290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0402 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0402  ribosome-binding factor A  100 
 
 		 125 aa  250  4.0000000000000004e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1498  ribosome-binding factor A  53.6 
 
 		 125 aa  134  4e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0072  ribosome-binding factor A  57.14 
 
 		 131 aa  133  8e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0072  ribosome-binding factor A  56.25 
 
 		 131 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.884445  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1691  ribosome-binding factor A  41.53 
 
 		 117 aa  102  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0901  hypothetical protein  41.07 
 
 		 122 aa  88.6  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0610  ribosome-binding factor A  36.44 
 
 		 128 aa  80.5  0.000000000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0012936  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3675  ribosome-binding factor A  37.07 
 
 		 125 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1661  ribosome-binding factor A  33.61 
 
 		 121 aa  75.9  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.661527  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07850  ribosome-binding factor A  37.96 
 
 		 122 aa  75.5  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1436  ribosome-binding factor A  37.84 
 
 		 118 aa  75.9  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.349731  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0909  ribosome-binding factor A  37.5 
 
 		 121 aa  75.5  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0927  ribosome-binding factor A  35.9 
 
 		 119 aa  75.9  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100451  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1445  ribosome-binding factor A  32.48 
 
 		 131 aa  75.1  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000145103  normal  0.2265 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1644  ribosome-binding factor A  33.61 
 
 		 119 aa  73.9  0.0000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3223  ribosome-binding factor A  35.51 
 
 		 121 aa  72.8  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.275033 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1956  ribosome-binding factor A  33.7 
 
 		 120 aa  71.2  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1589  ribosome-binding factor A  41 
 
 		 118 aa  70.9  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00426148  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1587  ribosome-binding factor A  36.94 
 
 		 118 aa  70.1  0.000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00540002  normal  0.129345 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2773  ribosome-binding factor A  34.78 
 
 		 136 aa  70.1  0.000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1480  ribosome-binding factor A  31.45 
 
 		 123 aa  68.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.243092  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01271  ribosome-binding factor A  29.84 
 
 		 130 aa  69.3  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01851  ribosome-binding factor A  31.45 
 
 		 123 aa  68.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.30308  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1157  ribosome-binding factor A  38.46 
 
 		 126 aa  68.2  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000826248  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3187  ribosome-binding factor A  32.2 
 
 		 119 aa  68.2  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.11601  normal  0.332882 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0458  ribosome-binding factor A  32.41 
 
 		 117 aa  67.8  0.00000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0990  ribosome-binding factor A  30.77 
 
 		 123 aa  67  0.00000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.645083  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1210  ribosome-binding factor A  39 
 
 		 127 aa  67  0.00000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00755575  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1105  ribosome-binding factor A  37.07 
 
 		 132 aa  66.6  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.657587  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2049  ribosome-binding factor A  35.58 
 
 		 127 aa  66.6  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26151  ribosome-binding factor A  29.63 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.549053 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0477  ribosome-binding factor A  28.1 
 
 		 126 aa  66.2  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00670849  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0982  ribosome-binding factor A  32.2 
 
 		 118 aa  65.5  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.385895  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_854  ribosome-binding factor A  31.36 
 
 		 118 aa  65.9  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000358033  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3662  ribosome-binding factor A  35.56 
 
 		 118 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118279  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1004  ribosome-binding factor A  31.62 
 
 		 129 aa  65.9  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.439697  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1728  ribosome-binding factor A  32.17 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.403197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3948  ribosome-binding factor A  35.56 
 
 		 118 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0873  ribosome-binding factor A  31.36 
 
 		 118 aa  65.5  0.0000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000231797  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1693  ribosome-binding factor A  29.91 
 
 		 141 aa  65.9  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0101873  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3552  ribosome-binding factor A  35.56 
 
 		 118 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3570  ribosome-binding factor A  35.56 
 
 		 118 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3822  ribosome-binding factor A  35.56 
 
 		 118 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.3299500000000005e-63 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2350  ribosome-binding factor A  28 
 
 		 140 aa  64.7  0.0000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.840269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1335  ribosome-binding factor A  35.56 
 
 		 118 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0231832  hitchhiker  0.00144693 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2463  ribosome-binding factor A  35.56 
 
 		 118 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0350107  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3909  ribosome-binding factor A  35.56 
 
 		 118 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.391027  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3633  ribosome-binding factor A  35.56 
 
