More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0531 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0531  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 
386 aa  777  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  2.67349e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0508  extracellular ligand-binding receptor  44.5 
 
 
403 aa  320  3e-86  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000199641  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2733  Extracellular ligand-binding receptor  32.98 
 
 
407 aa  200  4e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3009  extracellular ligand-binding receptor  33.81 
 
 
415 aa  164  2e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  5.45529e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2750  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.75 
 
 
425 aa  162  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0109739  normal  0.254921 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2746  Extracellular ligand-binding receptor  30.66 
 
 
385 aa  161  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5877  putative branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic component  31.04 
 
 
379 aa  160  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3111  Extracellular ligand-binding receptor  30.29 
 
 
385 aa  161  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3153  extracellular ligand-binding receptor  32.13 
 
 
398 aa  160  5e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.154593  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5396  extracellular ligand-binding receptor  30.75 
 
 
378 aa  154  3e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4060  extracellular ligand-binding receptor  31.78 
 
 
384 aa  153  4e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.255859 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0920  extracellular ligand-binding receptor  28.8 
 
 
382 aa  153  6e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1221  Extracellular ligand-binding receptor  24.93 
 
 
472 aa  152  1e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0653937 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0712  putative lipoprotein  24.47 
 
 
480 aa  151  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3540  extracellular ligand-binding receptor  28.29 
 
 
377 aa  148  2e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.229705  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3748  extracellular ligand-binding receptor  28.41 
 
 
370 aa  147  3e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.178822  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3029  Extracellular ligand-binding receptor  28.41 
 
 
370 aa  147  3e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.518701  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2864  Leu/Ile/Val-binding signal peptide protein  30.45 
 
 
385 aa  144  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.110112  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1595  extracellular ligand-binding receptor  28.61 
 
 
411 aa  142  1e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.523513  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1615  extracellular ligand-binding receptor  27.3 
 
 
411 aa  139  7e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.308041 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2369  extracellular ligand-binding receptor  25.21 
 
 
423 aa  139  1e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.391884  normal  0.390615 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0479  extracellular ligand-binding receptor  26.68 
 
 
390 aa  137  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0188  Extracellular ligand-binding receptor  31.07 
 
 
386 aa  137  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3815  extracellular ligand-binding receptor  27.75 
 
 
368 aa  138  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0921  extracellular ligand-binding receptor  27.7 
 
 
382 aa  137  3e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.589524  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4342  extracellular ligand-binding receptor  29.81 
 
 
373 aa  137  3e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.688129 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4140  extracellular ligand-binding receptor  27.05 
 
 
370 aa  137  4e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.544868 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4590  Extracellular ligand-binding receptor  29.34 
 
 
441 aa  137  4e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3001  extracellular ligand-binding receptor  30.4 
 
 
392 aa  136  6e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0974  Extracellular ligand-binding receptor  25.94 
 
 
408 aa  135  2e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1428  Extracellular ligand-binding receptor  29.15 
 
 
401 aa  132  8e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5604  putative extracellular ligand-binding receptor  27.66 
 
 
386 aa  131  2e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.236032 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1779  hypothetical protein  29.36 
 
 
438 aa  131  2e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0487  extracellular ligand-binding receptor  26.98 
 
 
367 aa  130  5e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2010  Extracellular ligand-binding receptor  27.04 
 
 
377 aa  129  7e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.467518  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1693  extracellular ligand-binding receptor  27.04 
 
 
377 aa  129  9e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.502178  normal  0.251064 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0549  extracellular ligand-binding receptor  27.93 
 
 
384 aa  128  2e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0807314 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7082  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic-binding protein  29.72 
 
 
407 aa  128  2e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0666  ABC transporter substrate-binding protein  30.68 
 
 
410 aa  127  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.112312 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22980  amino acid-binding protein  30.97 
 
 
434 aa  127  5e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0512293  normal  0.104714 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2079  Extracellular ligand-binding receptor  28.37 
 
 
386 aa  126  5e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2791  Extracellular ligand-binding receptor  27.92 
 
 
436 aa  126  7e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55279  normal  0.125183 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3030  Extracellular ligand-binding receptor  27.93 
 
 
374 aa  125  9e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.394704  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3749  extracellular ligand-binding receptor  27.63 
 
 
374 aa  125  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.314564  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4103  extracellular ligand-binding receptor  31.04 
 
 
401 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.742112  normal  0.0857946 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4245  ABC transporter substrate-binding protein  30.23 
 
 
410 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3561  extracellular ligand-binding receptor  30.68 
 
 
409 aa  124  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5732  extracellular ligand-binding receptor  27.33 
 
 
403 aa  123  5e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.588725 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3597  extracellular ligand-binding receptor  26.68 
 
 
398 aa  123  7e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3606  extracellular ligand-binding receptor  28.25 
 
 
395 aa  122  8e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.316629 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0997  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.05 
 
 
392 aa  122  1e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.489385  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4704  Extracellular ligand-binding receptor  26.7 
 
