More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0181 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0205  ribonuclease R  59.24 
 
 		 710 aa  867    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0207  ribonuclease R  59.38 
 
 		 710 aa  868    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0181  ribonuclease R  100 
 
 		 766 aa  1552    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.129563  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1513  ribonuclease R  66.38 
 
 		 704 aa  914    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0815616  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0973  ribonuclease R  55.68 
 
 		 737 aa  764    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2108  ribonuclease R  45.15 
 
 		 716 aa  561  1e-158  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0218671  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2955  ribonuclease R  42.4 
 
 		 762 aa  547  1e-154  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000417995  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3125  ribonuclease R  44.28 
 
 		 758 aa  547  1e-154  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2866  ribonuclease R  42.27 
 
 		 716 aa  535  1e-150  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0172601  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0450  VacB/RNase II family exoribonuclease  41.23 
 
 		 792 aa  531  1e-149  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0329  ribonuclease R  40.96 
 
 		 706 aa  531  1e-149  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00226264  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5278  ribonuclease R  42.67 
 
 		 806 aa  527  1e-148  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000124073  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5232  ribonuclease R  42.67 
 
 		 806 aa  526  1e-148  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4956  ribonuclease R  42.67 
 
 		 808 aa  526  1e-148  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.744879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4808  ribonuclease R (RNase R)  42.67 
 
 		 804 aa  526  1e-148  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000493308  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5214  ribonuclease R  42.53 
 
 		 806 aa  526  1e-148  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.69895 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5334  ribonuclease R  42.67 
 
 		 808 aa  526  1e-148  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000223572  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2247  ribonuclease R  38.98 
 
 		 788 aa  525  1e-148  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.165281  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4818  ribonuclease R (RNase R)  42.53 
 
 		 810 aa  525  1e-147  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.174115  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5243  ribonuclease R  42.53 
 
 		 808 aa  525  1e-147  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5709  ribonuclease R  42.53 
 
 		 812 aa  524  1e-147  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0120471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3673  ribonuclease R  42.57 
 
 		 792 aa  524  1e-147  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0298135  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4921  ribonuclease R  42.25 
 
 		 814 aa  523  1e-147  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.411267  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0805  ribonuclease R  40.74 
 
 		 790 aa  520  1e-146  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.127645  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0821  ribonuclease R  40.74 
 
 		 790 aa  520  1e-146  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0747  ribonuclease R  42.72 
 
 		 903 aa  517  1.0000000000000001e-145  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.197271  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1353  ribonuclease R  43.24 
 
 		 722 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00219332  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0146  ribonuclease R  43.51 
 
 		 757 aa  510  1e-143  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.234188  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1292  ribonuclease R  42.73 
 
 		 751 aa  509  1e-143  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000149292  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0210  ribonuclease R  40.67 
 
 		 715 aa  508  9.999999999999999e-143  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0123436  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1502  ribonuclease R  42.59 
 
 		 751 aa  508  9.999999999999999e-143  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.211368  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15730  ribonuclease R  41.16 
 
 		 706 aa  505  1e-141  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000333488  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2010  ribonuclease R  40.9 
 
 		 709 aa  502  1e-140  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000115062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1386  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II:ribonuclease R  40.7 
 
 		 759 aa  497  1e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000570433  normal  0.26711 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2699  ribonuclease R  38.89 
 
 		 763 aa  489  1e-136  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0320356  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1485  ribonuclease R, putative  38 
 
 		 763 aa  484  1e-135  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36573  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0280  exoribonuclease II  39.86 
 
 		 705 aa  484  1e-135  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000108449  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0273  ribonuclease R  37.97 
 
 		 770 aa  479  1e-133  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.112412  normal  0.673615 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1439  exoribonuclease R  41.89 
 
 		 726 aa  474  1e-132  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1200  ribonuclease R  40.25 
 
 		 751 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1015  exoribonuclease R  40.59 
 
 		 810 aa  466  9.999999999999999e-131  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0394  ribonuclease R  41.04 
 
 		 801 aa  465  1e-129  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00157968  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1243  ribonuclease R  39.75 
 
 		 752 aa  464  1e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0149067  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1303  exoribonuclease R  41.73 
 
 		 779 aa  461  9.999999999999999e-129  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00042422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0674  exoribonuclease R  40.6 
 
 		 817 aa  461  9.999999999999999e-129  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1625  ribonuclease R  40.14 
 
 		 737 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2152  exoribonuclease RNase R  37.2 
 
 		 720 aa  452  1e-125  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1629  ribonuclease R  36.86 
 
 		 709 aa  450  1e-125  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.290975 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1172  ribonuclease R  35.99 
 
 		 777 aa  443  1e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000369652  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1726  exoribonuclease R  42.4 
 
