More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0497 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0497  type III restriction protein res subunit  100 
 
 		 696 aa  1403    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.154157  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1686  type III restriction enzyme, res subunit  74.36 
 
 		 698 aa  1051    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.025526  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1374  type III restriction protein res subunit  37.76 
 
 		 707 aa  436  1e-121  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.304908  normal  0.550958 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2481  type III restriction enzyme, res subunit  33.61 
 
 		 706 aa  394  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.839221  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1537  type III restriction enzyme, res subunit  34.35 
 
 		 732 aa  377  1e-103  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2087  type III restriction enzyme, res subunit  32.31 
 
 		 715 aa  304  3.0000000000000004e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.167702  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2313  type III restriction protein res subunit  29.65 
 
 		 706 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2593  type III restriction protein res subunit  34.12 
 
 		 493 aa  238  3e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1942  type III restriction enzyme, res subunit  34.74 
 
 		 469 aa  235  2.0000000000000002e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.823738  normal  0.0282791 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2199  Type III restriction enzyme, res subunit  34 
 
 		 492 aa  231  2e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00119  Type III restriction enzyme, res subunit  26.27 
 
 		 744 aa  222  1.9999999999999999e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.431054  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2052  type III restriction protein res subunit  32.97 
 
 		 489 aa  219  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2026  type III restriction protein res subunit  32.97 
 
 		 489 aa  218  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3118  helicase-like  36.09 
 
 		 1065 aa  164  4.0000000000000004e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.482312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4237  helicase-like  36.09 
 
 		 1065 aa  164  4.0000000000000004e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00803691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4050  type III restriction protein res subunit  27.07 
 
 		 453 aa  144  4e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0396258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1040  type III restriction enzyme, res subunit  26.72 
 
 		 385 aa  137  5e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.343931  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1936  type III restriction protein res subunit  29.7 
 
 		 551 aa  124  4e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0298009  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0308  type III restriction protein res subunit  25.47 
 
 		 449 aa  122  1.9999999999999998e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1762  type III restriction enzyme, res subunit  26.2 
 
 		 451 aa  120  7e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2643  DNA repair helicase RAD25  30.27 
 
 		 491 aa  118  3.9999999999999997e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0920189 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1769  type III restriction enzyme, res subunit  27.27 
 
 		 464 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4564  helicase-like  24.95 
 
 		 453 aa  114  5e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3178  type III restriction protein res subunit  29.79 
 
 		 249 aa  114  6e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0100  type III restriction protein res subunit  27.34 
 
 		 440 aa  113  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000273539  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1646  type III restriction enzyme, res subunit  28.86 
 
 		 654 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0299889 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1994  type III restriction enzyme, res subunit  27.49 
 
 		 468 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.143159  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1556  type III restriction protein res subunit  26.34 
 
 		 470 aa  112  3e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1709  type III restriction protein res subunit  25.46 
 
 		 494 aa  109  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.17082  normal  0.0133576 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4412  type III restriction enzyme, res subunit  26.99 
 
 		 590 aa  109  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.307944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0079  type III restriction protein res subunit  27.27 
 
 		 499 aa  106  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0299  DNA repair helicase RAD25  27.36 
 
 		 456 aa  106  1e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1455  type III restriction protein res subunit  27.45 
 
 		 444 aa  105  2e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.437061  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1743  DNA repair helicase RAD25  25.8 
 
 		 531 aa  105  2e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.763617 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3185  type III restriction protein res subunit  23.14 
 
 		 466 aa  105  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0951  Type III restriction enzyme, res subunit  26.42 
 
 		 517 aa  105  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.12396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1432  type III restriction enzyme, res subunit  27.08 
 
 		 451 aa  102  2e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.503563  normal  0.0109836 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4175  type III restriction protein res subunit  27.78 
 
 		 479 aa  102  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.776953  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0580  type III restriction protein res subunit  26.72 
 
 		 509 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0563  type III restriction protein res subunit  26.72 
 
 		 509 aa  103  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2015  type III restriction protein res subunit  27.04 
 
 		 488 aa  102  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0649  type III restriction enzyme, res subunit  22.98 
 
 		 462 aa  100  7e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.674278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2843  type III restriction protein res subunit  24.64 
 
 		 444 aa  100  8e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.109265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4437  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  24.2 
 
 		 951 aa  99.8  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.118841 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0670  type III restriction protein res subunit  26.09 
 
 		 652 aa  98.2  4e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4977  type III restriction protein res subunit  26.14 
 
 		 479 aa  98.2  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.313567  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3083  type III restriction protein res subunit  24.21 
 
 		 466 aa  96.7  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1901  type III restriction enzyme, res subunit  26.38 
 
 		 451 aa  95.5  3e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0659  type III restriction protein res subunit  25.18 
 
 		 531 aa  95.1  4e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0583  DNA repair helicase RAD25  24.76 
 
 		 443 aa  93.2  2e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.71742  normal  0.481027 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1191  type III restriction protein res subunit  26.13 
 
 		 451 aa  91.3  6e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0451  DNA repair helicase  25.54 
 
