More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0352 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0352  citrate transporter  100 
 
 
408 aa  796    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000181874  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1546  citrate transporter  49.49 
 
 
429 aa  365  1e-100  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0084311  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1545  citrate transporter  48.02 
 
 
429 aa  352  5e-96  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000185011  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1846  citrate transporter  44.96 
 
 
425 aa  335  7e-91  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1808  citrate transporter  44.44 
 
 
425 aa  332  9e-90  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1576  citrate transporter  42.57 
 
 
422 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.0000162894  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1022  citrate transporter  36.99 
 
 
421 aa  266  5.999999999999999e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.681723  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3003  Citrate transporter  38.28 
 
 
424 aa  259  8e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.467827 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2166  arsenic transporter family protein  38.32 
 
 
423 aa  251  2e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0827  citrate transporter  36.08 
 
 
440 aa  249  5e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1990  citrate transporter  39.23 
 
 
427 aa  245  8e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000159271  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1987  citrate transporter  39.79 
 
 
427 aa  242  1e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0408883  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2132  citrate transporter  36.2 
 
 
426 aa  242  1e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26370  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  37.19 
 
 
422 aa  238  2e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3120  Citrate transporter  37.63 
 
 
427 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.019931  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3119  Citrate transporter  37.4 
 
 
431 aa  233  3e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0395864  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0152  Citrate transporter  38.4 
 
 
419 aa  234  3e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0904912  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3181  citrate transporter  37.34 
 
 
441 aa  232  7.000000000000001e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0912003  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12699  arsenic-transport integral membrane protein arsA  34 
 
 
429 aa  232  1e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2622  Citrate transporter  34.07 
 
 
417 aa  228  1e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3482  arsenical pump family protein  36.06 
 
 
441 aa  228  1e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1243  Citrate transporter  36.18 
 
 
415 aa  227  4e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000320263  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05280  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  38.46 
 
 
427 aa  226  7e-58  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00452753  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12700  arsenic-transport integral membrane protein arsB1  33.59 
 
 
428 aa  225  1e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2433  Citrate transporter  36.18 
 
 
440 aa  224  3e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0484148 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2091  arsenic transporter family protein  36.57 
 
 
423 aa  223  3e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000299539  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1471  citrate transporter  37.61 
 
 
424 aa  223  7e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2196  citrate transporter  37.37 
 
 
451 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.339032  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3498  arsenical pump family protein  37.03 
 
 
441 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.97762  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1020  citrate transporter  37.05 
 
 
422 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3270  arsenical pump family protein  37.59 
 
 
441 aa  220  3e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0316539  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3243  arsenical pump family protein  37.59 
 
 
441 aa  220  3e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000351767  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3486  arsenical pump family protein  37.59 
 
 
441 aa  220  3e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3526  arsenical pump family protein  37.59 
 
 
441 aa  220  3e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0523462  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3669  Citrate transporter  33.15 
 
 
431 aa  219  6e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.955706  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1780  arsenical pump family protein  37.06 
 
 
441 aa  219  7e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3185  arsenical pump family protein  37.24 
 
 
441 aa  219  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0297754  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0610  Citrate transporter  37.99 
 
 
429 aa  218  1e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0191  arsenical pump family protein  37.99 
 
 
441 aa  218  1e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3469  arsenical pump family protein  36.27 
 
 
441 aa  218  1e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236736  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5055  arsenical pump family protein  37.99 
 
 
441 aa  218  2e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3015  Citrate transporter  36.2 
 
 
440 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3522  citrate transporter  37.73 
 
 
441 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4621  arsenical pump membrane protein  38.06 
 
 
444 aa  211  2e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4643  arsenical pump membrane protein  38.06 
 
 
444 aa  211  2e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5022  arsenical pump family protein  38.06 
 
 
441 aa  211  2e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5050  arsenical pump family protein  38.06 
 
 
444 aa  210  3e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5043  arsenical pump family protein  37.99 
 
 
441 aa  209  5e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1846  citrate transporter  39.83 
 
 
424 aa  209  5e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4781  arsenical pump family protein  37.8 
 
 
444 aa  209  7e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5143  arsenical pump family protein  37.8 
 
