33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0291 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1595  hypothetical protein  79.89 
 
 		 540 aa  896    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0291  NHL repeat-containing protein  100 
 
 		 669 aa  1346    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0086  NHL repeat-containing protein  33.18 
 
 		 680 aa  365  1e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0177  NHL repeat containing protein  32.18 
 
 		 716 aa  323  5e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1591  NHL repeat containing protein  29.45 
 
 		 686 aa  254  4.0000000000000004e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.24269  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3865  NHL repeat-containing protein  24.91 
 
 		 1177 aa  63.9  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0357  NHL repeat containing protein  36.04 
 
 		 700 aa  63.2  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  3.18335e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  24.57 
 
 		 930 aa  58.9  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3112  NHL repeat containing protein  28.48 
 
 		 436 aa  58.5  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0293  NHL repeat-containing protein  22.38 
 
 		 1163 aa  58.2  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.368653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  22.46 
 
 		 1146 aa  57.8  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  24.83 
 
 		 522 aa  57.4  0.0000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1869  NHL repeat-containing protein  24.46 
 
 		 353 aa  57  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0563587 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  23.97 
 
 		 579 aa  54.3  0.000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  22.45 
 
 		 752 aa  52.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  23.58 
 
 		 676 aa  51.2  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3222  NHL repeat-containing protein  40.24 
 
 		 412 aa  50.4  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  23.76 
 
 		 831 aa  49.7  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2758  NHL repeat-containing protein  31.06 
 
 		 396 aa  48.9  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1280  NHL repeat-containing protein  28.85 
 
 		 504 aa  48.9  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.164299  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3179  hypothetical protein  26.47 
 
 		 267 aa  48.5  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000905927  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1869  NHL repeat containing protein  29.63 
 
 		 307 aa  48.5  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2755  NHL repeat-containing protein  32.79 
 
 		 347 aa  47.8  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  22.22 
 
 		 346 aa  47.4  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  23.59 
 
 		 930 aa  47.4  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0890  hypothetical protein  30.77 
 
 		 310 aa  46.6  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  24.35 
 
 		 668 aa  46.2  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0617  NHL repeat-containing protein  25.73 
 
 		 361 aa  44.7  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0567002  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  23.64 
 
 		 343 aa  44.7  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  23.44 
 
 		 1293 aa  44.7  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3159  NHL repeat containing protein  29.46 
 
 		 372 aa  43.9  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1837  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 344 aa  43.9  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.41 
 
 		 344 aa  43.9  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>