More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0541 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0541  regulatory protein GntR HTH  100 
 
 
125 aa  249  6e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  3.36324e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0960  transcriptional regulator, GntR family  57.76 
 
 
120 aa  156  1e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0374  GntR family transcriptional regulator  56.03 
 
 
118 aa  149  8e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0664  GntR family transcriptional regulator  54.78 
 
 
122 aa  143  9e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1357  regulatory protein GntR, HTH  55.17 
 
 
120 aa  142  2e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6371  transcriptional regulator, GntR family  35.34 
 
 
127 aa  80.1  9e-15  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8884  transcriptional regulator, GntR family  42.68 
 
 
146 aa  73.6  8e-13  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0429  regulatory protein GntR HTH  35.04 
 
 
122 aa  73.6  1e-12  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0983  transcriptional regulator, GntR family  41.33 
 
 
131 aa  72.4  2e-12  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.589571  hitchhiker  0.00477023 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15470  regulatory protein GntR HTH  46.75 
 
 
321 aa  69.7  1e-11  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000230103  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2305  transcriptional regulator, GntR family  41.03 
 
 
126 aa  68.9  2e-11  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000453949  hitchhiker  0.000942984 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2244  GntR family transcriptional regulator  43.84 
 
 
130 aa  67.8  5e-11  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3575  transcriptional regulator, GntR family  41.46 
 
 
130 aa  67.8  5e-11  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00235324  hitchhiker  0.00495072 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4866  GntR family transcriptional regulator  40.26 
 
 
134 aa  67.4  6e-11  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0251878 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1388  transcriptional regulator, GntR family  31.58 
 
 
117 aa  67  8e-11  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.14957 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0996  transcriptional regulator, GntR family  41.1 
 
 
129 aa  67  9e-11  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.467589 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2352  transcriptional regulator, GntR family  32.93 
 
 
121 aa  66.6  1e-10  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0107  transcriptional regulator, GntR family  37.04 
 
 
126 aa  65.5  2e-10  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0882  transcriptional regulator, GntR family  42.47 
 
 
134 aa  65.5  3e-10  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.905481  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24450  transcriptional regulator, GntR family  31.86 
 
 
117 aa  65.1  3e-10  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.498075 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1919  transcriptional regulator, GntR family  45.95 
 
 
129 aa  64.7  4e-10  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1857  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.85 
 
 
468 aa  63.9  7e-10  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0631  transcriptional regulator, GntR family  44.93 
 
 
121 aa  63.9  7e-10  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1209  transcriptional regulator, GntR family  30.97 
 
 
118 aa  63.9  8e-10  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0188078 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1988  GntR family transcriptional regulator  41.56 
 
 
249 aa  62.8  1e-09  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0168  GntR family transcriptional regulator  38.03 
 
 
133 aa  62.8  1e-09  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
240 aa  63.5  1e-09  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2227  transcriptional regulator, GntR family  38.36 
 
 
129 aa  62.8  2e-09  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.426681  hitchhiker  0.00687189 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1345  GntR family transcriptional regulator  37.18 
 
 
130 aa  62  2e-09  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117764  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0169  transcriptional regulator, GntR family  39.71 
 
 
123 aa  62  2e-09  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1910  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.36 
 
 
462 aa  62  3e-09  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0901  putative transcriptional regulator  35.62 
 
 
554 aa  61.6  4e-09  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6591  GntR family transcriptional regulator  37.18 
 
 
130 aa  61.2  4e-09  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.30942  normal  0.691161 
 
 
-
 
NC_002950  PG1007  GntR family transcriptional regulator  40.62 
 
 
123 aa  61.2  5e-09  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.771657 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0118  transcriptional regulator, GntR family  35 
 
 
129 aa  60.5  7e-09  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  8.89333e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0162  regulatory protein GntR, HTH  32.17 
 
 
121 aa  59.7  1e-08  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000379114  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1061  phosphonate metabolism transcriptional regulator PhnF  36 
 
 
253 aa  59.7  1e-08  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488956  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1165  GntR family transcriptional regulator  37.84 
 
 
129 aa  59.3  1e-08  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  1.5678e-09  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1100  GntR family transcriptional regulator  36 
 
 
253 aa  59.7  1e-08  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2135  regulatory protein GntR, HTH  30.17 
 
 
121 aa  59.7  1e-08  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.696599  normal  0.323151 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2235  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
117 aa  59.7  1e-08  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0160  GntR family transcriptional regulator  32.17 
 
 
121 aa  59.7  1e-08  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  6.59048e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0430  transcriptional regulator, GntR family  37.65 
 
 
130 aa  59.3  2e-08  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0646  transcriptional regulator, GntR family  34.82 
 
 
137 aa  59.3  2e-08  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2197  GntR family transcriptional regulator  34.67 
 
 
256 aa  58.9  2e-08  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.6507  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0793  transcriptional regulator, GntR family  35.44 
 
 
120 aa  58.9  2e-08  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0185  GntR family transcriptional regulator  36.49 
 
 
122 aa  58.5  3e-08  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1108  transcriptional regulator  32 
 
