More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0236 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_0723  hydrogenase, Fe-only  65.29 
 
 		 582 aa  762    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0236  hydrogenase, Fe-only  100 
 
 		 586 aa  1217    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.660897  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1601  hydrogenase, Fe-only  75.74 
 
 		 582 aa  901    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0747  hydrogenase, Fe-only  65.64 
 
 		 582 aa  766    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2138  hydrogenase, Fe-only  54.7 
 
 		 581 aa  621  1e-176  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000865974  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1299  hydrogenase, Fe-only  51.21 
 
 		 579 aa  593  1e-168  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.130328  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06330  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 75 kDa subunit  52.1 
 
 		 578 aa  586  1e-166  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00021405  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0172  hydrogenase, Fe-only  51.4 
 
 		 573 aa  578  1e-164  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1717  Iron hydrogenase, small subunit  51.22 
 
 		 573 aa  576  1.0000000000000001e-163  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.118526  normal  0.410336 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0844  hydrogenases, Fe-only  50.09 
 
 		 576 aa  576  1.0000000000000001e-163  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1781  hydrogenase, Fe-only  52.41 
 
 		 578 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0342  hydrogenase, Fe-only  49.13 
 
 		 582 aa  564  1.0000000000000001e-159  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1337  hydrogenase, Fe-only  51.05 
 
 		 590 aa  559  1e-158  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1783  hydrogenase, Fe-only  52.18 
 
 		 583 aa  556  1e-157  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0723  hydrogenase, Fe-only  49.74 
 
 		 578 aa  553  1e-156  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1605  NAD-reducing iron-only hydrogenase large subunit  50.09 
 
 		 585 aa  553  1e-156  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2232  hydrogenase, Fe-only  47.49 
 
 		 582 aa  551  1e-155  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1651  hydrogenases, Fe-only  49.56 
 
 		 593 aa  551  1e-155  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.556328  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0150  hydrogenase, Fe-only  49.83 
 
 		 585 aa  551  1e-155  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1149  hydrogenase, Fe-only  50.26 
 
 		 569 aa  547  1e-154  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000253121  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1633  NAD-reducing iron-only hydrogenase large subunit  49.4 
 
 		 585 aa  540  9.999999999999999e-153  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000469619  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2467  hydrogenase, Fe-only  49.31 
 
 		 574 aa  541  9.999999999999999e-153  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02980  NADH dehydrogenase I subunit G  50.26 
 
 		 570 aa  540  9.999999999999999e-153  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3290  hydrogenases, Fe-only  46.56 
 
 		 594 aa  535  1e-151  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0147  [Fe] hydrogenase, large subunit HymC, putative  48.25 
 
 		 573 aa  531  1e-149  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3805  hydrogenase, Fe-only  46.31 
 
 		 582 aa  530  1e-149  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0224  hydrogenase, Fe-only  48.78 
 
 		 573 aa  530  1e-149  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0152  hydrogenase, Fe-only  48.06 
 
 		 580 aa  527  1e-148  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_155  [Fe] hydrogenase, Hym C subunit  48.08 
 
 		 573 aa  525  1e-148  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01810  NADH dehydrogenase I subunit G  46.68 
 
 		 666 aa  525  1e-148  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000616939  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1017  iron hydrogenase, small subunit  47.39 
 
 		 574 aa  513  1e-144  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3601  hydrogenase, Fe-only  47.33 
 
 		 587 aa  505  9.999999999999999e-143  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1544  hydrogenase, Fe-only  46.37 
 
 		 581 aa  505  9.999999999999999e-143  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0625  hydrogenase, Fe-only  46.93 
 
 		 587 aa  504  1e-141  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000144729  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2436  (Fe) hydrogenase, large subunit HymC, putative  45.42 
 
 		 563 aa  493  9.999999999999999e-139  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000128912  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1085  hydrogenase, Fe-only  45.3 
 
 		 577 aa  491  1e-137  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3829  hydrogenase, Fe-only  43.89 
 
 		 625 aa  485  1e-136  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0533  hydrogenase, Fe-only  46.52 
 
 		 582 aa  484  1e-135  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0310904  normal  0.240554 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1548  hydrogenase, Fe-only  44.76 
 
 		 615 aa  481  1e-134  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0137  hydrogenase, Fe-only  41.95 
 
 		 619 aa  482  1e-134  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1384  hydrogenases, Fe-only  42.08 
 
 		 606 aa  477  1e-133  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1490  hydrogenases, Fe-only  42.56 
 
 		 601 aa  474  1e-132  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2303  hydrogenase, Fe-only  41.45 
 
 		 562 aa  469  1.0000000000000001e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2502  iron-containing hydrogenase, Hyd gamma  41.06 
 
 		 598 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0430  hydrogenase, Fe-only  43.18 
 
 		 566 aa  462  9.999999999999999e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.735126  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2159  hydrogenase, Fe-only  43.08 
 
 		 582 aa  456  1e-127  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2341  iron hydrogenase  43.35 
 
