More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0189 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0189  ABC transporter related  100 
 
 
313 aa  622  1e-177  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1722  ABC transporter related  45.33 
 
 
293 aa  255  8e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1780  ABC transporter related  45.33 
 
 
293 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.09165  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0454  ABC transporter related  43.9 
 
 
286 aa  224  2e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1186  ABC transporter related  39.86 
 
 
290 aa  218  7.999999999999999e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2159  ABC transporter related  39.66 
 
 
293 aa  213  2.9999999999999995e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.548665  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1774  ABC transporter related protein  36.7 
 
 
304 aa  204  1e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1634  ABC transporter related  37.46 
 
 
297 aa  188  1e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00180587  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4579  ABC transporter related  33.11 
 
 
300 aa  187  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.146186  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2985  ABC transporter related protein  36.72 
 
 
327 aa  187  2e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1839  ABC transporter related  33.88 
 
 
339 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4248  ABC transporter related protein  34.02 
 
 
390 aa  182  6e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0089  ABC transporter related  36.15 
 
 
307 aa  182  8.000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1245  ABC transporter related protein  35.79 
 
 
313 aa  181  1e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4499  ABC transporter-related protein  31.76 
 
 
301 aa  179  4e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.151592  normal  0.728129 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2197  ABC transporter related  32.31 
 
 
300 aa  176  4e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.922489 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3549  ABC transporter related protein  31.97 
 
 
308 aa  175  7e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.156149 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0323  ABC transporter related  43.28 
 
 
302 aa  174  9.999999999999999e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.309009 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1836  ABC transporter related  41.75 
 
 
298 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2206  ABC transporter related  31.12 
 
 
307 aa  172  5e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.758752  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2252  ABC transporter related  31.12 
 
 
307 aa  172  5e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.951966  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5524  ABC transporter related protein  30.9 
 
 
304 aa  172  6.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1051  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.65 
 
 
302 aa  171  1e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0080  ABC transporter related  32.07 
 
 
305 aa  171  2e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0655  ABC transporter, ATP-binding protein  42.03 
 
 
295 aa  171  2e-41  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3755  ABC transporter related  31.72 
 
 
306 aa  170  3e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2771  ABC transporter related  30.14 
 
 
307 aa  169  4e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000160437 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2195  ABC transporter related  30.77 
 
 
307 aa  169  5e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.144611  normal  0.0488033 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0145  ABC transporter related protein  38.86 
 
 
340 aa  166  5e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1757  ABC transporter related  31.74 
 
 
306 aa  166  5e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000332956  normal  0.307261 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11242  tetronasin ABC transporter ATP-binding protein  32.31 
 
 
311 aa  165  9e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0309392  normal  0.0409812 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3997  ABC transporter related  31.29 
 
 
313 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.453886  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1665  ABC transporter related  37.1 
 
 
316 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148623  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2559  ABC transporter related  32.07 
 
 
309 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4071  ABC transporter related  31.29 
 
 
313 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.146154  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4011  ABC transporter related  31.29 
 
 
313 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0155501  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0101  ABC transporter related protein  31.71 
 
 
299 aa  164  2.0000000000000002e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.690768  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0997  ABC transporter related  39.6 
 
 
291 aa  164  2.0000000000000002e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.437755 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5390  ABC transporter ATP-binding protein  37.44 
 
 
307 aa  162  5.0000000000000005e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22127  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3674  ABC transporter related protein  31.51 
 
 
309 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1987  ABC transporter, ATP-binding protein  33.77 
 
 
314 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00134078  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7394  ABC transporter ATP-binding protein  29.37 
 
 
306 aa  162  8.000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36950  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  37.02 
 
 
302 aa  161  1e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.369481  normal  0.0795079 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0251  ABC transporter related protein  38.28 
 
 
297 aa  161  1e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25800  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  30.74 
 
 
312 aa  160  2e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4862  ABC transporter related  31.38 
 
 
280 aa  160  3e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0537  ABC transporter related  31.25 
 
 
306 aa  160  4e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3201  ABC transporter-like protein  36.36 
 
 
309 aa  159  5e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0999  ABC transporter related protein  38.42 
 
 
300 aa  159  6e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.438735  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2719  ABC transporter related  37.8 
 
