30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0672 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0672  hypothetical protein  100 
 
 		 322 aa  651    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.11675  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1420  cysteinyl-tRNA synthetase  31.65 
 
 		 323 aa  125  1e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3272  cysteinyl-tRNA synthetase  25.98 
 
 		 392 aa  113  4.0000000000000004e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2106  hypothetical protein  23.6 
 
 		 302 aa  83.6  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.844619 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0991  cysteinyl-tRNA synthetase  28.38 
 
 		 286 aa  82.4  0.00000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00231888  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2500  hypothetical protein  25.21 
 
 		 462 aa  71.6  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.967827  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0530  hypothetical protein  25.25 
 
 		 448 aa  67  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2446  TM1410 hypothetical-related protein  27.15 
 
 		 369 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2053  TM1410 hypothetical-related protein  28.06 
 
 		 368 aa  63.2  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.514202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1498  hypothetical protein  24.87 
 
 		 391 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3631  hypothetical protein  27.78 
 
 		 275 aa  61.2  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3735  hypothetical protein  28.49 
 
 		 412 aa  58.9  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.756384  normal  0.0338258 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4070  hypothetical protein  29.2 
 
 		 357 aa  58.9  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.141328  normal  0.0763536 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0535  hypothetical protein  27.54 
 
 		 908 aa  58.9  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000617771  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2241  hypothetical protein  25.34 
 
 		 299 aa  57  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.22813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2532  TM1410 hypothetical-related protein  21.49 
 
 		 262 aa  55.8  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0653448  normal  0.537266 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2968  hypothetical protein  23.59 
 
 		 395 aa  53.1  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1000  TM1410 hypothetical-related protein  36.84 
 
 		 307 aa  52.8  0.000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2438  hypothetical protein  32.97 
 
 		 482 aa  50.8  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.349941  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3224  hypothetical protein  25.93 
 
 		 299 aa  50.4  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22100  hypothetical protein  28.17 
 
 		 258 aa  50.4  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00255841 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08154  conserved hypothetical protein  25.77 
 
 		 336 aa  49.7  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.809637 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4079  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  25.37 
 
 		 485 aa  48.9  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237943  normal  0.0279439 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3133  hypothetical protein  22.35 
 
 		 314 aa  46.2  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1962  hypothetical protein  24.11 
 
 		 917 aa  45.8  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000223558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1184  endo alpha-1,4 polygalactosaminidase, putative  28.57 
 
 		 313 aa  45.1  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1609  hypothetical protein  24.32 
 
 		 273 aa  44.7  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02953  endo alpha-1,4 polygalactosaminidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07890)  29.67 
 
 		 314 aa  43.9  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0681  endo alpha-1,4 polygalactosaminidase precusor  31.87 
 
 		 268 aa  43.9  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2649  extracellular endo alpha-1 4 polygalactosaminidase or related polysaccharide hydrolase-like  25.81 
 
 		 374 aa  42.7  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>