50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0524 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0524  RecB family-like nuclease  100 
 
 		 396 aa  806    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0518  RecB family-like nuclease  38.44 
 
 		 390 aa  270  5e-71  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.13317  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2051  hypothetical protein  29.33 
 
 		 480 aa  147  4.0000000000000006e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0841  RecB family-like nuclease  26.87 
 
 		 394 aa  143  6e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0818  RecB family-like nuclease  26.87 
 
 		 394 aa  143  6e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1093  RecB family-like nuclease  30.21 
 
 		 366 aa  140  3.9999999999999997e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2410  RecB family nuclease, putative  31.3 
 
 		 486 aa  134  3e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4865  hypothetical protein  29.64 
 
 		 494 aa  134  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.120137  unclonable  0.000000212393 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3226  nuclease (RecB family)-like protein  30.77 
 
 		 493 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.492235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2870  hypothetical protein  30.77 
 
 		 493 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0336  hypothetical protein  30.18 
 
 		 487 aa  131  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0186  hypothetical protein  33.22 
 
 		 512 aa  129  9.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.12716 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3349  hypothetical protein  27.95 
 
 		 512 aa  123  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.134566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0279  putative nuclease (RecB family)  29.96 
 
 		 472 aa  106  6e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.762829  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03101  RecB family nuclease  30.8 
 
 		 446 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0258  hypothetical protein  26.9 
 
 		 502 aa  101  2e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.715645  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1784  hypothetical protein  26.47 
 
 		 1118 aa  98.6  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.424401  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03041  RecB family nuclease  29.23 
 
 		 490 aa  98.2  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0542901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03001  RecB family nuclease  26.04 
 
 		 472 aa  95.5  2e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03011  RecB family nuclease  29.39 
 
 		 472 aa  92.8  9e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.415861  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1643  DNA repair enzyme  27.92 
 
 		 483 aa  92.8  1e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.845174  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2717  hypothetical protein  26.62 
 
 		 1126 aa  90.9  4e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375535 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1283  hypothetical protein  26.76 
 
 		 1116 aa  89.4  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112248 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0229  hypothetical protein  25.17 
 
 		 491 aa  89  1e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24981  RecB family nuclease  24.74 
 
 		 535 aa  87  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03571  RecB family nuclease  27.56 
 
 		 483 aa  87  5e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.551533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0719  RecB family-like nuclease  30.24 
 
 		 495 aa  86.7  7e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.253334  hitchhiker  0.0000000430551 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3698  RecB family nuclease, putative  24.73 
 
 		 1082 aa  83.6  0.000000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1107  hypothetical protein  25.09 
 
 		 1121 aa  83.6  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.186279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0935  hypothetical protein  30.1 
 
 		 1172 aa  64.7  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.576468  hitchhiker  0.000557734 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2223  RecB family-like nuclease  24.56 
 
 		 1163 aa  62  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1535  ATPase  23.61 
 
 		 1280 aa  62  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4472  RecB family-like nuclease  24.56 
 
 		 1151 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.836505  normal  0.104003 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11277  hypothetical protein  23.79 
 
 		 1139 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.72071 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3983  RecB family-like nuclease  24.29 
 
 		 1143 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0895851 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3969  RecB family-like nuclease  24.29 
 
 		 1143 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4043  RecB family-like nuclease  24.29 
 
 		 1143 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5304  AAA ATPase  22.38 
 
 		 1153 aa  54.7  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2182  RecB family nuclease, putative  25.54 
 
 		 1198 aa  52.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000250648  decreased coverage  0.00000209405 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0119  RecB family nuclease, putative  21.95 
 
 		 479 aa  52  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.260847  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00610  predicted nuclease (RecB family)  21.69 
 
 		 1270 aa  50.4  0.00005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0250  hypothetical protein  24.74 
 
 		 1350 aa  50.1  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0117  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  27.42 
 
 		 1324 aa  48.5  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0229984  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3239  RecB family nuclease, putative  26.78 
 
 		 1228 aa  48.5  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.262679 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20350  predicted nuclease (RecB family)  27.27 
 
 		 1196 aa  46.6  0.0008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0149  RecB family nuclease, putative  21.09 
 
 		 576 aa  46.2  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.264456  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0890  hypothetical protein  29.63 
 
 		 1215 aa  45.1  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4059  hypothetical protein  24.24 
 
 		 522 aa  45.4  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0046  nuclease (RecB family)-like protein  35 
 
 		 544 aa  44.7  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1000  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1215 aa  43.9  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0219894 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>