 
371 aa  122  1e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03096  putative Leu/Ile/Val-binding lipoprotein transmembrane  25.71 
 
 
386 aa  122  1e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0735365  normal  0.368181 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0961  putative ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  27.42 
 
 
496 aa  122  1e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731254  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1131  extracellular ligand-binding receptor  27.24 
 
 
385 aa  120  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0219  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.45 
 
 
376 aa  120  4e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00187981  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4935  Extracellular ligand-binding receptor  25.06 
 
 
389 aa  120  5e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1739  extracellular ligand-binding receptor  30.84 
 
 
410 aa  120  5e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.152869 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3560  extracellular ligand-binding receptor  30.72 
 
 
411 aa  120  5e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.726041  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0953  extracellular ligand-binding receptor  27.08 
 
 
426 aa  119  6e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7650  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  29.82 
 
 
395 aa  119  9e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.394273 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2248  Extracellular ligand-binding receptor  29.64 
 
 
410 aa  119  1e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3339  extracellular ligand-binding receptor  29.25 
 
 
410 aa  119  1e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.154352  normal  0.135284 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0963  putative ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  26.72 
 
 
517 aa  119  1e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4394  extracellular ligand-binding receptor  31.17 
 
 
406 aa  118  1e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3178  extracellular ligand-binding receptor  25.9 
 
 
386 aa  118  2e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.677267  normal  0.56284 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0550  extracellular ligand-binding receptor  26.51 
 
 
383 aa  117  2e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0334765 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1861  Extracellular ligand-binding receptor  27.2 
 
 
379 aa  118  2e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.571716  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1005  extracellular ligand-binding receptor  26.86 
 
 
407 aa  118  2e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1594  Extracellular ligand-binding receptor  28.49 
 
 
394 aa  117  3e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1740  extracellular ligand-binding receptor  27.25 
 
 
435 aa  117  4e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.398941  normal  0.157953 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3566  extracellular ligand-binding receptor  29.31 
 
 
411 aa  117  4e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.172998  normal  0.680161 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0752  extracellular ligand-binding receptor  27.38 
 
 
405 aa  117  5e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.284007  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4101  extracellular ligand-binding receptor  24.51 
 
 
387 aa  116  6e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4100  extracellular ligand-binding receptor  24.04 
 
 
387 aa  116  7e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.199713  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0768  extracellular ligand-binding receptor  26.41 
 
 
380 aa  116  7e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.567193 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0352  extracellular ligand-binding receptor  28.02 
 
 
410 aa  116  7e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.115416  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2080  Extracellular ligand-binding receptor  27.75 
 
 
383 aa  115  9e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1725  putative leucine/isoleucine/valine-binding protein precursor  25.68 
 
 
393 aa  115  1e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1898  extracellular ligand-binding receptor  28.7 
 
 
411 aa  115  1e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.193262 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1734  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  26.37 
 
 
380 aa  115  1e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.534498  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0523  Extracellular ligand-binding receptor  25.83 
 
 
390 aa  115  1e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0215267  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4703  Extracellular ligand-binding receptor  24.65 
 
 
368 aa  115  2e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5294  putative ABC-type branched-chain amino acid transporter, periplasmic binding protein  29.55 
 
 
406 aa  114  2e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1823  extracellular ligand-binding receptor  29.96 
 
 
380 aa  115  2e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0299  extracellular ligand-binding receptor  27.02 
 
 
378 aa  114  2e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1635  putative branched-chain amino acid ABC transporter  26.57 
 
 
497 aa  114  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.314294  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0038  extracellular ligand-binding receptor  30.03 
 
 
406 aa  114  4e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0874  putative amino-acid ABC transport system, periplasmic binding protein  29.74 
 
 
406 aa  113  5e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.034766  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4684  extracellular ligand-binding receptor  29.55 
 
 
406 aa  113  5e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3504  extracellular ligand-binding receptor  24.74 
 
 
392 aa  113  5e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0407454  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4246  Extracellular ligand-binding receptor  29.34 
 
 
409 aa  113  6e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1879  putative amino acids-binding transmembrane protein  25.73 
 
 
383 aa  112  7e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.399388  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1828  hypothetical protein  27.45 
 
 
539 aa  112  1e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00860183  normal  0.522901 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0583  Extracellular ligand-binding receptor  29.97 
 
 
406 aa  112  2e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.981919  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0350  extracellular ligand-binding receptor  24.93 
 
 
376 aa  111  2e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  2.81139e-06  normal  0.291499 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1848  extracellular ligand-binding receptor  25.45 
 
 
389 aa  111  2e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0671771  normal  0.122571 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2001  Extracellular ligand-binding receptor  28.7 
 
 
411 aa  111  2e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2081  twin-arginine translocation pathway signal  28.16 
 
 
394 aa  110  4e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.353288 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0108  Extracellular ligand-binding receptor  24.39 
 
 
388 aa  110  5e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>