More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0612 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0612  2-nitropropane dioxygenase NPD  100 
 
 
323 aa  652  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  6.94328e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1587  2-nitropropane dioxygenase, NPD  75 
 
 
309 aa  444  1e-123  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  4.31839e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0128  2-nitropropane dioxygenase, NPD  70.68 
 
 
314 aa  430  1e-119  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0565011  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0126  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  70.68 
 
 
314 aa  430  1e-119  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0317277  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1035  2-nitropropane dioxygenase NPD  58.9 
 
 
317 aa  360  2e-98  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0997484  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1099  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  52.75 
 
 
326 aa  330  2e-89  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  6.64093e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2074  2-nitropropane dioxygenase, NPD  52.27 
 
 
315 aa  317  1e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  6.55776e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1358  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  50.48 
 
 
316 aa  317  1e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  2.52963e-05  normal  0.0405419 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1725  2-nitropropane dioxygenase, NPD  53.53 
 
 
313 aa  316  4e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  2.1316e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1178  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  50 
 
 
316 aa  309  4e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  7.36816e-09  hitchhiker  0.00901561 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1852  2-nitropropane dioxygenase-like protein  47.47 
 
 
317 aa  303  2e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00272263  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0431  trans-2-enoyl-ACP reductase II  53.49 
 
 
321 aa  302  6e-81  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10270  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  54.66 
 
 
320 aa  300  2e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0212117  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3819  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  49.68 
 
 
315 aa  294  1e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  6.61973e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0311  dioxygenase  50 
 
 
321 aa  293  2e-78  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0640  2-nitropropane dioxygenase, NPD  51.95 
 
 
316 aa  292  6e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  6.97959e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0346  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  51.13 
 
 
319 aa  287  1e-76  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.182837  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1989  2-nitropropane dioxygenase NPD  49.17 
 
 
325 aa  285  1e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01050  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  49.66 
 
 
314 aa  279  5e-74  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.250641 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11150  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  51.05 
 
 
323 aa  276  2e-73  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0946  2-nitropropane dioxygenase, NPD  54.17 
 
 
313 aa  276  3e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00349563  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7295  2-nitropropane dioxygenase NPD  48.39 
 
 
311 aa  259  4e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1591  dioxygenase  45.95 
 
 
318 aa  254  2e-66  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.600793  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0098  2-nitropropane dioxygenase NPD  44.62 
 
 
313 aa  234  1e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.718222  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00985  putative dioxygenase  45.7 
 
 
314 aa  234  1e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1416  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  43.14 
 
 
313 aa  228  9e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.578712 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3609  2-nitropropane dioxygenase, NPD  42.72 
 
 
323 aa  227  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0964  2-nitropropane dioxygenase NPD  41.82 
 
 
319 aa  226  5e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0729206  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3672  2-nitropropane dioxygenase  42.67 
 
 
311 aa  221  1e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1839  2-nitropropane dioxygenase NPD  42.45 
 
 
319 aa  220  2e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3574  2-nitropropane dioxygenase, NPD  40.26 
 
 
331 aa  218  1e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  1.29826e-08  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2858  2-nitropropane dioxygenase NPD  43.13 
 
 
316 aa  215  9e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0974  trans-2-enoyl-ACP reductase II  35.91 
 
 
348 aa  210  3e-53  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6828  2-nitropropane dioxygenase NPD  40 
 
 
325 aa  210  3e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.670939  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6901  2-nitropropane dioxygenase NPD  39.17 
 
 
328 aa  208  9e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0152  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.94 
 
 
345 aa  208  1e-52  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.174988  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1008  2-nitropropane dioxygenase, NPD  43.04 
 
 
323 aa  206  3e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1170  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  38.22 
 
 
342 aa  206  5e-52  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5434  2-nitropropane dioxygenase NPD  41.01 
 
 
323 aa  202  4e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.295794  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6053  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.46 
 
 
335 aa  202  5e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.483236  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3833  2-nitropropane dioxygenase, NPD  41.64 
 
 
324 aa  202  8e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1401  2-nitropropane dioxygenase NPD  40.65 
 
 
324 aa  201  1e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1526  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.64 
 
 
355 aa  200  2e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.172251  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1075  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.31 
 
 
328 aa  200  3e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.192705  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5355  2-nitropropane dioxygenase NPD  39.05 
 
