More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0626 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0626  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 408 aa  842    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000892518  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  53.2 
 
 		 417 aa  446  1.0000000000000001e-124  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2391  extracellular solute-binding protein family 1  47.09 
 
 		 422 aa  378  1e-103  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.436445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2016  extracellular solute-binding protein  44.36 
 
 		 408 aa  366  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2008  ABC transporter extracellular solute-binding protein  44.47 
 
 		 408 aa  363  3e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.247518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5201  extracellular solute-binding protein  43 
 
 		 420 aa  319  7e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5658  extracellular solute-binding protein  43 
 
 		 420 aa  319  7e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0866592  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5487  extracellular solute-binding protein  43.52 
 
 		 419 aa  318  1e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000866815 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4577  extracellular solute-binding protein  43.78 
 
 		 419 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216886 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4586  extracellular solute-binding protein family 1  42.23 
 
 		 417 aa  318  1e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.947174 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1010  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  39.38 
 
 		 380 aa  317  2e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.283496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4932  extracellular solute-binding protein  43.52 
 
 		 419 aa  318  2e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0556288 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3196  extracellular solute-binding protein  43.26 
 
 		 419 aa  316  6e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.461238  normal  0.154514 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5736  ABC transporter, substrate-binding protein  41.1 
 
 		 410 aa  311  1e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214535  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1248  extracellular solute-binding protein family 1  41.41 
 
 		 414 aa  310  4e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.494424  normal  0.639356 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2351  extracellular solute-binding protein  42.38 
 
 		 421 aa  308  8e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.576024  normal  0.167209 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2572  extracellular solute-binding protein  37.5 
 
 		 414 aa  301  2e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1184  ABC transporter, substrate-binding protein  39.13 
 
 		 413 aa  298  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.186568  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2818  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  39.21 
 
 		 399 aa  297  3e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3483  extracellular solute-binding protein  40.46 
 
 		 417 aa  295  1e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4880  extracellular solute-binding protein  39.04 
 
 		 412 aa  276  4e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3285  extracellular solute-binding protein  39.04 
 
 		 412 aa  276  4e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6024  extracellular solute-binding protein  38.77 
 
 		 412 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6324  extracellular solute-binding protein  38.5 
 
 		 412 aa  273  3e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3838  extracellular solute-binding protein  39.69 
 
 		 420 aa  269  8e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.754768  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0940  extracellular solute-binding protein family 1  36.62 
 
 		 441 aa  267  2e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.558741 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2652  extracellular solute-binding protein family 1  38.31 
 
 		 424 aa  265  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2327  extracellular solute-binding protein family 1  37.29 
 
 		 424 aa  260  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.169538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0616  extracellular solute-binding protein family 1  34.52 
 
 		 432 aa  233  6e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3469  extracellular solute-binding protein family 1  33.42 
 
 		 446 aa  223  4.9999999999999996e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4906  extracellular solute-binding protein family 1  35.2 
 
 		 438 aa  223  6e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.507884  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1001  extracellular solute-binding protein family 1  34.28 
 
 		 427 aa  218  1e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.628257  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7922  extracellular solute-binding protein family 1  36.68 
 
 		 445 aa  215  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3169  extracellular solute-binding protein family 1  31.55 
 
 		 445 aa  196  8.000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.187022 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3379  extracellular solute-binding protein  31.3 
 
 		 445 aa  192  1e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  29.43 
 
 		 431 aa  152  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3985  extracellular solute-binding protein  27.97 
 
 		 631 aa  152  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0580929  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  28.72 
 
 		 434 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2716  extracellular solute-binding protein family 1  25.62 
 
 		 441 aa  125  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0818  extracellular solute-binding protein  28.16 
 
 		 415 aa  122  8e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13140  extracellular solute-binding protein family 1  26.06 
 
 		 424 aa  122  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3251  extracellular solute-binding protein family 1  28.3 
 
 		 427 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1924  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 		 415 aa  118  1.9999999999999998e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.121968  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  27.2 
 
 		 495 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1808  extracellular solute-binding protein family 1  26.69 
 
 		 414 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0614  extracellular solute-binding protein family 1  24.26 
 
 		 435 aa  110  5e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2306  extracellular solute-binding protein family 1  23.94 
 
 		 432 aa  109  7.000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.432824  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1874  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  26.96 
 
 		 427 aa  108  2e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0756635  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0803  extracellular solute-binding protein  24.62 
 
 		 435 aa  107  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0208  extracellular solute-binding protein family 1  25.53 
 
 		 454 aa  105  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2703  extracellular solute-binding protein family 1  25.07 
 
 		 423 aa  103  5e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.830349  normal  0.531916 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2696  extracellular solute-binding protein  25.31 
 
 		 420 aa  103  6e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.240659  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1094  extracellular solute-binding protein  28.05 
 
