More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0580 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0580  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 391 aa  798    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1593  glycosyl transferase, group 1  37.97 
 
 		 403 aa  293  3e-78  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3118  glycosyl transferase group 1  32.3 
 
 		 390 aa  194  3e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.353961  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22830  glycosyl transferase group 1  30.53 
 
 		 385 aa  130  4.0000000000000003e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  27.85 
 
 		 390 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  26.85 
 
 		 391 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  25.25 
 
 		 398 aa  106  6e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  25.72 
 
 		 391 aa  106  7e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3572  glycosyl transferase, group 1  28.52 
 
 		 389 aa  105  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.483254  normal  0.0128829 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  29.2 
 
 		 378 aa  103  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  25.32 
 
 		 391 aa  103  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  24.34 
 
 		 391 aa  102  8e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  27.42 
 
 		 377 aa  101  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  26.59 
 
 		 406 aa  99.4  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  29.96 
 
 		 387 aa  98.2  2e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2141  glycosyltransferase  27.31 
 
 		 416 aa  97.8  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00102383  normal  0.405566 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3112  group 1 glycosyl transferase  27.57 
 
 		 390 aa  97.4  3e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1148  glycosyl transferase group 1  25.1 
 
 		 377 aa  97.1  5e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000501847  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  23.77 
 
 		 411 aa  96.7  7e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  24.92 
 
 		 373 aa  96.7  7e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0773  glycosyl transferase group 1  22.6 
 
 		 457 aa  95.9  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  27.74 
 
 		 388 aa  95.5  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  27.53 
 
 		 426 aa  94.4  3e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2517  glycosyl transferase group 1  24.31 
 
 		 405 aa  93.6  6e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.0541201 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  26.79 
 
 		 377 aa  93.2  7e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0670  glycosyl transferase, group 1  26.64 
 
 		 405 aa  92.8  9e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1365  glycosyl transferase, group 1  26.21 
 
 		 396 aa  92.4  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0275215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4910  glycosyl transferase group 1  26.95 
 
 		 388 aa  90.9  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.314758  hitchhiker  0.000347122 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1066  glycosyl transferase group 1  25.4 
 
 		 385 aa  90.1  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.552097 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1032  glycosyl transferase, group 1  24.7 
 
 		 384 aa  90.1  7e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1658  glycosyl transferase, group 1  29.92 
 
 		 372 aa  89.4  9e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00025615  hitchhiker  0.00378247 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0581  glycosyl transferase, group 1  23.11 
 
 		 405 aa  89.4  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0722  glycosyl transferase, group 1  27.24 
 
 		 357 aa  88.2  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.261837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5074  UDP-N-acetylglucosamine  22.52 
 
 		 418 aa  88.2  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838773  normal  0.526532 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4231  glycogen synthase  27.65 
 
 		 382 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.294207 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0485  putative glycosyl transferase  24.35 
 
 		 471 aa  88.2  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1354  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.6 
 
 		 382 aa  87.8  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1964  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 388 aa  87.8  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1089  glycosyl transferase group 1  29.23 
 
 		 355 aa  87.8  3e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  26.21 
 
 		 394 aa  87.4  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3695  glycosyl transferase group 1  25.59 
 
 		 388 aa  87.4  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.166947  normal  0.63748 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3829  glycosyl transferase, group 1  25.59 
 
 		 388 aa  87.4  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00562518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  28.36 
 
 		 394 aa  87  5e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  27.1 
 
 		 404 aa  86.7  6e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0050  glycosyl transferase  24.48 
 
 		 360 aa  86.7  7e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000688339  normal  0.0134291 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3732  glycosyl transferase group 1  26.17 
 
 		 388 aa  86.7  7e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.775732  normal  0.609704 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5555  glycosyl transferase, group 1  26.17 
 
 		 388 aa  86.7  7e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0857  glycosyl transferase group 1  28.52 
 
 		 355 aa  86.7  7e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123894  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0552  lipopolysaccharide biosynthesis protein, putative  25.49 
 
