More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0544 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0544  amine oxidase  100 
 
 		 525 aa  1055    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00189501  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0543  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  47.09 
 
 		 526 aa  480  1e-134  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00000116233  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4081  amine oxidase  21.44 
 
 		 571 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.39239 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03711  phytoene dehydrogenase  23.92 
 
 		 509 aa  92.8  1e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03701  phytoene dehydrogenase  24.06 
 
 		 509 aa  92  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0640229  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0345  phytoene dehydrogenase  22.82 
 
 		 509 aa  90.5  7e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0939  amine oxidase  25.95 
 
 		 496 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0893  amine oxidase  25.66 
 
 		 431 aa  81.3  0.00000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373233 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_715  FAD dependent oxidoreductase  22 
 
 		 500 aa  80.9  0.00000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0760  FAD dependent oxidoreductase  23.22 
 
 		 503 aa  79.3  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.522072 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5970  FAD dependent oxidoreductase  19.8 
 
 		 534 aa  78.6  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.633554  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0811  phytoene dehydrogenase  21.78 
 
 		 523 aa  76.3  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0324739  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2151  amine oxidase  22.74 
 
 		 508 aa  75.9  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2254  carotene isomerase  22.69 
 
 		 506 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000347702 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1308  carotene isomerase  22.86 
 
 		 512 aa  75.1  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2330  carotene isomerase  24.07 
 
 		 508 aa  74.7  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1336  carotene isomerase  22.62 
 
 		 512 aa  74.3  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0735245  hitchhiker  0.00100943 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1736  FAD dependent oxidoreductase  21.97 
 
 		 556 aa  73.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00685325  normal  0.215441 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3185  zeta-phytoene desaturase  22.61 
 
 		 492 aa  73.9  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00134863  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2512  FAD dependent oxidoreductase  20.11 
 
 		 497 aa  73.9  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.224928  normal  0.507466 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3112  FAD dependent oxidoreductase  23.31 
 
 		 506 aa  72.8  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.270711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3602  FAD dependent oxidoreductase  19.92 
 
 		 497 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1701  amine oxidase  22.22 
 
 		 503 aa  72.8  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00066646 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1888  carotenoid isomerase, putative  22.32 
 
 		 505 aa  71.6  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0874  amine oxidase  22.92 
 
 		 503 aa  71.6  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0766  amine oxidase  22.39 
 
 		 522 aa  70.9  0.00000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45243  carotenoid isomerase  20.73 
 
 		 598 aa  69.3  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0755538  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1763  FAD dependent oxidoreductase  24.39 
 
 		 498 aa  68.6  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0346  amine oxidase  23.3 
 
 		 494 aa  68.2  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03741  phytoene dehydrogenase  21.78 
 
 		 509 aa  67.8  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2970  phytoene desaturase  20.22 
 
 		 493 aa  67.4  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000576965 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1046  phytoene dehydrogenase  20.96 
 
 		 494 aa  67.4  0.0000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.586405  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2192  FAD dependent oxidoreductase  22.4 
 
 		 532 aa  67  0.0000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  22.14 
 
 		 554 aa  66.6  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2704  phytoene desaturase  20.37 
 
 		 498 aa  66.6  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4976  FAD dependent oxidoreductase  20.48 
 
 		 515 aa  66.6  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3185  hypothetical protein  43.9 
 
 		 245 aa  65.9  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29229  hitchhiker  0.00171019 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0735  FAD dependent oxidoreductase  21.95 
 
 		 563 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1684  phytoene desaturase  20.76 
 
 		 506 aa  65.9  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.127101  normal  0.929667 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2157  FAD dependent oxidoreductase  25.29 
 
 		 430 aa  65.1  0.000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02162  phytoene dehydrogenase  22.96 
 
 		 537 aa  65.1  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0319  amine oxidase  41.18 
 
 		 489 aa  65.1  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.354274 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2583  squalene synthase  21.14 
 
 		 502 aa  65.1  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.063443  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1637  hypothetical protein  25.38 
 
 		 516 aa  65.1  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1897  phytoene desaturase  20.49 
 
 		 499 aa  65.1  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.29228 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2637  squalene synthase  21.14 
 
 		 502 aa  65.1  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.359925  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3017  hypothetical protein  45 
 
 		 484 aa  64.7  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.191221  normal  0.019056 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1246  carotene isomerase  22.03 
 
 		 504 aa  64.3  0.000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3650  FAD dependent oxidoreductase  22.44 
 
 		 547 aa  63.5  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0318  FAD dependent oxidoreductase  23.91 
 
 		 547 aa  63.2  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0636  putative carotenoid isomerase  26.42 
 
