More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0310 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0466  ATPase  43.81 
 
 
861 aa  643  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1629  ATPase  49.69 
 
 
826 aa  713  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5411  ATPase  45.11 
 
 
953 aa  643  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0379558 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0076  ATPase  45.62 
 
 
811 aa  665  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0835  ATPase  45.43 
 
 
816 aa  674  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0981203  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0181  ATPase  44.31 
 
 
812 aa  667  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.551384  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0054  ATPase  54.45 
 
 
792 aa  791  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000677637  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1438  ATPase  56.78 
 
 
791 aa  878  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1526  ATPase  42.96 
 
 
839 aa  642  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00101266  unclonable  2.18976e-18 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0146  ATPase AAA-2 domain protein  44.79 
 
 
814 aa  673  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1575  ATPase AAA-2 domain protein  45.34 
 
 
814 aa  641  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0010  ATP-binding subunit of Clp protease  43.31 
 
 
869 aa  639  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1489  ATPase AAA-2 domain protein  44.84 
 
 
813 aa  639  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0111  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  45.5 
 
 
811 aa  660  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.2403  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0899  ATPase AAA-2 domain protein  44.14 
 
 
894 aa  643  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  4.1024e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1480  ATPase AAA-2 domain protein  45.45 
 
 
823 aa  682  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0038131  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0102  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  45.62 
 
 
811 aa  662  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0845535  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0260  ATPase  45.64 
 
 
824 aa  661  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0363  ATPase  44.11 
 
 
830 aa  638  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0571642  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0028  ATPase  44.47 
 
 
822 aa  657  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1789  ATPase AAA-2  44.94 
 
 
818 aa  664  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.607583  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0180  ATPase  45.42 
 
 
812 aa  673  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06000  putative ClpA/B protease ATP binding subunit  43.82 
 
 
850 aa  635  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0160864 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1220  ATPase  45.95 
 
 
812 aa  703  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0054  ATPase  55.09 
 
 
792 aa  796  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000145392  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1392  ATPase  56.66 
 
 
791 aa  876  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1494  ATPase  43.1 
 
 
830 aa  668  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  4.00156e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4070  ATPase  45.1 
 
 
825 aa  667  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2437  ATPase AAA-2  46.71 
 
 
825 aa  679  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.643825 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0413  ATPase  53.66 
 
 
789 aa  788  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0597  ATPase  65.41 
 
 
733 aa  1009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.139339  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0564  putative ClpA/B protease ATP binding subunit  44.26 
 
 
932 aa  637  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0076  ATPase  45.88 
 
 
811 aa  663  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2179  ATPase AAA-2  44.06 
 
 
834 aa  638  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.400132  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0676  ATPase AAA-2  47.24 
 
 
886 aa  662  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000220966  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0310  ATPase  100 
 
 
741 aa  1488  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  4.12877e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1200  ATPase  45.48 
 
 
825 aa  671  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0973112  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0025  ATPase AAA-2 domain protein  44.79 
 
 
789 aa  662  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0080  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  45.5 
 
 
811 aa  660  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723248  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2367  ATPases with chaperone activity, ATP-binding subunit  44.21 
 
 
828 aa  639  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  2.78199e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24610  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  43.95 
 
 
866 aa  646  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1000  ATPase AAA-2 domain-containing protein  47.11 
 
 
815 aa  688  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0499037  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1413  chaperone ClpB  46.2 
 
 
812 aa  709  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2740  ATPase AAA-2 domain protein  47.04 
 
 
812 aa  696  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0255  ATPase AAA-2 domain protein  45.32 
 
 
810 aa  668  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.280276  normal  0.406716 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1369  ATPase AAA-2 domain protein  46.5 
 
 
830 aa  643  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.689821 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0077  negative regulator of genetic competence clpC/mecB (ATP-dependent Clp protease)  45.5 
 
 
811 aa  658  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0078  negative regulator of genetic competence clpC/mecB (ATP-dependent Clp protease)  45.5 
 
 
811 aa  660  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0081  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  45.5 
 
 
811 aa  660  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4475  ATPase AAA-2 domain protein  44.53 
 
 
837 aa  645  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1349  ATPase AAA-2 domain protein  45.5 
 
 
820 aa  646  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1399  ATPase AAA-2 domain protein  44.84 
 
 
815 aa  651  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0081  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  45.5 
 
 
811 aa  660  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1194  ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit  45.51 
 
