52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0185 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0185  phosphodiesterase  100 
 
 		 164 aa  335  9.999999999999999e-92  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0026  phosphodiesterase  53.8 
 
 		 158 aa  189  1e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.239005  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1362  phosphodiesterase  51.9 
 
 		 158 aa  181  4.0000000000000006e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0718  phosphodiesterase  45.57 
 
 		 158 aa  178  2e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.205538  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0694  phosphodiesterase  45.57 
 
 		 158 aa  178  2e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0437  phosphodiesterase, MJ0936 family  47.88 
 
 		 167 aa  146  1.0000000000000001e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0908  phosphodiesterase  40.37 
 
 		 175 aa  136  1e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.808433  normal  0.308867 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0763  phosphodiesterase  40.99 
 
 		 168 aa  134  8e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.420804  normal  0.111199 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2220  phosphodiesterase  36.59 
 
 		 168 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0660952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0517  phosphodiesterase  38.89 
 
 		 171 aa  121  5e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.745546  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1245  phosphodiesterase  38.27 
 
 		 171 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1391  phosphodiesterase  37.89 
 
 		 171 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1588  phosphodiesterase  37.65 
 
 		 176 aa  115  3e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.398386  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1380  phosphodiesterase  37.04 
 
 		 171 aa  111  5e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1231  phosphodiesterase  37.65 
 
 		 173 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.234159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1431  phosphodiesterase  32.92 
 
 		 165 aa  102  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0138  hypothetical protein  36.02 
 
 		 166 aa  99.4  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0201  phosphodiesterase  34.55 
 
 		 168 aa  99.8  2e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.605154  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1432  phosphodiesterase  35.76 
 
 		 166 aa  96.7  1e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0917348 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2093  phosphodiesterase, MJ0936 family  38.52 
 
 		 167 aa  95.1  4e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.253727  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2746  phosphodiesterase  32.32 
 
 		 176 aa  84.7  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2678  phosphodiesterase  31.85 
 
 		 162 aa  84.3  7e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0024  phosphodiesterase  34.29 
 
 		 163 aa  84  8e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3652  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.9 
 
 		 166 aa  82.4  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0572  hypothetical protein  33.12 
 
 		 174 aa  77.4  0.00000000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0170  hypothetical protein  29.61 
 
 		 173 aa  74.7  0.0000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0530  phosphodiesterase, MJ0936 family  35.07 
 
 		 162 aa  72.8  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0060  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.45 
 
 		 178 aa  72.4  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.876718  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1906  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.29 
 
 		 184 aa  69.7  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1651  hypothetical protein  27.38 
 
 		 183 aa  63.5  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000844745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2556  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.58 
 
 		 163 aa  62.4  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.438723  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1550  phosphodiesterase  32.58 
 
 		 180 aa  62  0.000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0341  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.99 
 
 		 171 aa  58.5  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.431716  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1477  phosphodiesterase  28.12 
 
 		 148 aa  49.7  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2350  hypothetical protein  31.3 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.24559 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1420  phosphodiesterase, MJ0936 family  25.9 
 
 		 181 aa  46.2  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.856818  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5359  phosphodiesterase  25.49 
 
 		 172 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4978  hypothetical protein  25.32 
 
 		 172 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.703942  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0099  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.92 
 
 		 169 aa  45.8  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5066  phosphodiesterase  25.32 
 
 		 172 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1399  phosphodiesterase, MJ0936 family  22.98 
 
 		 163 aa  43.5  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.66731  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2610  phosphoesterase, putative  29.2 
 
 		 152 aa  43.9  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0330277  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1354  phosphodiesterase, MJ0936 family  24.82 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000205974  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3653  phosphodiesterase  26.01 
 
 		 238 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0619725  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03300  phosphoesterase protein  26.43 
 
 		 151 aa  42.4  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.620314  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2498  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.29 
 
 		 157 aa  42.4  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0714523  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0839  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.5 
 
 		 158 aa  42  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0437301  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2058  phosphodiesterase, MJ0936 family  24.1 
 
 		 168 aa  42  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000252538 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2834  phosphodiesterase, MJ0936 family  23.87 
 
 		 179 aa  42  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000207557  normal  0.0308654 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2317  phosphodiesterase  24.64 
 
 		 174 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179128  normal  0.0832015 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1949  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.56 
 
 		 178 aa  41.2  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0118303  normal  0.874816 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0735  phosphoesterase, putative  26.52 
 
 		 169 aa  41.2  0.006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>