 		 388 aa  86.3  8e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.284297  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  27.31 
 
 		 422 aa  86.3  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3878  glycosyl transferase group 1  28.29 
 
 		 535 aa  86.3  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0840  glycosyl transferase group 1  25.1 
 
 		 398 aa  86.3  9e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.755568 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4534  glycosyl transferase, group 1  26.02 
 
 		 388 aa  86.3  9e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.429646  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0289  glycosyl transferase, group 1  22.18 
 
 		 405 aa  85.9  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6395  glycosyl transferase group 1  26.94 
 
 		 390 aa  85.5  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.229647 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  24.53 
 
 		 388 aa  85.5  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4001  glycogen synthase  26.62 
 
 		 382 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0312479  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4075  glycogen synthase  26.62 
 
 		 382 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  25.08 
 
 		 410 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1102  glycosyl transferase group 1  28.85 
 
 		 358 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  24.03 
 
 		 394 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  24.92 
 
 		 396 aa  84.7  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2237  glycosyl transferase, group 1  24.21 
 
 		 388 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3748  glycosyl transferase  24 
 
 		 358 aa  84  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.985214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0116  glycosyl transferase group 1  24.68 
 
 		 341 aa  84  0.000000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000347461 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  21.76 
 
 		 390 aa  84  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3880  glycosyl transferase group 1  25.92 
 
 		 455 aa  84  0.000000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0901  hypothetical protein  23.41 
 
 		 372 aa  83.6  0.000000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0357056 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1586  glycosyl transferase, group 1  27.82 
 
 		 355 aa  84  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.381696  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2267  glycosyl transferase, group 1  25.3 
 
 		 388 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.370121  normal  0.159353 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1923  glycosyl transferase, group 1  26.02 
 
 		 368 aa  83.6  0.000000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.80295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1723  glycosyl transferase, group 1  27.93 
 
 		 380 aa  83.6  0.000000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.952593  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  25.54 
 
 		 398 aa  83.6  0.000000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  23.46 
 
 		 348 aa  83.2  0.000000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0293  glycosyl transferase, group 1  23.57 
 
 		 406 aa  83.2  0.000000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.551542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  28.97 
 
 		 401 aa  82.8  0.000000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0185  glycosyl transferase, group 1  29.19 
 
 		 406 aa  82.4  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0720154  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0183  glycosyl transferase group 1  29.19 
 
 		 406 aa  82.4  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  25.17 
 
 		 436 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  24.05 
 
 		 394 aa  82.4  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  26.28 
 
 		 408 aa  82.4  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2950  glycosyl transferase group 1  28.73 
 
 		 899 aa  81.6  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1365  glycosyl transferase group 1  26.78 
 
 		 414 aa  81.6  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000226511 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1973  glycosyl transferase, group 1  22.4 
 
 		 416 aa  81.6  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2594  glycosyl transferase group 1  22.78 
 
 		 421 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  25.16 
 
 		 382 aa  82  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  26.2 
 
 		 396 aa  82  0.00000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01600  glycogen synthase  24.7 
 
 		 404 aa  81.6  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  25.56 
 
 		 371 aa  80.5  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  26.14 
 
 		 383 aa  80.1  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  26.33 
 
 		 536 aa  80.1  0.00000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1551  glycosyl transferase, group 1  23.71 
 
 		 407 aa  79.7  0.00000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  21.2 
 
 		 446 aa  79.7  0.00000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3146  glycosyl transferase group 1  23.33 
 
 		 384 aa  79  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.833609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2470  glycosyl transferase, group 1  23.29 
 
 		 345 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  25.81 
 
 		 374 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3582  glycosyl transferase group 1  24.79 
 
 		 381 aa  79.3  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02595  glycosyltransferase  24.59 
 
 		 382 aa  79  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.157205  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0354  glycosyl transferase group 1  22.39 
 
 		 402 aa  79.3  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000079613  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1998  glycosyl transferase group 1  21.72 
 
 		 379 aa  79.3  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.312706 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>