217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0453 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0453  uridine kinase  100 
 
 
201 aa  411  1e-114  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00211906  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1365  uridine kinase  69.61 
 
 
204 aa  271  4e-72  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.759935  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2364  uridine kinase  50.5 
 
 
219 aa  229  2e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1385  uridine kinase  50.51 
 
 
209 aa  223  2e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0202  uridine kinase  51.5 
 
 
204 aa  222  3e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0823  uridine kinase  48.74 
 
 
219 aa  215  4e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2482  uridine kinase  49.25 
 
 
211 aa  208  4e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1175  uridine kinase  49.47 
 
 
207 aa  202  2e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2023  uridine kinase  48.94 
 
 
208 aa  199  3e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1740  uridine kinase  48.94 
 
 
208 aa  198  5e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.627897  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1668  uridine kinase  47.87 
 
 
207 aa  195  4e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1702  uridine kinase  47.87 
 
 
207 aa  195  4e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.69825  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl306  uridine kinase  47 
 
 
208 aa  194  5e-49  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  4.66982e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3563  uridine kinase  45.77 
 
 
213 aa  194  1e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.933791  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1330  uridine kinase  43.88 
 
 
212 aa  192  4e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.60785 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0970  uridine kinase  48.24 
 
 
211 aa  191  4e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1781  uridine kinase  43.22 
 
 
209 aa  190  1e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1422  uridine kinase  48.11 
 
 
236 aa  189  3e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0011  uridine kinase  46.63 
 
 
202 aa  188  5e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2200  uridine kinase  47.5 
 
 
223 aa  188  6e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4124  uridine kinase  47.51 
 
 
212 aa  186  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4460  uridine kinase  47.51 
 
 
212 aa  186  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0770159 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4113  uridine kinase  47.51 
 
 
212 aa  186  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3093  uridine kinase  48.07 
 
 
212 aa  186  2e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0736  uridine kinase  47.51 
 
 
212 aa  186  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.441671  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4500  uridine kinase  47.51 
 
 
212 aa  186  3e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.403076  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4608  uridine kinase  47.51 
 
 
212 aa  185  4e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4276  uridine kinase  47.51 
 
 
212 aa  185  4e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4513  uridine kinase  47.51 
 
 
212 aa  185  4e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  2.95414e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4462  uridine kinase  47.51 
 
 
212 aa  185  4e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0409991  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1848  uridine kinase  48.96 
 
 
220 aa  184  6e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4227  uridine kinase  46.96 
 
 
212 aa  184  7e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2386  uridine kinase  43.72 
 
 
209 aa  183  1e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  6.94748e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0422  uridine kinase  48 
 
 
207 aa  183  1e-45  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.174111  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07150  uridine kinase  44.95 
 
 
202 aa  183  2e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2249  uridine kinase  43.59 
 
 
213 aa  182  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2463  uridine kinase  43.59 
 
 
213 aa  182  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.92076  normal  0.601786 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2356  uridine kinase  43.59 
 
 
213 aa  182  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0747859  normal  0.616244 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2349  uridine kinase  43.59 
 
 
213 aa  182  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2463  uridine kinase  41.87 
 
 
212 aa  182  4e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000426115  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2680  uridine kinase  43.59 
 
 
213 aa  182  4e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.381484 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2305  uridine kinase  43.59 
 
 
213 aa  181  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2047  uridine kinase  42.36 
 
 
212 aa  181  7e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.20095  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2218  uridine kinase  41.38 
 
 
212 aa  181  9e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.428302  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2228  uridine kinase  39.41 
 
 
215 aa  180  1e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01972  uridine kinase  43.08 
 
 
213 aa  180  1e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1591  uridine kinase  43.08 
 
 
213 aa  180  1e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00393606  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0994  uridine kinase  43.08 
 
 
213 aa  180  1e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3003  uridine kinase  43.08 
 
 
213 aa  180  1e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.384394 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2359  uridine kinase  43.08 
 
 
213 aa  180  1e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1166  uridine kinase  43.08 
 
 
213 aa  180  1e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01961  hypothetical protein  43.08 
 
