More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0199 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0199  elongation factor Ts  100 
 
 		 197 aa  401  1e-111  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000300429  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0786  elongation factor Ts  75.9 
 
 		 196 aa  313  9.999999999999999e-85  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1268  elongation factor Ts  64.97 
 
 		 199 aa  267  5.9999999999999995e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.890354  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1187  elongation factor Ts  63.96 
 
 		 199 aa  263  1e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000118419  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1202  elongation factor Ts  62.44 
 
 		 198 aa  261  3e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000235333  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0743  translation elongation factor Ts  60.41 
 
 		 197 aa  259  2e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000548814  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1033  elongation factor Ts  61.54 
 
 		 203 aa  252  3e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000048083  unclonable  0.00000000911443 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0565  elongation factor Ts  59.9 
 
 		 219 aa  251  6e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.132567  normal  0.116393 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1420  translation elongation factor Ts  59.18 
 
 		 218 aa  249  2e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0106114  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0283  elongation factor Ts  60.71 
 
 		 219 aa  247  7e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.975706  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0579  translation elongation factor Ts  57.65 
 
 		 202 aa  246  1e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0294  elongation factor Ts  60.2 
 
 		 219 aa  247  1e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.285714  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0272  elongation factor Ts  60.71 
 
 		 219 aa  246  1e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0607  translation elongation factor Ts  54.82 
 
 		 201 aa  246  1e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928696  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1815  elongation factor Ts  58.97 
 
 		 204 aa  246  2e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299653  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0475  translation elongation factor Ts  53.85 
 
 		 198 aa  245  3e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000567359  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1251  elongation factor Ts  58.38 
 
 		 216 aa  245  4e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000345397  hitchhiker  0.0000644664 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3212  translation elongation factor Ts  57.87 
 
 		 216 aa  244  6.999999999999999e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000140585  hitchhiker  0.0000000047581 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1920  elongation factor Ts  56.85 
 
 		 216 aa  242  1.9999999999999999e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0443  elongation factor Ts  57.95 
 
 		 215 aa  242  3e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000208997  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1660  elongation factor Ts  60.51 
 
 		 204 aa  242  3e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000188674  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2755  elongation factor Ts  57.36 
 
 		 216 aa  240  7.999999999999999e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0741161  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1486  elongation factor Ts  57.36 
 
 		 216 aa  240  7.999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00196181 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4960  translation elongation factor Ts  57.14 
 
 		 198 aa  239  2e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3732  elongation factor Ts  56.35 
 
 		 216 aa  236  2e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000229011  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1720  translation elongation factor Ts  59.9 
 
 		 197 aa  236  2e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2923  translation elongation factor Ts  55.61 
 
 		 200 aa  235  4e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.464491 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0576  elongation factor Ts  63.96 
 
 		 197 aa  234  8e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000429292  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5314  translation elongation factor Ts  54.87 
 
 		 218 aa  228  4e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0783881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1428  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  52.31 
 
 		 216 aa  226  2e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000020519  normal  0.0754659 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1977  elongation factor Ts  62.24 
 
 		 217 aa  226  2e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00032588  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0883  elongation factor Ts  59.49 
 
 		 214 aa  225  3e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000135529  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0294  elongation factor Ts  60.71 
 
 		 219 aa  224  5.0000000000000005e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0828484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3708  elongation factor Ts  53.06 
 
 		 217 aa  223  2e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0003434  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1132  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  55.15 
 
 		 198 aa  221  4e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1005  elongation factor Ts  57.95 
 
 		 215 aa  220  9.999999999999999e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000692768  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1779  translation elongation factor Ts  48.98 
 
 		 210 aa  218  3.9999999999999997e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1965  translation elongation factor Ts  53.93 
 
 		 196 aa  218  6e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1781  translation elongation factor Ts  55.5 
 
 		 196 aa  217  1e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000010649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1152  translation elongation factor Ts  55.33 
 
 		 286 aa  214  5e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4235  elongation factor Ts  53.3 
 
 		 263 aa  212  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00023006 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3527  elongation factor Ts  53.81 
 
 		 250 aa  211  5.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.84693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2579  elongation factor Ts  53.81 
 
 		 249 aa  211  7e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2531  elongation factor Ts  51.78 
 
 		 221 aa  204  7e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.339571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08151  elongation factor Ts  51.53 
 
 		 218 aa  202  3e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0762  elongation factor Ts  51.53 
 
 		 218 aa  202  3e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.670282  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16651  elongation factor Ts  51.27 
 
 		 218 aa  200  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.521218 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08141  elongation factor Ts  51.02 
 
 		 218 aa  200  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.119849  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08301  elongation factor Ts  51.52 
 
 		 218 aa  199  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1246  elongation factor Ts  48.48 
 