 		 118 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0539851  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3849  ribosome-binding factor A  35.56 
 
 		 118 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0341  ribosome-binding factor A  26.45 
 
 		 134 aa  63.9  0.0000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1939  ribosome-binding factor A  30.43 
 
 		 116 aa  63.9  0.0000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1657  ribosome-binding factor A  30.43 
 
 		 116 aa  63.9  0.0000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3073  ribosome-binding factor A  33.7 
 
 		 131 aa  63.5  0.0000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.729556  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3858  ribosome-binding factor A  35.56 
 
 		 118 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000036841  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1754  ribosome-binding factor A  31.36 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0297721 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1557  ribosome-binding factor A  34.21 
 
 		 119 aa  62.8  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000452845  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1863  ribosome-binding factor A  34.34 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1696  ribosome-binding factor A  36.05 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1902  ribosome-binding factor A  30.97 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0066847  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1051  ribosome-binding factor A  31 
 
 		 122 aa  61.6  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000570949  hitchhiker  0.000000154001 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2030  ribosome-binding factor A  27.83 
 
 		 123 aa  62  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0111953  normal  0.0437908 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0815  ribosome-binding factor A  31.71 
 
 		 123 aa  61.6  0.000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0116201  normal  0.0354189 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1226  ribosome-binding factor A  31.11 
 
 		 122 aa  61.2  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.333897  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2563  ribosome-binding factor A  31.03 
 
 		 122 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240841  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3725  ribosome-binding factor A  34.51 
 
 		 123 aa  60.8  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1092  ribosome-binding factor A  31.11 
 
 		 122 aa  60.8  0.000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.378347  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1052  ribosome-binding factor A  36.19 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164371  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1060  ribosome-binding factor A  31.03 
 
 		 122 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00435559  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1916  ribosome-binding factor A  31.03 
 
 		 122 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.24329  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3680  ribosome-binding factor A  28.07 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00259102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2819  ribosome-binding factor A  32.14 
 
 		 121 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00171915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0992  ribosome-binding factor A  31.03 
 
 		 138 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.197459  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1741  ribosome-binding factor A  31.03 
 
 		 138 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0087071  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4642  ribosome-binding factor A  34.31 
 
 		 132 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0378959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1763  ribosome-binding factor A  31.03 
 
 		 138 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492617  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1477  ribosome-binding factor A  31.3 
 
 		 132 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0174  ribosome-binding factor A  31.03 
 
 		 138 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0246509  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1021  ribosome-binding factor A  31.3 
 
 		 132 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1506  ribosome-binding factor A  31.03 
 
 		 138 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1501  ribosome-binding factor A  31.3 
 
 		 132 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236636  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0726  ribosome-binding factor A  31.37 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.237747  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2204  ribosome-binding factor A  31.75 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2027  ribosome-binding factor A  27.68 
 
 		 122 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.373244  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0769  ribosome-binding factor A  32.08 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1423  ribosome-binding factor A  29.66 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.02264 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1383  ribosome-binding factor A  29.66 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2819  ribosome-binding factor A  33.01 
 
 		 123 aa  59.3  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2688  ribosome-binding factor A  33.01 
 
 		 123 aa  59.3  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1748  ribosome-binding factor A  29.6 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0187668  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08030  ribosome-binding factor A  30.09 
 
 		 118 aa  58.5  0.00000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.536354  normal  0.36831 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3382  ribosome-binding factor A  31.58 
 
 		 125 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0271741  normal  0.693723 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0696  ribosome-binding factor A  26.21 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.146266  normal  0.222032 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0838  ribosome-binding factor A  26.85 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.102995 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1633  ribosome-binding factor A  30.36 
 
 		 121 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.100642  hitchhiker  0.000771704 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3851  ribosome-binding factor A  31.37 
 
 		 150 aa  57.4  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.258524  normal  0.192536 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1232  ribosome-binding factor A  31.86 
 
 		 139 aa  57  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0340167  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2980  ribosome-binding factor A  30.97 
 
 		 119 aa  57  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.06185e-26 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1164  ribosome-binding factor A  31.86 
 
 		 138 aa  57  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.338865  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1104  ribosome-binding factor A  31.86 
 
 		 138 aa  57  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0588249  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1809  ribosome-binding factor A  30.7 
 
 		 145 aa  57  0.00000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.298116  normal  0.213711 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>