.4  0.00000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.189251  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1537  CheW protein  35.25 
 
 		 174 aa  66.6  0.0000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  32.85 
 
 		 163 aa  66.6  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  32.12 
 
 		 164 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0172  putative CheW protein  32.35 
 
 		 146 aa  65.5  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0865787  normal  0.924879 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0878  CheW protein  33.33 
 
 		 192 aa  65.5  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00285186  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  37.25 
 
 		 158 aa  65.1  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  31.88 
 
 		 168 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2892  putative CheW protein  27.08 
 
 		 159 aa  64.3  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.953703 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0637  CheW protein  32.35 
 
 		 150 aa  64.3  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.424922  normal  0.132097 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2154  putative CheW protein  31.62 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  33.33 
 
 		 189 aa  64.3  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  37.25 
 
 		 158 aa  63.9  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  31.85 
 
 		 165 aa  63.2  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3631  CheW protein  25.69 
 
 		 158 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.287941 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1572  response regulator receiver modulated CheW protein  28.47 
 
 		 301 aa  63.2  0.000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4419  putative CheW protein  31.85 
 
 		 165 aa  63.5  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1579  putative CheW protein  31.58 
 
 		 170 aa  63.5  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.450037  normal  0.31697 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  31.85 
 
 		 165 aa  63.2  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000034863 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1768  CheW protein  28.48 
 
 		 907 aa  62.8  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.52563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0491  CheW protein  31.39 
 
 		 154 aa  62.8  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3920  CheW protein  25.87 
 
 		 158 aa  62.8  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1492  chemotaxis protein CheW  28.38 
 
 		 444 aa  61.6  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5555  chemotaxis protein  26.95 
 
 		 157 aa  62  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2027  CheW protein  30.88 
 
 		 163 aa  61.6  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3073  CheW protein  32.61 
 
 		 136 aa  61.6  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000325581 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3144  putative CheW protein  29.93 
 
 		 262 aa  61.6  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2236  CheW protein  29.23 
 
 		 478 aa  61.2  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1450  putative CheW protein  30.6 
 
 		 148 aa  61.2  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  36.27 
 
 		 158 aa  61.2  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4092  chemotaxis protein  26.57 
 
 		 159 aa  61.2  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.410589  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1415  CheW protein  33.33 
 
 		 154 aa  60.8  0.000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0320  CheW protein  28.36 
 
 		 160 aa  60.8  0.000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1198  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  28.06 
 
 		 158 aa  60.5  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.841781  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  30.66 
 
 		 165 aa  60.5  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  30.66 
 
 		 165 aa  60.5  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2817  CheW protein  36 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1348  CheW protein  39.29 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07620  putative CheW protein  31.62 
 
 		 165 aa  59.7  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000372381  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2121  CheW protein  26.92 
 
 		 253 aa  58.9  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2578  purine-binding chemotaxis protein CheW  29.63 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  29.45 
 
 		 183 aa  59.3  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  25.55 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0990  CheW protein  33.33 
 
 		 173 aa  58.2  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.519788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  30.82 
 
 		 161 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1611  CheW protein  31.65 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00323467  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  30.43 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0236  putative CheW protein  24.44 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270011 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0138  putative CheW protein  32.54 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0706424  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  27.59 
 
 		 168 aa  58.2  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0218  putative CheW protein  32.54 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1795  putative CheW protein  29.77 
 
 		 152 aa  57.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2733  CheW protein  28.95 
 
 		 179 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.013016  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2175  CheW protein  34.65 
 
 		 166 aa  57.8  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.765903  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2099  CheW protein  30.08 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1014  putative purine-binding chemotaxis protein CheW  27.66 
 
 		 520 aa  57.4  0.00000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2416  chemotaxis protein CheW  29.5 
 
 		 166 aa  57.4  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.261623  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  34.62 
 
 		 164 aa  57.4  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0275  putative CheW protein  29.2 
 
 		 150 aa  57.4  0.00000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.18524  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1450  chemotaxis signal transduction protein  35.35 
 
 		 518 aa  57.4  0.00000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  26.9 
 
 		 162 aa  57.4  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2689  CheW protein  35.07 
 
 		 155 aa  57  0.00000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3887  CheW protein  28.28 
 
 		 141 aa  57  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.110248  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0496  CheW protein  30.77 
 
 		 344 aa  57  0.00000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0218818  normal  0.799027 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2796  putative CheW protein  29.41 
 
 		 159 aa  57  0.00000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153028  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1846  putative CheW protein  35 
 
 		 568 aa  57  0.00000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0940518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0869  CheW protein  26.76 
 
 		 149 aa  57  0.00000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0690  purine-binding chemotaxis protein  31.63 
 
 		 466 aa  57  0.00000009  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00466397  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  27.54 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1777  chemotaxis protein CheV  26.95 
 
 		 302 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.782238  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  30.34 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0060  CheW protein  29.81 
 
 		 169 aa  56.6  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.202075  normal  0.220201 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1832  chemotaxis protein CheV  26.95 
 
 		 302 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000391967  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1769  CheW protein  32.59 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2550  CheW protein  30.33 
 
 		 169 aa  57  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.234406 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  27.78 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2026  CheW protein  30.07 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  27.54 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0779  CheW protein  33.66 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1544  chemotaxis protein  26.95 
 
 		 302 aa  56.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0242489  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  28.67 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>