61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0546 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0546  hypothetical protein  100 
 
 
156 aa  318  2e-86  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  5.63714e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1046  transcriptional regulator  32.85 
 
 
148 aa  77  1e-13  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18301  transcription regulator  33.1 
 
 
143 aa  71.2  5e-12  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18511  transcription regulator  30.99 
 
 
143 aa  70.5  9e-12  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.630467  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1734  transcription regulator-like  30.99 
 
 
143 aa  69.7  2e-11  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.24686  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18321  transcription regulator  29.63 
 
 
143 aa  66.2  1e-10  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0784  transcription regulator  29.05 
 
 
141 aa  63.9  7e-10  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0106274  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2963  hypothetical protein  24.11 
 
 
162 aa  62.4  2e-09  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.427148 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0949  transcriptional regulator  28.26 
 
 
147 aa  61.6  4e-09  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16341  hypothetical protein  29.05 
 
 
141 aa  60.5  8e-09  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.832148  normal  0.369821 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2390  hypothetical protein  23.48 
 
 
162 aa  57.8  6e-08  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0497  hypothetical protein  26.57 
 
 
140 aa  56.2  1e-07  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.445375 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1456  hypothetical protein  25.22 
 
 
150 aa  56.2  2e-07  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0229  hypothetical protein  24.39 
 
 
146 aa  53.9  8e-07  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.532688 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1330  hypothetical protein  26.81 
 
 
140 aa  53.9  9e-07  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.522262  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0469  hypothetical protein  22.12 
 
 
149 aa  53.5  1e-06  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2776  hypothetical protein  28.46 
 
 
143 aa  52  3e-06  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.857433  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1198  hypothetical protein  29.2 
 
 
159 aa  50.8  7e-06  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.198926  normal  0.424517 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1480  hypothetical protein  26.32 
 
 
147 aa  50.8  8e-06  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0812  transcriptional regulator-related protein  25.87 
 
 
167 aa  50.4  9e-06  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1399  hypothetical protein  23.36 
 
 
148 aa  50.4  1e-05  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1060  protein of unknown function DUF1486  21.62 
 
 
159 aa  50.1  1e-05  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.148569  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5879  hypothetical protein  21.74 
 
 
134 aa  50.1  1e-05  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.701907  normal  0.17996 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3601  hypothetical protein  25.27 
 
 
132 aa  48.5  4e-05  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1483  hypothetical protein  24.44 
 
 
156 aa  48.5  4e-05  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3035  hypothetical protein  30.51 
 
 
167 aa  48.1  4e-05  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.21304  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1070  hypothetical protein  25.86 
 
 
140 aa  48.1  5e-05  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3053  transcriptional regulator-related protein  29.27 
 
 
148 aa  48.1  5e-05  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1310  transcriptional regulator-related protein  29.27 
 
 
148 aa  47.8  6e-05  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5328  hypothetical protein  26.61 
 
 
157 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0131441 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2513  hypothetical protein  25.27 
 
 
132 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.170806  normal  0.406315 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5410  protein of unknown function DUF1486  27.43 
 
 
163 aa  47  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.691604  normal  0.630541 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2291  hypothetical protein  27.17 
 
 
125 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0242262 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2470  ketosteroid isomerase-related protein, cystatin fold  22.92 
 
 
147 aa  47  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.4042  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0636  putative transcriptional regulator  28.24 
 
 
142 aa  46.6  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  2.20026e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01435  hypothetical protein  28.15 
 
 
146 aa  45.8  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3210  transcriptional regulator-related protein  29.91 
 
 
148 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.821326 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1079  hypothetical protein  28.04 
 
 
163 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3067  transcriptional regulator-related protein  29.27 
 
 
148 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0464  hypothetical protein  21.93 
 
 
148 aa  46.2  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0014  hypothetical protein  25.27 
 
 
130 aa  45.4  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.51836  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0979  hypothetical protein  27.97 
 
 
157 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3015  hypothetical protein  24.27 
 
 
140 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2738  hypothetical protein  24.27 
 
 
140 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.264165  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3674  hypothetical protein  28.32 
 
 
157 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0168299  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5607  hypothetical protein  28.32 
 
 
157 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.206103  normal  0.841881 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4693  hypothetical protein  28.32 
 
 
157 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0146781  normal  0.148088 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4074  hypothetical protein  21.24 
 
 
149 aa  43.9  0.0008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.29566  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0978  hypothetical protein  30.09 
 
 
158 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.71902  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1127  hypothetical protein  28.32 
 
 
157 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.236072 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3171  hypothetical protein  23.81 
 
 
140 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0218513  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1261  hypothetical protein  25.19 
 
 
174 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.190288  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01814  hypothetical protein  26.67 
 
 
139 aa  43.5  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4269  hypothetical protein  32.22 
 
 
128 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.237355 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2713  transcriptional regulator-related protein  29.06 
 
 
145 aa  43.1  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003865  putative transcriptional regulator  25.83 
 
 
139 aa  42.4  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00111474  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0999  transcriptional regulator  24.82 
 
 
141 aa  41.6  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.859219  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4245  hypothetical protein  27.43 
 
 
156 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0971  hypothetical protein  29.91 
 
 
158 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1258  hypothetical protein  26.92 
 
 
137 aa  40.4  0.01  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.503521  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2085  hypothetical protein  30 
 
 
129 aa  40.4  0.01  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00513635  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>