62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0493 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0493  hypothetical protein  100 
 
 
224 aa  446  1e-124  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  2.13235e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1923  hypothetical protein  48.42 
 
 
223 aa  214  9e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00116502  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0664  hypothetical protein  35.81 
 
 
222 aa  142  3e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  1.9589e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0688  hypothetical protein  36.28 
 
 
222 aa  128  5e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  1.15743e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1146  Putitive phosphate transport regulator  29.58 
 
 
227 aa  90.1  3e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.266401  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2044  hypothetical protein  26.36 
 
 
228 aa  80.5  2e-14  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  4.05279e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0063  hypothetical protein  24.09 
 
 
224 aa  60.8  1e-08  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5953  hypothetical protein  22.49 
 
 
225 aa  60.1  2e-08  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68800  hypothetical protein  22.97 
 
 
225 aa  59.7  4e-08  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2827  hypothetical protein  20.75 
 
 
224 aa  58.9  6e-08  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.245918  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3224  hypothetical protein  24.64 
 
 
222 aa  58.5  7e-08  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2470  hypothetical protein  24.53 
 
 
226 aa  58.2  1e-07  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1052  hypothetical protein  22.75 
 
 
224 aa  57.4  2e-07  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00170442  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5473  protein of unknown function DUF47  25.78 
 
 
213 aa  57.4  2e-07  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.400135 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5203  protein of unknown function DUF47  26.22 
 
 
213 aa  57.4  2e-07  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.177281 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2681  hypothetical protein  22.33 
 
 
226 aa  56.2  4e-07  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0612362  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00863  hypothetical protein  23.15 
 
 
228 aa  55.8  5e-07  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0228  hypothetical protein  22.07 
 
 
227 aa  55.1  8e-07  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.775061  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2019  hypothetical protein  23.15 
 
 
228 aa  54.7  1e-06  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  5.82127e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3780  phosphate transport regulator-like  25.2 
 
 
226 aa  54.3  1e-06  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2673  hypothetical protein  23.47 
 
 
226 aa  54.7  1e-06  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.241271  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0711  hypothetical protein  23.77 
 
 
226 aa  54.3  1e-06  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0692  hypothetical protein  23.58 
 
 
226 aa  54.3  2e-06  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  1.30211e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004528  phosphate transport regulator  24.71 
 
 
195 aa  54.3  2e-06  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.327148  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3843  hypothetical protein  22.17 
 
 
226 aa  53.5  3e-06  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  7.24256e-05  hitchhiker  2.83379e-08 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0141  Putitive phosphate transport regulator  23 
 
 
226 aa  53.5  3e-06  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.572504  normal  0.330321 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0351  hypothetical protein  22.22 
 
 
225 aa  52  8e-06  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3320  hypothetical protein  21.26 
 
 
225 aa  50.8  1e-05  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.915489  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0181  hypothetical protein  20.37 
 
 
226 aa  51.6  1e-05  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0634  hypothetical protein  22.97 
 
 
223 aa  50.8  2e-05  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3487  hypothetical protein  22.64 
 
 
226 aa  50.1  2e-05  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  1.26131e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0822  hypothetical protein  21.6 
 
 
226 aa  50.1  2e-05  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  1.09083e-06  normal  0.209568 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0618  hypothetical protein  24.14 
 
 
226 aa  50.1  2e-05  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.357102  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0618  hypothetical protein  22.52 
 
 
223 aa  50.4  2e-05  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3119  hypothetical protein  21.6 
 
 
226 aa  50.1  2e-05  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  7.17729e-07  normal  0.542025 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0853  hypothetical protein  21.6 
 
 
226 aa  50.1  2e-05  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  4.59273e-07  normal  0.62908 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0717  hypothetical protein  22.54 
 
 
226 aa  50.8  2e-05  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  2.53337e-08  unclonable  1.17044e-08 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1625  hypothetical protein  23.94 
 
 
217 aa  49.3  4e-05  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.109704  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0917  hypothetical protein  21.23 
 
 
226 aa  49.3  4e-05  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00343614  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0883  hypothetical protein  21.23 
 
 
226 aa  49.3  4e-05  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  1.29781e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0907  protein of unknown function DUF47  21.23 
 
 
226 aa  49.3  4e-05  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  5.56938e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3455  hypothetical protein  21.23 
 
 
226 aa  49.3  4e-05  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000227297  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3096  hypothetical protein  21.23 
 
 
226 aa  49.3  5e-05  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  1.06475e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0285  hypothetical protein  27.1 
 
 
217 aa  49.3  5e-05  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1415  hypothetical protein  24.39 
 
 
214 aa  48.5  9e-05  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3770  hypothetical protein  20.75 
 
 
226 aa  48.1  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3638  hypothetical protein  23.04 
 
 
226 aa  47  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.1465  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1880  hypothetical protein  21.46 
 
 
215 aa  47.4  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.690061  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3359  hypothetical protein  21.46 
 
 
215 aa  46.6  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.312394 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1122  hypothetical protein  24.58 
 
 
212 aa  47  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.12514e-07  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2707  protein of unknown function DUF47  21.46 
 
 
215 aa  46.6  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0565  hypothetical protein  22.12 
 
 
226 aa  46.2  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1686  hypothetical protein  22.37 
 
 
215 aa  45.4  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3394  hypothetical protein  24.45 
 
 
214 aa  45.1  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.103625  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1190  phosphate transport regulator  18.69 
 
 
226 aa  44.7  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.967179  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1469  protein of unknown function DUF47  21.6 
 
 
214 aa  43.5  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1677  hypothetical protein  22.37 
 
 
218 aa  43.1  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.324564  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1398  hypothetical protein  22.54 
 
 
215 aa  43.1  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3016  hypothetical protein  22.07 
 
 
215 aa  42.4  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.25831  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0558  protein of unknown function DUF47  22.87 
 
 
215 aa  42.4  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2522  protein of unknown function DUF47  23.14 
 
 
214 aa  42  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.244143  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2188  hypothetical protein  23.26 
 
 
226 aa  42  0.008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.839701  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>