 
444 aa  209  7e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4733  citrate transporter  37.47 
 
 
444 aa  207  2e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0587  citrate transporter  32.08 
 
 
437 aa  203  4e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0599  citrate transporter  32.08 
 
 
437 aa  203  4e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.404538  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0577  citrate transporter  31.83 
 
 
437 aa  203  6e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1338  citrate transporter  33.84 
 
 
577 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0719  Citrate transporter  30.51 
 
 
451 aa  196  5.000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0015  citrate transporter  33.05 
 
 
431 aa  196  8.000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44788  predicted protein  31.46 
 
 
967 aa  194  2e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4163  Citrate transporter  31.45 
 
 
428 aa  192  7e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3393  citrate transporter  32.35 
 
 
428 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1763  citrate transporter  33.41 
 
 
421 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1699  citrate transporter  32.75 
 
 
421 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.346911  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1706  citrate transporter  34.56 
 
 
421 aa  182  9.000000000000001e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_13038  ArsB family transporter: P-protein-like protein (tyrosine transporter)  33.25 
 
 
447 aa  182  1e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0400673  normal  0.138316 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0353  citrate transporter  34.08 
 
 
409 aa  181  2e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0143046  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0796  citrate transporter  32.29 
 
 
424 aa  176  5e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1203  citrate transporter  27.73 
 
 
465 aa  152  1e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1592  citrate transporter  29.27 
 
 
422 aa  140  3e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0209  arsenical pump membrane protein, putative  28.36 
 
 
428 aa  133  5e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.144741  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3609  arsenical pump membrane protein  30.61 
 
 
400 aa  133  6e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4948  Citrate transporter  25.86 
 
 
445 aa  124  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.837621 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1466  citrate transporter  29.48 
 
 
436 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.406025  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0890  citrate transporter  23.91 
 
 
405 aa  120  3.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3289  Citrate transporter  25.24 
 
 
444 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0922989  normal  0.519081 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2811  Citrate transporter  25.24 
 
 
444 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0517  Citrate transporter  26.98 
 
 
419 aa  117  3e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1124  Citrate transporter  27.55 
 
 
411 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5261  Citrate transporter  23.31 
 
 
447 aa  109  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.10417  normal  0.132031 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2086  citrate transporter  28.53 
 
 
405 aa  107  5e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.771625 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3623  citrate transporter  26.61 
 
 
408 aa  106  6e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.893629  normal  0.562727 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0878  arsenical pump membrane protein  23.18 
 
 
445 aa  106  8e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.201371  hitchhiker  0.000139145 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1155  Citrate transporter  25.64 
 
 
405 aa  103  7e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.52181  hitchhiker  0.00000561595 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1014  citrate transporter  27.11 
 
 
417 aa  102  1e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.460106  normal  0.615622 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3351  citrate transporter  24.41 
 
 
426 aa  100  5e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1088  Arsenical pump membrane protein  24.21 
 
 
426 aa  98.2  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3167  Citrate transporter  28.57 
 
 
401 aa  97.1  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4527  arsenical pump membrane protein  23.77 
 
 
419 aa  96.3  8e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.142525  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4911  putative arsenite permease  22.61 
 
 
417 aa  95.5  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.372884 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2045  Arsenical pump membrane protein  21.59 
 
 
415 aa  94.7  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1533  citrate transporter  24.1 
 
 
452 aa  94.7  3e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.232848  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5880  citrate transporter  23.17 
 
 
446 aa  93.2  7e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1423  citrate transporter  25.6 
 
 
404 aa  92.4  1e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.418451  normal  0.0399282 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0447  citrate transporter  23.2 
 
 
490 aa  92  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000299254  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2052  citrate transporter  23.56 
 
 
447 aa  90.9  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2062  arsenite-antimonite efflux pump, ArsB  23.02 
 
 
428 aa  90.5  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.112493  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3360  citrate transporter  26.49 
 
 
370 aa  90.1  7e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0101  Citrate transporter  23.81 
 
 
396 aa  89  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.243285 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1347  citrate transporter  24.8 
 
 
414 aa  89.4  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1305  citrate transporter  27.27 
 
 
366 aa  88.6  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>