 
213 aa  180  1e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2206  uridine kinase  43.08 
 
 
213 aa  180  1e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1575  uridine kinase  43.08 
 
 
213 aa  180  1e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0267753  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2576  uridine kinase  41.38 
 
 
212 aa  179  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0976754  normal  0.0423229 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2456  uridine kinase  41.38 
 
 
212 aa  179  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  5.11378e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1888  uridine kinase  41.38 
 
 
212 aa  179  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  1.27737e-06  normal  0.0259304 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1281  uridine kinase  42.71 
 
 
209 aa  178  4e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2871  uridine kinase  42.05 
 
 
213 aa  178  4e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3195  uridine kinase  42.56 
 
 
213 aa  177  8e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0472319  hitchhiker  0.00149984 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2453  uridine kinase  42.56 
 
 
213 aa  177  8e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2552  uridine kinase  42.56 
 
 
213 aa  177  8e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2244  uridine kinase  40.89 
 
 
212 aa  177  9e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02924  uridine kinase  40.39 
 
 
213 aa  177  1e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1762  uridine kinase  40.89 
 
 
212 aa  177  1e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0067733  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2617  uridine kinase  40.89 
 
 
212 aa  177  1e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1732  uridine kinase  40.89 
 
 
212 aa  177  1e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000414727  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1657  uridine kinase  40.89 
 
 
212 aa  177  1e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0722731  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3042  uridine kinase  42.05 
 
 
213 aa  176  2e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1576  uridine kinase  42.56 
 
 
213 aa  176  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.435743 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1557  uridine kinase  47.25 
 
 
231 aa  176  2e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1197  uridine kinase  41.54 
 
 
213 aa  176  2e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1979  uridine kinase  39.9 
 
 
211 aa  176  3e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000633687  hitchhiker  0.00165825 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0382  uridine kinase  47.34 
 
 
212 aa  175  4e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0215949  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1289  uridine kinase  41.54 
 
 
213 aa  175  5e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.731499  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2054  uridine kinase  40.39 
 
 
212 aa  174  7e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1215  uridine kinase  44.72 
 
 
218 aa  174  7e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  1.75656e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0644  uridine kinase  42.25 
 
 
213 aa  174  8e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000687916  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12970  uridine kinase  46.94 
 
 
204 aa  174  1e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.47377e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1919  uridine kinase  38.92 
 
 
211 aa  173  2e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1825  uridine kinase  46.73 
 
 
206 aa  172  3e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1033  uridine kinase  40.96 
 
 
210 aa  172  4e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.12732  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0533  uridine kinase  41.71 
 
 
207 aa  172  4e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0537  uridine kinase  42.71 
 
 
242 aa  171  6e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0563702  hitchhiker  9.16272e-15 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1575  uridine kinase  38.42 
 
 
211 aa  171  7e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0315  uridine kinase  43.46 
 
 
214 aa  170  1e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2651  uridine kinase  39.41 
 
 
211 aa  169  2e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.212203 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1489  uridine kinase  42.56 
 
 
212 aa  169  3e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0501777  normal  0.122094 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1974  uridine kinase  41.58 
 
 
216 aa  167  1e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.308367  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0556  uridine kinase  39.9 
 
 
219 aa  166  2e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0365333  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00730  uridine kinase  40.2 
 
 
207 aa  166  3e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0558456  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002983  uridine kinase (C1)  40.39 
 
 
213 aa  166  3e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.163408  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1819  uridine kinase  39.27 
 
 
232 aa  164  8e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1820  uridine kinase  39.27 
 
 
232 aa  164  8e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0935  uridine kinase  39.7 
 
 
215 aa  159  2e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1079  uridine kinase  39.7 
 
 
215 aa  159  2e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.210616  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2005  uridine kinase  38.38 
 
 
204 aa  159  3e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.679011  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10398  predicted protein  44.25 
 
 
209 aa  155  4e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.296577  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1238  uridine kinase  44.57 
 
 
211 aa  152  3e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_47740  predicted protein  39.66 
 
 
434 aa  152  5e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0678521  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>