More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0637 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0637  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 174 aa  358  2e-98  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.553614  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0445  isochorismatase hydrolase  56.9 
 
 		 174 aa  209  1e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000176183  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0073  isochorismatase hydrolase  55.62 
 
 		 176 aa  209  1e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0460  isochorismatase hydrolase  56.32 
 
 		 174 aa  206  2e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000118146  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2831  isochorismatase hydrolase  42.86 
 
 		 176 aa  140  6e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2603  isochorismatase hydrolase  38.15 
 
 		 193 aa  131  3.9999999999999996e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  39.02 
 
 		 201 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1124  isochorismatase hydrolase  36.26 
 
 		 196 aa  125  4.0000000000000003e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.590608  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  38.18 
 
 		 201 aa  124  5e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0248  isochorismatase hydrolase  36.31 
 
 		 185 aa  122  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0413  isochorismatase hydrolase  41.46 
 
 		 201 aa  121  6e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.500644  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  38.04 
 
 		 203 aa  120  9.999999999999999e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1717  isochorismatase hydrolase  40.85 
 
 		 201 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00000789432 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  40.35 
 
 		 180 aa  118  3.9999999999999996e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1527  isochorismatase hydrolase  35.67 
 
 		 199 aa  116  9.999999999999999e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.578611 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0906  isochorismatase hydrolase  37.64 
 
 		 193 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.312292  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1336  isochorismatase hydrolase  36.59 
 
 		 204 aa  115  1.9999999999999998e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0175146  normal  0.297177 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  33.92 
 
 		 214 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2761  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  35.26 
 
 		 198 aa  103  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  33.93 
 
 		 193 aa  103  1e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1314  isochorismatase hydrolase  35.63 
 
 		 172 aa  103  1e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.164435  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2083  isochorismatase hydrolase  35 
 
 		 182 aa  102  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0890304  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0828  isochorismatase hydrolase  35.26 
 
 		 202 aa  102  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0602  isochorismatase hydrolase  34.62 
 
 		 192 aa  101  5e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0105  isochorismatase hydrolase  35.76 
 
 		 188 aa  101  6e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.463699  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3082  isochorismatase family protein  35.56 
 
 		 182 aa  100  8e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000597737 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2241  isochorismatase family protein  35.56 
 
 		 182 aa  100  9e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.025604  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2288  isochorismatase family protein  35.56 
 
 		 182 aa  99.8  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0832099  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2370  isochorismatase family protein  35 
 
 		 182 aa  98.6  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.108087  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2043  pyrazinamidase  35 
 
 		 182 aa  98.2  6e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00201028  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2285  isochorismatase family protein  35 
 
 		 182 aa  98.2  6e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.21607e-26 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2628  isochorismatase hydrolase  33.15 
 
 		 183 aa  96.3  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2041  pyrazinamidase  35 
 
 		 182 aa  95.9  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.228157  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1537  isochorismatase hydrolase  34.25 
 
 		 183 aa  92.8  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1242  isochorismatase family protein  35 
 
 		 184 aa  92.8  2e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000303599 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2374  isochorismatase hydrolase  32.8 
 
 		 199 aa  92.4  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000188598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3660  isochorismatase hydrolase  33.77 
 
 		 213 aa  92.4  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0150605  normal  0.0962565 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0399  isochorismatase hydrolase  32.93 
 
 		 192 aa  91.7  4e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5162  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 203 aa  92  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0136889 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1739  isochorismatase hydrolase  32.53 
 
 		 196 aa  89.4  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00170664  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0141  isochorismatase hydrolase  31.03 
 
 		 191 aa  87.4  8e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1079  isochorismatase hydrolase  31.03 
 
 		 189 aa  87.4  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1454  isochorismatase family protein  32.78 
 
 		 184 aa  86.7  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0526786  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1211  nicotinamidase  37.31 
 
 		 206 aa  86.7  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0305346 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2226  isochorismatase hydrolase  32.35 
 
 		 188 aa  86.3  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1659  isochorismatase hydrolase  29.38 
 
 		 180 aa  85.1  4e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.262359  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2290  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  30.98 
 
 		 201 aa  84.3  7e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0202  isochorismatase hydrolase  30.54 
 
 		 190 aa  84.3  8e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00287334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22170  nicotinamidase-like amidase  31.79 
 
 		 197 aa  84.3  8e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000776565  normal  0.0158237 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1355  isochorismatase hydrolase  32.69 
 
 		 195 aa  84  9e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0606  isochorismatase hydrolase  33.72 
 
 		 200 aa  83.6  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1908  isochorismatase hydrolase  34.09 
 
 		 205 aa  83.6  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.460102 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0036  nicotinamidase  27.27 
 
 		 201 aa  82  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1368  pyrazinamidase/nicotinamidase  27.27 
 