 		 572 aa  454  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1593  Fe-hydrogenase  43.55 
 
 		 596 aa  447  1.0000000000000001e-124  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2655  iron hydrogenase  43.01 
 
 		 572 aa  447  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0087  hydrogenase, Fe-only  40.25 
 
 		 567 aa  429  1e-118  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0290  hydrogenase, Fe-only  46.98 
 
 		 549 aa  424  1e-117  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.199872  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1654  hydrogenases, Fe-only  41.98 
 
 		 659 aa  423  1e-117  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.357121  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0168  hydrogenase, Fe-only  47.65 
 
 		 513 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.191335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0463  hydrogenases, Fe-only  45.36 
 
 		 520 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4621  hydrogenase, Fe-only  46.9 
 
 		 527 aa  409  1e-113  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16530  hydrogenase, Fe-only  41.42 
 
 		 569 aa  406  1.0000000000000001e-112  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.143158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1319  hydrogenase large subunit  39.51 
 
 		 645 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1367  hydrogenase large subunit  39.51 
 
 		 645 aa  405  1e-111  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0225  hydrogenase, Fe-only  38.81 
 
 		 667 aa  400  9.999999999999999e-111  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0490  hydrogenase large subunit  38.99 
 
 		 653 aa  397  1e-109  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0157  hydrogenase, Fe-only  49.46 
 
 		 523 aa  395  1e-109  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.434937  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0560  hydrogenase, Fe-only  38.93 
 
 		 666 aa  391  1e-107  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00291892  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3003  hydrogenase, Fe-only  44.62 
 
 		 644 aa  382  1e-104  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0475  ferredoxin hydrogenase  43.31 
 
 		 458 aa  372  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1076  [Fe] hydrogenase  45.77 
 
 		 696 aa  370  1e-101  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.723256  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2037  hydrogenase, Fe-only  43.65 
 
 		 1150 aa  364  2e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163812  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0938  periplasmic [Fe] hydrogenase 1  45.37 
 
 		 696 aa  362  1e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625857  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1883  ferredoxin hydrogenase  42.52 
 
 		 460 aa  356  5.999999999999999e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1925  ferredoxin hydrogenase  50.29 
 
 		 387 aa  329  7e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2056  hydrogenase, Fe-only  41.71 
 
 		 644 aa  315  1.9999999999999998e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000410653  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3250  hydrogenases, Fe-only  44.44 
 
 		 410 aa  302  9e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.644479  hitchhiker  0.0000163586 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0711  response regulator receiver protein  44.5 
 
 		 410 aa  302  9e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.312278  hitchhiker  0.0000873565 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2281  ferredoxin hydrogenase  42.72 
 
 		 439 aa  300  4e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3920  periplasmic Fe hydrogenase, large subunit  44.44 
 
 		 410 aa  299  1e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1386  hydrogenases, Fe-only  44.57 
 
 		 421 aa  297  4e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.999103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0848  hydrogenases, Fe-only  45.25 
 
 		 417 aa  293  6e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1503  hydrogenase, Fe-only  44.79 
 
 		 418 aa  290  5.0000000000000004e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.349556  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0081  ferredoxin hydrogenase  43.25 
 
 		 421 aa  276  6e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0310  ferredoxin hydrogenase  29.11 
 
 		 462 aa  188  3e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0100  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.79 
 
 		 893 aa  186  8e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000102152  hitchhiker  0.000000000000206048 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0156  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.04 
 
 		 898 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3503  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.46 
 
 		 900 aa  179  1e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0344  NADH dehydrogenase I, G subunit, putative  39.82 
 
 		 826 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0386  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.59 
 
 		 917 aa  174  2.9999999999999996e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0704  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.86 
 
 		 900 aa  173  5.999999999999999e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3507  formate dehydrogenase, alpha subunit  36 
 
 		 893 aa  173  1e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3132  molybdopterin oxidoreductase  40.67 
 
 		 815 aa  170  8e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33837  predicted protein  32.62 
 
 		 473 aa  169  1e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.40604 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1398  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.51 
 
 		 893 aa  167  5.9999999999999996e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3504  ferredoxin  34.85 
 
 		 312 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3920  molybdopterin oxidoreductase  39.82 
 
 		 821 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.403816  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3617  molybdopterin oxidoreductase  39.81 
 
 		 850 aa  164  3e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4113  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.67 
 
 		 901 aa  164  3e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.163208  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0030  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  33.89 
 
 		 359 aa  164  3e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00062453  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3509  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.28 
 
 		 905 aa  164  3e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.434543  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4004  molybdopterin oxidoreductase  39.37 
 
 		 821 aa  164  6e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.08061e-23 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1831  NADH dehydrogenase I chain G  40.78 
 
 		 363 aa  163  6e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1856  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  32.85 
 
 		 351 aa  163  9e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2312  formate dehydrogenase subunit alpha  39.44 
 
 		 899 aa  162  1e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2705  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  38.24 
 
 		 355 aa  162  1e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.223751 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>