More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0340 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0340  RNA methyltransferase  100 
 
 
446 aa  918    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0121257  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1649  RNA methyltransferase  52.82 
 
 
439 aa  483  1e-135  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1544  RNA methyltransferase  52.86 
 
 
435 aa  480  1e-134  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.144945  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1722  RNA methyltransferase  52.95 
 
 
439 aa  481  1e-134  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1818  RNA methyltransferase  46.03 
 
 
446 aa  379  1e-104  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1585  RNA methyltransferase  33.04 
 
 
471 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.953972  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03000  RNA methyltransferase, TrmA family  34.39 
 
 
453 aa  259  5.0000000000000005e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0289  RNA methyltransferase  32.18 
 
 
488 aa  254  2.0000000000000002e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.198099  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2893  RNA methyltransferase, TrmA family  33.1 
 
 
572 aa  251  2e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1332  RNA methyltransferase, TrmA family  33.33 
 
 
447 aa  250  4e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000710273 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2868  RNA methyltransferase, TrmA family  31.38 
 
 
460 aa  248  2e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00253017  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1435  RNA methyltransferase  32.62 
 
 
456 aa  246  8e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2500  RNA methyltransferase  32.66 
 
 
470 aa  243  3e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0535  RNA methyltransferase  31.63 
 
 
465 aa  242  7e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2801  RNA methyltransferase  33.49 
 
 
470 aa  243  7e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1985  RNA methyltransferase  32.27 
 
 
453 aa  241  2e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1951  RNA methyltransferase  32.27 
 
 
453 aa  241  2e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.602794  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2557  RNA methyltransferase, TrmA family  31.67 
 
 
466 aa  235  9e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2157  RNA methyltransferase, TrmA family  31.63 
 
 
471 aa  235  1.0000000000000001e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.615925  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0455  RNA methyltransferase, TrmA family  34.09 
 
 
451 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0428  RNA methyltransferase, TrmA family  29.91 
 
 
460 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0357  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  32.73 
 
 
455 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0241  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  30.93 
 
 
455 aa  234  3e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.468571  normal  0.547918 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0348  RNA methyltransferase  32.5 
 
 
455 aa  233  5e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.359971  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2369  RNA methyltransferase  30.61 
 
 
489 aa  232  1e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1321200000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0406  RNA methyltransferase  30.86 
 
 
459 aa  232  1e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1308  RNA methyltransferase, TrmA family  30.16 
 
 
467 aa  231  3e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0363  RNA methyltransferase  31.17 
 
 
460 aa  230  4e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1225  RNA methyltransferase, TrmA family  31.8 
 
 
457 aa  229  5e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0542  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  30.63 
 
 
459 aa  229  6e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000351254  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2261  RNA methyltransferase  32.88 
 
 
457 aa  229  6e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000592232  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0412  RNA methyltransferase  29.73 
 
 
458 aa  229  7e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4832  RNA methyltransferase, TrmA family  30.41 
 
 
459 aa  229  8e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000374128  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0491  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  30.63 
 
 
459 aa  229  8e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.116806  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0404  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase  30.63 
 
 
459 aa  229  8e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.039244  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0400  RNA methyltransferase  30.63 
 
 
459 aa  229  8e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.955809  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0472  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  30.63 
 
 
459 aa  229  8e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0542  RNA methyltransferase  30.41 
 
 
459 aa  228  2e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.016081  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0311  RNA methyltransferase  29.48 
 
 
458 aa  228  2e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0414  RNA methyltransferase  30.41 
 
 
459 aa  227  4e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.340399  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0426  RNA methyltransferase  30.41 
 
 
459 aa  227  4e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0703  RNA methyltransferase, TrmA family  32.12 
 
 
448 aa  226  4e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1688  RNA methyltransferase, TrmA family  30.73 
 
 
476 aa  226  5.0000000000000005e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.618499 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1751  RNA methyltransferase  30.29 
 
 
453 aa  225  1e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216476  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08576  putative RNA methyltransferase  30.58 
 
 
470 aa  225  1e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.695835  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0467  RNA methyltransferase, TrmA family  32.36 
 
 
454 aa  225  1e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1216  RNA methyltransferase  32.59 
 
 
452 aa  225  1e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2309  RNA methyltransferase  31.67 
 
 
493 aa  225  1e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.12141  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3623  RNA methyltransferase, TrmA family  29.76 
 
 
481 aa  224  2e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2249  RNA methyltransferase, TrmA family  32.57 
 
 
458 aa  224  3e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.79134  hitchhiker  0.00749966 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3305  RNA methyltransferase, TrmA family  31.77 
 