 		 201 aa  81.6  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46220  nicotinamidase  28.33 
 
 		 207 aa  81.6  0.000000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.790768  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0871  isochorismatase hydrolase  28.81 
 
 		 178 aa  81.3  0.000000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.317325  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2008  isochorismatase hydrolase  33.89 
 
 		 186 aa  81.3  0.000000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1974  isochorismatase hydrolase  33.89 
 
 		 186 aa  81.3  0.000000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0859  pyrazinamidase/nicotinamidase  37.5 
 
 		 166 aa  80.9  0.00000000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0368  amidase  30 
 
 		 185 aa  80.5  0.00000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0822  Nicotinamidase  29.5 
 
 		 210 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0359505  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2142  isochorismatase hydrolase  32.39 
 
 		 195 aa  79.7  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3153  isochorismatase hydrolase  32.75 
 
 		 196 aa  79.3  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.369391 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0972  isochorismatase hydrolase  28.49 
 
 		 190 aa  79  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0651  pyrazinamidase/nicotinamidase  31.45 
 
 		 206 aa  78.6  0.00000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.972154  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1739  isochorismatase hydrolase  31.33 
 
 		 221 aa  78.2  0.00000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0101718 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1760  bifunctional pyrazinamidase/nicotinamidase hydrolase  25.37 
 
 		 210 aa  78.2  0.00000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.130919  normal  0.138691 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6446  isochorismatase hydrolase  30.05 
 
 		 236 aa  77.8  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.0975575 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2254  isochorismatase hydrolase  31.46 
 
 		 210 aa  77.8  0.00000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1085  amidase  29.05 
 
 		 181 aa  77.8  0.00000000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1963  isochorismatase hydrolase  30.34 
 
 		 210 aa  77  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0190447  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0263  isochorismatase hydrolase  32.87 
 
 		 189 aa  77  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2473  isochorismatase hydrolase  27.81 
 
 		 192 aa  76.3  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2724  nicotinamidase/pyrazinamidase  27.69 
 
 		 210 aa  76.3  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00509557  hitchhiker  0.00329299 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1968  nicotinamidase/pyrazinamidase  30.26 
 
 		 215 aa  76.3  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0424644  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2976  isochorismatase hydrolase  25.56 
 
 		 190 aa  76.3  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391176  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3317  isochorismatase hydrolase  28.49 
 
 		 193 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1446  Nicotinamidase  28.5 
 
 		 213 aa  75.9  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.471389  normal  0.0104691 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1461  putative nicotinamidase/pyrazinamidase  30.59 
 
 		 193 aa  75.5  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000289367  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1984  nicotinamidase/pyrazinamidase  28.9 
 
 		 215 aa  75.1  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000169468  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2374  putative pyrazinamidase / nicotinamidase  32.8 
 
 		 192 aa  75.5  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1290  isochorismatase hydrolase  31.29 
 
 		 209 aa  75.1  0.0000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.534089  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1488  isochorismatase hydrolase  28.65 
 
 		 189 aa  75.5  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2348  nicotinamidase/pyrazinamidase  28.9 
 
 		 215 aa  75.1  0.0000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000299891  normal  0.0437872 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2093  nicotinamidase/pyrazinamidase  28.9 
 
 		 215 aa  75.1  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0331374  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0026  nicotinamidase  26.67 
 
 		 201 aa  74.7  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4507  nicotinamidase  30.46 
 
 		 206 aa  74.7  0.0000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.431554  normal  0.212939 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2641  isochorismatase hydrolase  35.25 
 
 		 195 aa  74.7  0.0000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3562  isochorismatase hydrolase  26.44 
 
 		 177 aa  74.7  0.0000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.357759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0016  isochorismatase hydrolase  28.98 
 
 		 179 aa  74.3  0.0000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.392436  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2104  isochorismatase  41.84 
 
 		 102 aa  73.9  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.582746  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0123  isochorismatase hydrolase  28.86 
 
 		 188 aa  73.9  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0481  isochorismatase hydrolase  31.71 
 
 		 186 aa  73.6  0.000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0189  putative pyrazinamidase/nicotinamidase  29.73 
 
 		 237 aa  72.8  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl340  nicotinamidase/pyrazinamidase  32.67 
 
 		 163 aa  72.8  0.000000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.148128  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2027  isochorismatase hydrolase  26.2 
 
 		 240 aa  72.8  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0107803  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0023  isochorismatase family protein  28.98 
 
 		 179 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000151833  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4273  Nicotinamidase  30.56 
 
 		 208 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00705625  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0017  isochorismatase family protein  28.98 
 
 		 179 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0209161  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1846  isochorismatase hydrolase  25.73 
 
 		 216 aa  72.4  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0666128  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>