 		 434 aa  103  6e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.161365  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0200  extracellular solute-binding protein family 1  25.08 
 
 		 441 aa  102  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1174  extracellular solute-binding protein  25.46 
 
 		 455 aa  101  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273661  normal  0.401546 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1355  extracellular solute-binding protein  28.3 
 
 		 422 aa  101  2e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.120515 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2151  extracellular solute-binding protein family 1  25.68 
 
 		 466 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0168  extracellular solute-binding protein family 1  23.85 
 
 		 412 aa  101  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2380  extracellular solute-binding protein family 1  23.82 
 
 		 415 aa  101  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0944  extracellular solute-binding protein  23.06 
 
 		 422 aa  100  4e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.544942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1113  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  25.68 
 
 		 419 aa  100  6e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0203061  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2345  extracellular solute-binding protein family 1  25.89 
 
 		 424 aa  100  6e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1529  extracellular solute-binding protein  23.75 
 
 		 439 aa  99.4  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5137  extracellular solute-binding protein  27.32 
 
 		 433 aa  97.8  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.319423  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1588  extracellular solute-binding protein  24.43 
 
 		 452 aa  96.7  6e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1619  putative sugar-binding lipoprotein  24.86 
 
 		 434 aa  96.3  9e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.195944  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3494  extracellular solute-binding protein  25.97 
 
 		 414 aa  95.5  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0194042 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31540  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.61 
 
 		 458 aa  95.5  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.197851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2098  extracellular solute-binding protein family 1  26.96 
 
 		 411 aa  95.1  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.072788 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0090  extracellular solute-binding protein  25.37 
 
 		 441 aa  94.7  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.214251  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1133  extracellular solute-binding protein family 1  24.11 
 
 		 451 aa  94.7  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4568  extracellular solute-binding protein family 1  32.18 
 
 		 410 aa  94  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.267408  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2337  extracellular solute-binding protein family 1  29.27 
 
 		 411 aa  93.6  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.836128  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6357  extracellular solute-binding protein family 1  30.69 
 
 		 410 aa  93.6  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1025  extracellular solute-binding protein family 1  24.79 
 
 		 444 aa  92.8  9e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000399953  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0092  extracellular solute-binding protein  26.55 
 
 		 425 aa  92  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3651  hypothetical protein  24.45 
 
 		 437 aa  92.8  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.943877  normal  0.0762923 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7939  ABC transporter (substrate-binding protein)  23.8 
 
 		 428 aa  92  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.50295  normal  0.560439 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27700  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.87 
 
 		 426 aa  92  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0238  extracellular solute-binding protein family 1  22.06 
 
 		 423 aa  91.7  2e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3613  extracellular solute-binding protein family 1  27 
 
 		 429 aa  90.5  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.249837  normal  0.747368 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2265  extracellular solute-binding protein family 1  22.54 
 
 		 418 aa  90.5  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1625  alpha-glucoside ABC transporter periplasmic- binding protein  25 
 
 		 442 aa  90.9  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.234885  normal  0.190993 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4017  extracellular solute-binding protein  23.64 
 
 		 435 aa  90.9  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3941  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  24.86 
 
 		 436 aa  89.7  7e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.487085  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1728  extracellular solute-binding protein  26.28 
 
 		 411 aa  89.7  9e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00458236  normal  0.504509 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3251  extracellular solute-binding protein family 1  28.2 
 
 		 428 aa  89.4  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.292164  normal  0.0559218 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0115  extracellular solute-binding protein family 1  26.13 
 
 		 478 aa  88.6  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.132691  normal  0.193469 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2950  extracellular solute-binding protein  23.13 
 
 		 435 aa  88.2  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.110397  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2626  extracellular solute-binding protein family 1  24.75 
 
 		 455 aa  87.8  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0491272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0905  extracellular solute-binding protein  25.36 
 
 		 412 aa  87.4  4e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3657  sugar ABC transporter, substrate-binding protein  20.66 
 
 		 423 aa  87  6e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2999  extracellular solute-binding protein  22.92 
 
 		 419 aa  86.7  6e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.662901  hitchhiker  0.0000395876 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0598  extracellular solute-binding protein family 1  25.85 
 
 		 446 aa  86.7  6e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.764573  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0996  extracellular solute-binding protein family 1  25.54 
 
 		 455 aa  86.7  7e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3264  extracellular solute-binding protein  25.3 
 
 		 416 aa  86.7  7e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.591163 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0434  extracellular solute-binding protein  25.58 
 
 		 452 aa  85.5  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.396307 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23430  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.94 
 
 		 435 aa  85.5  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.969599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8236  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.84 
 
 		 434 aa  84.3  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.953199  normal  0.764848 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01480  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.28 
 
 		 435 aa  84.3  0.000000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>