 
308 aa  158  9e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1988  ABC transporter, ATP-binding protein  39.05 
 
 
293 aa  158  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000119924  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2922  ABC transporter related protein  28.72 
 
 
304 aa  158  1e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0350  ABC transporter, ATP-binding protein  35.39 
 
 
541 aa  158  1e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6149  ABC transporter related  37.21 
 
 
328 aa  157  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.146802 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5390  ABC transporter related protein  36.49 
 
 
305 aa  157  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.629555  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2585  ABC transporter related  31.99 
 
 
302 aa  156  4e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.557459 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1219  ABC transporter related  35.53 
 
 
299 aa  156  5.0000000000000005e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.538125  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0353  ABC transporter related  36.67 
 
 
303 aa  155  6e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2618  ABC transporter related  37.56 
 
 
317 aa  155  8e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000477395  normal  0.0769479 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0858  ABC transporter related protein  37.95 
 
 
303 aa  155  1e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00621522  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06690  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  30.82 
 
 
317 aa  154  1e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1681  ABC transporter related protein  38.39 
 
 
305 aa  154  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.283313 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1723  ABC transporter ATP-binding protein  34.4 
 
 
308 aa  155  1e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2540  ABC transporter related  36.84 
 
 
308 aa  155  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.913826  normal  0.404548 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1164  ABC transporter related  30.28 
 
 
302 aa  154  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000328478  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5634  ABC transporter related  35.89 
 
 
298 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0393494 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2782  ABC transporter related  35.92 
 
 
302 aa  153  4e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.561462  decreased coverage  0.00015802 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0078  ABC transporter related  34 
 
 
287 aa  153  5e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2211  ABC transporter related  29.9 
 
 
312 aa  152  5e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0022  ABC transporter ATP-binding protein, CesC  31.86 
 
 
291 aa  152  7e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0073  ABC transporter related  35.09 
 
 
287 aa  152  8e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1207  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.32 
 
 
279 aa  151  1e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4276  ABC transporter related  35.09 
 
 
287 aa  151  1e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3702  ABC transporter, ATP-binding protein  29.21 
 
 
297 aa  151  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000381067  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3610  ABC transporter, ATP-binding protein  28.81 
 
 
297 aa  150  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000012403  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3620  ABC transporter, ATP-binding protein  29.84 
 
 
297 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000627092  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0075  ABC transporter related  35.32 
 
 
287 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0322  ABC transporter related  35.41 
 
 
302 aa  150  2e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3351  ABC transporter, ATP-binding protein  28.87 
 
 
297 aa  150  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182827  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4073  ABC transporter related protein  29.57 
 
 
309 aa  150  3e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00347724  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3604  ABC transporter, ATP-binding protein  28.87 
 
 
297 aa  149  4e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.12304e-23 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3388  ABC transporter ATP-binding protein  28.87 
 
 
297 aa  149  4e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.955224  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3300  ABC transporter, ATP-binding protein  28.87 
 
 
297 aa  149  4e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000068812  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22150  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  35.71 
 
 
324 aa  150  4e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.228771 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3653  ABC transporter ATP-binding protein  28.87 
 
 
297 aa  149  4e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.169658  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0076  ABC transporter related  31.45 
 
 
287 aa  149  4e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3573  ABC transporter, ATP-binding protein  33.77 
 
 
284 aa  150  4e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0078  ABC transporter related  31.45 
 
 
287 aa  149  5e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000932983 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0074  ABC transporter related  31.45 
 
 
287 aa  149  6e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0555  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.96 
 
 
907 aa  149  8e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2724  ABC transporter related protein  30 
 
 
298 aa  149  8e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.998254  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4174  ABC transporter related  38.07 
 
 
295 aa  148  9e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1664  ABC transporter related  35.71 
 
 
298 aa  148  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0987  ABC-2:ABC transporter related  35.89 
 
 
920 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.149444  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1109  ABC transporter related  37.62 
 
 
303 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3230  ABC transporter related  37.67 
 
 
316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0381022 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0634  ABC transporter related  33.45 
 
 
299 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000003558  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13010  ABC transporter related  34.42 
 
 
310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3778  ABC transporter-related protein  34.5 
 
 
283 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0059  ABC transporter related  34.4 
 
 
287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>