 
460 aa  224  3e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0407  RNA methyltransferase, TrmA family  30.32 
 
 
458 aa  224  3e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2060  RNA methyltransferase  28.98 
 
 
468 aa  223  4e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.23059 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0313  RNA methyltransferase  30.32 
 
 
458 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0301  RNA methyltransferase  30.32 
 
 
458 aa  222  8e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0365  RNA methyltransferase, TrmA family  30.32 
 
 
458 aa  222  8e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1971  23S rRNA methyltransferase/RumA  31.13 
 
 
493 aa  222  8e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.209828  normal  0.0836094 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1197  RNA methyltransferase  32.35 
 
 
454 aa  222  9e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000142692  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0305  RNA methyltransferase  30.32 
 
 
458 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0517475  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0381  RNA methyltransferase, TrmA family  30.09 
 
 
454 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.432112  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4938  RNA methyltransferase, TrmA family  30.09 
 
 
454 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0464028  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1248  RNA methyltransferase, TrmA family  30.04 
 
 
461 aa  218  1e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4802  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  31.17 
 
 
485 aa  218  1e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.810738  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0318  RNA methyltransferase  30.09 
 
 
458 aa  218  2e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.875741  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3634  23S rRNA methyltransferase/RumA  30.7 
 
 
460 aa  218  2e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.226718 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0333  RNA methyltransferase  30.09 
 
 
458 aa  218  2e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2518  RNA methyltransferase  29.68 
 
 
479 aa  218  2e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4083  RNA methyltransferase, TrmA family  31.66 
 
 
461 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4122  RNA methyltransferase, TrmA family  31.66 
 
 
461 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.840048 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3654  TrmA family RNA methyltransferase  29.59 
 
 
455 aa  216  5e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.412422  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0337  RNA methyltransferase, TrmA family  30.21 
 
 
459 aa  216  5e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.95395  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2225  tRNA (uracil-5-) -methyltransferase  30.73 
 
 
419 aa  216  8e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0089  RNA methyltransferase  29.25 
 
 
468 aa  216  9e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000133484  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0652  RNA methyltransferase, TrmA family  31.28 
 
 
441 aa  215  9.999999999999999e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000483498  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1452  RNA methyltransferase  31.49 
 
 
495 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0391  RNA methyltransferase, TrmA family  29.45 
 
 
457 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1868  RNA methyltransferase, TrmA family  30.27 
 
 
485 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0702  tRNA methyltransferase, TrmA family  30.05 
 
 
453 aa  213  4.9999999999999996e-54  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.307327  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06020  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  30.43 
 
 
444 aa  212  9e-54  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.14779  hitchhiker  0.000000000313227 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2144  RNA methyltransferase  30.28 
 
 
439 aa  212  9e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.090086  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0005  TrmA family RNA methyltransferase  30.96 
 
 
468 aa  210  4e-53  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09160  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  29.87 
 
 
441 aa  210  4e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0844867 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1077  RNA methyltransferase, TrmA family  30.39 
 
 
465 aa  210  5e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000901811  normal  0.660905 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1371  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  29.52 
 
 
462 aa  209  8e-53  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000610222  hitchhiker  0.00000000411743 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1295  RNA methyltransferase, TrmA family  29.06 
 
 
436 aa  209  1e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2370  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  32.66 
 
 
451 aa  207  2e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0232  RNA methyltransferase, TrmA family  32.29 
 
 
419 aa  206  5e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000193721  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0147  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  29.28 
 
 
496 aa  207  5e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.689993  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2082  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  32.51 
 
 
452 aa  206  7e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0963  RNA methyltransferase, TrmA family  29.5 
 
 
457 aa  204  2e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.128465  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2695  RNA methyltransferase  30.07 
 
 
457 aa  204  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0159  RNA methyltransferase  29.89 
 
 
468 aa  203  5e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1835  23S rRNA methyltransferase/RumA  29.41 
 
 
440 aa  203  6e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0118794  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2909  RNA methyltransferase, TrmA family  30.38 
 
 
488 aa  202  9.999999999999999e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.501194  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0782  RNA methyltransferase, TrmA family  29.82 
 
 
456 aa  201  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.14607  normal  0.115427 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1383  RNA methyltransferase, TrmA family  27.59 
 
 
479 aa  201  3e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1783  RNA methyltransferase  29.07 
 
 
446 aa  199  7e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0633  RNA methyltransferase  29.38 
 
 
451 aa  199  9e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.449857  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2126  23S rRNA methyltransferase  28.38 
 
 
476 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.965938  normal  0.654469 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1989  RNA methyltransferase, TrmA family  31.77 
 
 
451 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0553091  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>