 
122 aa  58.5  3e-08  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0952489  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02090  predicted transcriptional regulator  32.08 
 
 
156 aa  58.5  3e-08  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0086  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
126 aa  58.2  4e-08  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.266832  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0090  aminotransferase, MocR-like  35.14 
 
 
463 aa  57.8  4e-08  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1834  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.99 
 
 
467 aa  58.2  4e-08  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0688759  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2930  transcriptional regulator, GntR family  32.08 
 
 
259 aa  58.2  4e-08  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000160523  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1691  GntR family transcriptional regulator  35.21 
 
 
276 aa  57.4  7e-08  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0269955  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3223  regulatory protein GntR HTH  29.52 
 
 
115 aa  56.6  1e-07  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2154  GntR family transcriptional regulator  29.21 
 
 
125 aa  56.6  1e-07  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.75211 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2199  GntR family transcriptional regulator  34.44 
 
 
304 aa  56.6  1e-07  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.958543 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0025  transcriptional regulator  40.58 
 
 
481 aa  56.2  1e-07  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.17702 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1665  GntR family transcriptional regulator  30.12 
 
 
132 aa  56.2  1e-07  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.244402  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3936  transcriptional regulator, GntR family  32.89 
 
 
126 aa  56.6  1e-07  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.105249 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4447  GntR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
252 aa  56.2  1e-07  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.614266  normal  0.249195 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1133  regulatory protein GntR, HTH  37.5 
 
 
122 aa  55.8  2e-07  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7245  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 
286 aa  55.8  2e-07  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.375803  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0548  transcriptional regulator, GntR family  30.93 
 
 
123 aa  55.8  2e-07  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2387  transcriptional regulator, GntR family  34.57 
 
 
133 aa  56.2  2e-07  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.136165 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1600  GntR family regulatory protein  41.54 
 
 
493 aa  55.1  3e-07  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4290  GntR family transcriptional regulator  26.27 
 
 
133 aa  55.1  3e-07  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.518736  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2469  transcriptional regulator  34.78 
 
 
503 aa  55.1  3e-07  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0495293  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1682  transcriptional regulator  41.54 
 
 
493 aa  55.1  3e-07  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1052  transcriptional regulator, GntR family  36.36 
 
 
139 aa  55.1  3e-07  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681455 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2775  regulatory protein GntR HTH  34.38 
 
 
139 aa  55.1  3e-07  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.233655  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4136  GntR family transcriptional regulator  26.27 
 
 
133 aa  55.1  3e-07  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1402  GntR family transcriptional regulator, putative  41.18 
 
 
125 aa  55.5  3e-07  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4063  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
256 aa  55.1  3e-07  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0192  GntR family regulatory protein  41.54 
 
 
570 aa  55.1  3e-07  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3987  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
139 aa  55.1  3e-07  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.142638  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03590  transcriptional regulator, GntR family  29.67 
 
 
116 aa  55.1  3e-07  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.325087  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4186  transcriptional regulator, GntR family  36.36 
 
 
139 aa  55.1  3e-07  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0817984  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4298  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
139 aa  55.1  3e-07  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4553  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4209  transcriptional regulator, GntR family  36.36 
 
 
139 aa  55.1  3e-07  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  2.40895e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4061  GntR family transcriptional regulator  26.83 
 
 
121 aa  55.5  3e-07  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4146  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
139 aa  55.1  3e-07  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0366  transcriptional regulator, GntR family  30.83 
 
 
128 aa  55.1  3e-07  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0389778  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3817  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
139 aa  55.1  4e-07  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0938  GntR family transcriptional regulator  39.71 
 
 
122 aa  54.7  4e-07  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1472  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
126 aa  54.7  4e-07  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0707  transcriptional regulator, GntR family  27.93 
 
 
254 aa  54.7  4e-07  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2455  transcriptional regulator, GntR family  35.29 
 
 
128 aa  55.1  4e-07  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3833  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
139 aa  54.7  4e-07  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4569  regulatory protein GntR, HTH  33.77 
 
 
121 aa  54.7  4e-07  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.631024  normal  0.320661 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1077  regulatory protein GntR HTH  32.89 
 
 
126 aa  54.7  4e-07  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4098  transcriptional regulator, GntR family  36.36 
 
 
139 aa  54.7  4e-07  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.57441e-29 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2747  transcriptional regulator, GntR family  38.27 
 
 
165 aa  54.3  5e-07  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1229  transcriptional regulator, GntR family  26.83 
 
 
305 aa  54.7  5e-07  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2729  transcriptional regulator, GntR family  32 
 
 
134 aa  54.3  5e-07  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0268085 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3903  GntR family transcriptional regulator  37.84 
 
 
124 aa  54.3  5e-07  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000301963  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3297  hypothetical protein  38.36 
 
 
493 aa  54.3  5e-07  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0920316 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4270  GntR family transcriptional regulator  32.53 
 
 
254 aa  54.3  5e-07  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  2.12772e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0301  hypothetical protein  36.62 
 
 
228 aa  53.9  7e-07  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0306  FCD domain-containing protein  36.62 
 
 
228 aa  53.9  7e-07  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.438434  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>