 
812 aa  700  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.453766  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9148  class III stress response-related ATPase  43.39 
 
 
835 aa  640  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1448  ATPase AAA-2 domain protein  45.76 
 
 
822 aa  652  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0023  ATPase AAA-2 domain protein  44.79 
 
 
789 aa  660  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1948  ATPase AAA-2 domain protein  46.58 
 
 
812 aa  677  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0130841  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1419  ATPase AAA-2 domain protein  45.76 
 
 
822 aa  652  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0011  ATPase AAA-2 domain protein  45.34 
 
 
792 aa  650  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1876  ATPase AAA-2 domain protein  45.77 
 
 
821 aa  659  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000589067 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5224  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  45.62 
 
 
811 aa  663  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  5.55448e-05  unclonable  1.16962e-24 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0091  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  45.5 
 
 
811 aa  660  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.7884e-59 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0389  ATPase AAA-2 domain protein  44.75 
 
 
826 aa  649  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0666957  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1850  ATPase AAA-2 domain protein  45.24 
 
 
826 aa  667  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4704  ATPase AAA-2 domain protein  45.92 
 
 
825 aa  662  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.655503 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0327  ATPase AAA-2 domain protein  45.7 
 
 
810 aa  678  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00200367  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1825  ATPase AAA-2 domain protein  45.5 
 
 
829 aa  652  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4348  UvrB/UvrC protein  44.71 
 
 
814 aa  676  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0910  UvrB/UvrC protein  45.89 
 
 
823 aa  665  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01540  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  43.44 
 
 
851 aa  641  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1903  ATPase AAA-2 domain protein  45.26 
 
 
829 aa  656  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.847755  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0684  ATPase AAA-2 domain protein  44.77 
 
 
841 aa  638  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3416  ATPase AAA-2 domain-containing protein  43.98 
 
 
834 aa  645  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4275  ATPase  43.85 
 
 
844 aa  633  1e-180  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.219573 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0220  ATPase  43.03 
 
 
839 aa  634  1e-180  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230139  normal  0.171327 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1682  ATPase AAA-2 domain protein  44.01 
 
 
868 aa  634  1e-180  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.167078 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35440  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  43.78 
 
 
851 aa  633  1e-180  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2237  ATPase AAA-2 domain protein  42.91 
 
 
854 aa  632  1e-180  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0474573  normal  0.336579 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2192  ATPase  43.6 
 
 
836 aa  635  1e-180  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.158504  normal  0.0967388 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4709  ATPase  43.73 
 
 
844 aa  633  1e-180  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0549246  normal  0.0242772 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3461  ATPase  43.39 
 
 
824 aa  632  1e-180  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.385513  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6193  ATPase AAA-2 domain protein  45.66 
 
 
930 aa  632  1e-180  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.809707  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0165  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpC  43.51 
 
 
817 aa  632  1e-180  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2876  ATPase  43.28 
 
 
830 aa  635  1e-180  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0724  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  42.51 
 
 
862 aa  630  1e-179  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0978513 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6311  ATPase AAA-2 domain-containing protein  43.07 
 
 
854 aa  629  1e-179  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3836  ATPase AAA-2 domain-containing protein  44.9 
 
 
825 aa  630  1e-179  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.493394  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0547  ATPase  43.14 
 
 
818 aa  630  1e-179  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3203  ATPase AAA-2 domain protein  43.6 
 
 
853 aa  631  1e-179  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0862  ATPase AAA-2 domain protein  43.39 
 
 
848 aa  630  1e-179  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0856425  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3380  ATPase AAA-2  42.84 
 
 
825 aa  630  1e-179  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.802803  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6423  ATPase  44.36 
 
 
946 aa  630  1e-179  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.707526  normal  0.616913 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1406  ATPase AAA-2  44.36 
 
 
946 aa  630  1e-179  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5495  ATPase  43.12 
 
 
902 aa  631  1e-179  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6998  putative ClpA/B protease, ATPase subunit  43.94 
 
 
949 aa  630  1e-179  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8371  ATPase AAA-2 domain protein  43.44 
 
 
850 aa  629  1e-179  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4738  ATPase AAA-2 domain-containing protein  44.43 
 
 
824 aa  629  1e-179  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7086  ATPase  44.36 
 
 
946 aa  631  1e-179  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.355216  normal  0.126483 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4383  ATPase AAA-2  43.78 
 
 
834 aa  629  1e-179  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.388012 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>