 		 520 aa  62.4  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0484  phytoene desaturase  22.71 
 
 		 493 aa  62.8  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0436  All-trans-retinol 13,14-reductase  21.91 
 
 		 511 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.601478 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3134  amine oxidase  20.51 
 
 		 492 aa  62.4  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.954476  normal  0.604257 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2820  phytoene desaturase  21.02 
 
 		 498 aa  62.8  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1811  phytoene dehydrogenase-related protein  23.36 
 
 		 502 aa  61.6  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000642179  normal  0.0141145 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2710  phytoene desaturase  22.08 
 
 		 546 aa  62  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.487747 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0626  carotenoid isomerase, putative  22.32 
 
 		 507 aa  61.6  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2043  amine oxidase  49.12 
 
 		 476 aa  61.6  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0112057  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0845  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  20.18 
 
 		 740 aa  61.6  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3632  FAD dependent oxidoreductase  20.64 
 
 		 506 aa  61.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0761  hypothetical protein  19.53 
 
 		 510 aa  61.2  0.00000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2211  phytoene desaturase  19.89 
 
 		 531 aa  60.8  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.931782  normal  0.130578 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0577  All-trans-retinol 13,14-reductase  23.13 
 
 		 542 aa  60.8  0.00000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3228  Zeta-phytoene desaturase  24.06 
 
 		 519 aa  61.2  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.285222  normal  0.0185992 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0425  All-trans-retinol 13,14-reductase  21.83 
 
 		 511 aa  60.8  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1995  All-trans-retinol 13,14-reductase  23.72 
 
 		 499 aa  60.8  0.00000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3278  FAD dependent oxidoreductase  20.99 
 
 		 502 aa  60.8  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3374  amine oxidase  27.73 
 
 		 512 aa  60.5  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2373  phytoene desaturase  19.72 
 
 		 519 aa  60.1  0.00000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.145608  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1270  FAD dependent oxidoreductase  23.58 
 
 		 555 aa  59.3  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3573  phytoene desaturase  21.5 
 
 		 509 aa  59.7  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0731  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  23.15 
 
 		 500 aa  60.1  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.444322  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2816  FAD dependent oxidoreductase  25.64 
 
 		 530 aa  59.7  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09643  hypothetical protein  23.13 
 
 		 535 aa  60.1  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0783431  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2574  amine oxidase  56 
 
 		 455 aa  59.3  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.278816  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0489  hypothetical protein  21.96 
 
 		 509 aa  59.3  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14681  putative carotenoid isomerase  25.76 
 
 		 520 aa  59.3  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.314761  normal  0.880307 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1898  hypothetical protein  20.9 
 
 		 511 aa  58.2  0.0000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.405447  normal  0.754346 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1209  conserved hypothetical protein, FAD-binding domain protein  25.62 
 
 		 502 aa  58.5  0.0000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2672  amine oxidase  20.57 
 
 		 513 aa  57.8  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1847  phytoene dehydrogenase-related protein  20.26 
 
 		 503 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8013  hypothetical protein  42.31 
 
 		 524 aa  57.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1658  UDP-galactopyranose mutase  31.13 
 
 		 501 aa  57.8  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05841  putative carotenoid isomerase  24.01 
 
 		 516 aa  57.8  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.515676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17731  phytoene dehydrogenase  31.13 
 
 		 501 aa  57.8  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03731  hypothetical protein  21.85 
 
 		 938 aa  57.8  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.968761 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10011  putative carotenoid isomerase  23.73 
 
 		 520 aa  57.8  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.243247 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5620  phytoene desaturase  46.3 
 
 		 497 aa  57  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.476172 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0143  amine oxidase  21.33 
 
 		 519 aa  57.4  0.0000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6289  FAD dependent oxidoreductase  23.02 
 
 		 510 aa  57  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00968377  normal  0.473682 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1934  amine oxidase  30.51 
 
 		 396 aa  56.6  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12111  hypothetical protein  21.52 
 
 		 509 aa  56.6  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1137  UDP-galactopyranose mutase  34.19 
 
 		 505 aa  55.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26410  UDP-galactopyranose mutase  20.62 
 
 		 507 aa  55.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.739873 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1810  phytoene dehydrogenase family protein  24.55 
 
 		 499 aa  55.5  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.149228  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20111  phytoene dehydrogenase and related proteins  34.19 
 
 		 505 aa  55.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.428487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0871  amine oxidase  20.22 
 
 		 512 aa  55.1  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.598168  normal  0.0715769 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17571  phytoene dehydrogenase and related protein  39.13 
 
 		 501 aa  55.1  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.274386  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2545  phytoene desaturase  45.28 
 
 		 536 aa  55.1  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.139145  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>