 		 219 aa  196  2.0000000000000003e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.794499  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1223  elongation factor Ts  48.99 
 
 		 220 aa  193  1e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.310853 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1399  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  47.87 
 
 		 207 aa  193  1e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00253635  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3926  translation elongation factor Ts  52.82 
 
 		 176 aa  191  7e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0719169 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1162  translation elongation factor Ts  46.73 
 
 		 259 aa  190  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0158  elongation factor Ts  48.73 
 
 		 218 aa  189  2e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.496244  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1160  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  48.24 
 
 		 219 aa  189  2e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000237926 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07901  elongation factor Ts  48.73 
 
 		 218 aa  189  2e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.987366 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4502  translation elongation factor Ts  53.16 
 
 		 189 aa  189  2.9999999999999997e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.231763  normal  0.24171 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2018  translation elongation factor Ts  52.31 
 
 		 176 aa  189  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.666479  hitchhiker  0.00383006 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3580  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  47.24 
 
 		 204 aa  188  5.999999999999999e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10091  elongation factor Ts  47.21 
 
 		 218 aa  187  5.999999999999999e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.136802 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3516  translation elongation factor Ts  48.26 
 
 		 200 aa  184  9e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.412174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_320  translation elongation factor Ts  46.94 
 
 		 167 aa  179  2e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00206685  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0956  translation elongation factor Ts  44.61 
 
 		 221 aa  179  2.9999999999999997e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0358  elongation factor Ts  46.43 
 
 		 167 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000023974  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0376  elongation factor Ts  45.92 
 
 		 167 aa  177  1e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0834304  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49408  predicted protein  42.93 
 
 		 440 aa  174  7e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0526  Translation elongation factor EFTs/EF1B dimerisation  45.88 
 
 		 177 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00005849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1519  Translation elongation factor EFTs/EF1B dimerization  45.18 
 
 		 152 aa  150  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2060  elongation factor Ts  41.24 
 
 		 313 aa  142  4e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_7588  predicted protein  44.85 
 
 		 202 aa  138  4.999999999999999e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.673567  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4882  translation elongation factor Ts  40.1 
 
 		 314 aa  134  9.999999999999999e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1942  translation elongation factor Ts  42.45 
 
 		 286 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2709  elongation factor Ts  38.14 
 
 		 311 aa  130  9e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.203498  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1275  elongation factor Ts  44.21 
 
 		 273 aa  130  1.0000000000000001e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0553471  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2045  elongation factor Ts  44.29 
 
 		 312 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00216112  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2210  elongation factor Ts  30.88 
 
 		 271 aa  128  6e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.126056  normal  0.227569 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2980  elongation factor Ts  61.32 
 
 		 285 aa  127  9.000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.340847  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2109  elongation factor Ts  41.43 
 
 		 287 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0008  translation elongation factor Ts  57.55 
 
 		 276 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120995  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3164  elongation factor Ts  56.52 
 
 		 285 aa  125  6e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.347737  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1920  translation elongation factor Ts  40.69 
 
 		 303 aa  124  8.000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1869799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1841  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  38.46 
 
 		 303 aa  124  1e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1160  elongation factor Ts  37.63 
 
 		 293 aa  123  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0347  elongation factor Ts  58.59 
 
 		 286 aa  122  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1862  elongation factor Ts  40.62 
 
 		 292 aa  121  6e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.981206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1014  elongation factor Ts  63.16 
 
 		 285 aa  121  7e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140304  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3434  elongation factor Ts  63.16 
 
 		 285 aa  121  7e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000483484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1441  elongation factor Ts  41.36 
 
 		 354 aa  121  7e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1067  elongation factor Ts  63.16 
 
 		 285 aa  121  7e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0055688  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0079  translation elongation factor Ts  59.79 
 
 		 294 aa  121  8e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000572472  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0214  translation elongation factor Ts  43.88 
 
 		 292 aa  120  9.999999999999999e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1284  elongation factor Ts  58.25 
 
 		 294 aa  120  9.999999999999999e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000149192  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08140  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  41.61 
 
 		 288 aa  120  9.999999999999999e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.104482  hitchhiker  0.0000000435268 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1104  translation elongation factor Ts  37.11 
 
 		 286 aa  120  1.9999999999999998e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000532403  unclonable  0.00000000000000104314 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1809  elongation factor Ts  44.37 
 
 		 288 aa  119  1.9999999999999998e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.864602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2377  translation elongation factor Ts  53.85 
 
 		 267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2012  elongation factor Ts  58.76 
 
 		 288 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.895136  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0568  elongation factor Ts  61.11 
 
 		 293 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.011982  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1196  elongation factor Ts  51.54 
 
 		 357 aa  118  7e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>