 		 218 aa  89  3e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000151647 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0605  type III restriction enzyme, res subunit  25.46 
 
 		 647 aa  85.5  0.000000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl314  DNA repair DNA/RNA helicase  27.15 
 
 		 905 aa  82.8  0.00000000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  4.84028e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2154  type III restriction enzyme, res subunit  26.6 
 
 		 650 aa  83.2  0.00000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.508076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1475  type I restriction-modification system, R subunit  25.9 
 
 		 761 aa  81.6  0.00000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1599  helicase domain protein  25.36 
 
 		 889 aa  79.3  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0244124  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1416  EcoEI R domain protein  25.55 
 
 		 800 aa  78.6  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008696  Tpen_1875  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.82 
 
 		 633 aa  76.3  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1134  EcoEI R domain-containing protein  24.26 
 
 		 780 aa  73.2  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.122502  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3086  Type I site-specific deoxyribonuclease  23.56 
 
 		 813 aa  73.2  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.461628  normal  0.442211 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0355  type III restriction enzyme, res subunit  25.16 
 
 		 596 aa  72.8  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.098863  normal  0.390536 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1910  type III restriction enzyme, res subunit  23.61 
 
 		 1043 aa  72  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3022  type III restriction protein res subunit  22.3 
 
 		 1597 aa  71.6  0.00000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20110  DNA/RNA helicase, superfamily II  21.55 
 
 		 606 aa  71.6  0.00000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.24796  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1719  DNA or RNA helicase of superfamily II-like protein  22.94 
 
 		 582 aa  70.9  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.193156  normal  0.109566 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0759  type III restriction enzyme, res subunit  24.07 
 
 		 566 aa  70.9  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.523445  normal  0.362489 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0358  type III restriction protein res subunit  19.36 
 
 		 843 aa  68.9  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.421793  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0145  type III restriction enzyme, res subunit  23.8 
 
 		 574 aa  68.6  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3879  type III restriction protein res subunit  21.39 
 
 		 593 aa  67.8  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1309  EcoEI R domain-containing protein  23.81 
 
 		 824 aa  67.4  0.0000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0652  type III restriction enzyme, res subunit  23.75 
 
 		 630 aa  67  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  unclonable  0.000000732435  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2052  helicase, putative  26.23 
 
 		 952 aa  66.2  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1354  type III restriction enzyme, res subunit  27.88 
 
 		 660 aa  65.9  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0575606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1089  type III restriction protein res subunit  21.35 
 
 		 1051 aa  66.2  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0360  type III restriction protein res subunit  23.95 
 
 		 1055 aa  65.5  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0362  type III restriction enzyme, res subunit  23.95 
 
 		 1055 aa  65.5  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0370  type III restriction protein res subunit  23.8 
 
 		 1055 aa  65.5  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0484136  hitchhiker  0.000113274 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20230  EcoEI R domain protein  22.08 
 
 		 770 aa  64.7  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.601124  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0368  helicase  23.31 
 
 		 982 aa  64.3  0.000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1291  type III restriction enzyme, res subunit  23.12 
 
 		 598 aa  64.3  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0810  DEAD/DEAH box helicase-like  27.54 
 
 		 797 aa  63.9  0.000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.135985  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08280  DNA/RNA helicase, superfamily II  22.14 
 
 		 606 aa  63.9  0.000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.265179  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3842  type III restriction enzyme, res subunit  22.35 
 
 		 1061 aa  63.9  0.000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0822  helicase domain-containing protein  28.57 
 
 		 886 aa  63.5  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0376  type III restriction protein res subunit  21.41 
 
 		 574 aa  62.8  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4503  type III restriction enzyme, res subunit  22.14 
 
 		 1052 aa  62.4  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000814753 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3028  hypothetical protein  23.11 
 
 		 796 aa  61.6  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.194288  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0174  type III restriction protein, res subunit  21.65 
 
 		 949 aa  61.2  0.00000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.927728  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0931  type III restriction protein res subunit  21.1 
 
 		 586 aa  60.8  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.355478  normal  0.978518 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1255  DEAD/DEAH box helicase  22.25 
 
 		 811 aa  61.2  0.00000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.171092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1193  EcoEI R domain protein  22.54 
 
 		 827 aa  60.8  0.00000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.325861  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2618  EcoEI R domain-containing protein  22.54 
 
 		 817 aa  60.8  0.00000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0707543 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2867  EcoEI R domain-containing protein  22.65 
 
 		 821 aa  60.5  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10520  DNA/RNA helicase, superfamily II  21.9 
 
 		 589 aa  60.1  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.531597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2205  type III restriction protein res subunit  25.22 
 
 		 993 aa  59.3  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2642  type III restriction protein res subunit  21.44 
 
 		 1632 aa  59.7  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5861  type III restriction enzyme domain protein  22.59 
 
 		 810 aa  59.7  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0960  type III restriction protein res subunit  19.32 
 
 		 485 aa  58.9  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6047  type I restriction-modification system subunit R  23.94 
 
 		 788 aa  58.9  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.494965  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>