 
328 aa  199  4e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.660089  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2965  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.33 
 
 
338 aa  197  1e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.752049  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3001  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.66 
 
 
328 aa  197  2e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.152083  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2147  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.27 
 
 
334 aa  197  3e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0363  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.54 
 
 
325 aa  197  3e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0922  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.68 
 
 
319 aa  197  3e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2031  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.16 
 
 
342 aa  196  4e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28800  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  37.79 
 
 
324 aa  196  4e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.135482 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2390  2-nitropropane dioxygenase, NPD  43.04 
 
 
314 aa  196  4e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0521943  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1554  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.17 
 
 
324 aa  196  6e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.510846  normal  0.493902 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3433  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.19 
 
 
331 aa  195  9e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.995497  normal  0.0477625 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2021  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.54 
 
 
331 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.01256  normal  0.586253 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1961  dioxygenase  37.85 
 
 
281 aa  193  3e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2151  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.19 
 
 
332 aa  192  5e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.64006  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3013  2-nitropropane dioxygenase NPD  39.55 
 
 
324 aa  192  6e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.95223  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5534  2-nitropropane dioxygenase NPD  39.68 
 
 
323 aa  192  7e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4504  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.39 
 
 
338 aa  192  8e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.372283  normal  0.089603 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3732  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.23 
 
 
324 aa  191  1e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1009  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.42 
 
 
345 aa  188  9e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43560  predicted protein  34.53 
 
 
361 aa  187  1e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4186  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.1 
 
 
329 aa  187  2e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5146  putative 2-nitropropane dioxygenase  38.21 
 
 
334 aa  187  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.199752  normal  0.0588296 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0744  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.29 
 
 
354 aa  186  3e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.620911  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2356  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.44 
 
 
386 aa  186  4e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0726815 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1779  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.24 
 
 
377 aa  184  2e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.883896  normal  0.0611887 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0738  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.13 
 
 
325 aa  184  2e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.11052  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0133  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.54 
 
 
352 aa  184  2e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.899957  normal  0.134277 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3306  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.05 
 
 
342 aa  183  4e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.152065  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0937  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.23 
 
 
355 aa  182  5e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0580  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.7 
 
 
312 aa  182  5e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0919  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.23 
 
 
355 aa  182  5e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3064  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.74 
 
 
311 aa  182  6e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1855  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.33 
 
 
327 aa  181  1e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.798128  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5309  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.54 
 
 
380 aa  179  8e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.1832 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1526  2-nitropropane dioxygenase  35.01 
 
 
364 aa  179  8e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1088  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.59 
 
 
363 aa  178  1e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3599  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.03 
 
 
334 aa  177  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.465464 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2806  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.82 
 
 
353 aa  177  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.180087  decreased coverage  0.0002175 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1257  2-nitropropane dioxygenase (nitroalkane oxidase)  35.01 
 
 
364 aa  177  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1854  hypothetical protein  35.43 
 
 
316 aa  177  3e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0198092  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4367  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.01 
 
 
325 aa  176  5e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1483  2-nitropropane dioxygenase  34.45 
 
 
364 aa  176  7e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4576  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.19 
 
 
330 aa  175  8e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.403113  normal  0.255193 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0826  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.77 
 
 
332 aa  175  8e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.289165  normal  0.500407 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1419  nitropropane dioxygenase  33.89 
 
 
363 aa  174  1e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1457  2-nitropropane dioxygenase  35.11 
 
 
365 aa  174  1e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.907571 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1255  2-nitropropane dioxygenase (nitroalkane oxidase)  35.11 
 
 
364 aa  174  1e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1290  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.73 
 
 
378 aa  175  1e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.62886  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0544  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  34.94 
 
 
326 aa  174  2e-42  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2062  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.94 
 
 
369 aa  173  3e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2607  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.92 
 
 
353 aa  173  3e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0758  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.91 
 
 
331 aa  173  4e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1283  2-nitropropane dioxygenase  34.83 
 
 
364 aa  173  5e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1385  2-nitropropane dioxygenase  34.83 
 
 
364 aa  173  5e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13586  oxidoreductase  33.53 
 
 
355 aa  172  7e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00804869  normal  0.19405 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3924  nitropropane dioxygenase  33.89 
 
 
363 aa  171  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>