 		 774 aa  444  1e-123  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.388166  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1482  VacB/Rnb family exoribonuclease  41.94 
 
 		 801 aa  442  9.999999999999999e-123  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0098629  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2601  ribonuclease R  39.01 
 
 		 737 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0821887  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0886  ribonuclease R  35.26 
 
 		 801 aa  442  9.999999999999999e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.127406  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0608  RNAse R  38.66 
 
 		 758 aa  437  1e-121  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.189937 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2855  ribonuclease R  38.23 
 
 		 733 aa  437  1e-121  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.180659 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0580  ribonuclease R  36.48 
 
 		 758 aa  436  1e-121  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000747077 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0752  exoribonuclease II  37.13 
 
 		 833 aa  435  1e-120  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000040627  hitchhiker  0.00244525 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3590  ribonuclease R  35.68 
 
 		 819 aa  432  1e-120  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0101048  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0697  RNAse R  35.78 
 
 		 809 aa  432  1e-120  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00112836  hitchhiker  0.000328486 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2072  RNAse R  36.01 
 
 		 870 aa  431  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.927626  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3264  RNAse R  35.82 
 
 		 808 aa  432  1e-119  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000483036  decreased coverage  0.00000524837 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0683  RNAse R  35.7 
 
 		 808 aa  431  1e-119  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0668572  hitchhiker  0.000463961 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1522  ribonuclease R  36.15 
 
 		 827 aa  428  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.351431  normal  0.0857248 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1976  ribonuclease R  36.34 
 
 		 755 aa  429  1e-118  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1240  ribonuclease R  37.4 
 
 		 764 aa  428  1e-118  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4688  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II/ribonuclease R  36.15 
 
 		 828 aa  427  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00492754  normal  0.623158 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1953  VacB/RNase II family 3'-5' exoribonuclease  36.81 
 
 		 735 aa  428  1e-118  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.223171  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2700  ribonuclease R  37.41 
 
 		 796 aa  429  1e-118  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.749256  normal  0.419976 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0511  ribonuclease R  35.96 
 
 		 817 aa  428  1e-118  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2092  RNAse R  35.64 
 
 		 876 aa  426  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.300457 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2219  ribonuclease R  35.58 
 
 		 863 aa  428  1e-118  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.892711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1066  ribonuclease R  36.15 
 
 		 827 aa  428  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.152985  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2568  ribonuclease R  37.26 
 
 		 764 aa  427  1e-118  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0166651 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0770  ribonuclease R  38.4 
 
 		 708 aa  429  1e-118  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.246847  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1546  ribonuclease R  36.15 
 
 		 827 aa  428  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0569328  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3067  exoribonuclease II  38.95 
 
 		 808 aa  423  1e-117  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.802811  normal  0.171629 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3289  ribonuclease R  36.65 
 
 		 824 aa  425  1e-117  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.457006  hitchhiker  0.0018456 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4880  ribonuclease R  34.42 
 
 		 857 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3935  ribonuclease R  36.74 
 
 		 808 aa  423  1e-117  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4951  ribonuclease R  37.84 
 
 		 865 aa  424  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.408138 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0106  hypothetical protein  36.19 
 
 		 726 aa  423  1e-117  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0091  hypothetical protein  36.05 
 
 		 726 aa  422  1e-117  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0643  RNAse R  35.36 
 
 		 828 aa  424  1e-117  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135735 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1054  RNAse R  33.94 
 
 		 937 aa  424  1e-117  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.947842  normal  0.977325 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4670  ribonuclease R  34.5 
 
 		 859 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.425963  normal  0.0849008 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4936  ribonuclease R  34.3 
 
 		 857 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000328048 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1983  exoribonuclease II  37.39 
 
 		 744 aa  424  1e-117  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0944364 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3355  ribonuclease R  35.77 
 
 		 829 aa  423  1e-117  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.334074  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1891  ribonuclease R  36.59 
 
 		 746 aa  419  1e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3715  ribonuclease R  37.59 
 
 		 795 aa  420  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.713746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0728  ribonuclease R  37.06 
 
 		 807 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.14505  hitchhiker  0.000000257568 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2897  ribonuclease R  36.54 
 
 		 722 aa  422  1e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1565  ribonuclease R  36.59 
 
 		 746 aa  419  1e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000702631 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4760  ribonuclease R  34.3 
 
 		 857 aa  422  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.334111  normal  0.140366 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0830  ribonuclease R  35.56 
 
 		 742 aa  422  1e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0737  ribonuclease R  37.06 
 
 		 807 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.034125  hitchhiker  0.00132247 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1976  ribonuclease R  36.32 
 
 		 746 aa  419  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00374672  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0749  ribonuclease R  36.74 
 
 		 807 aa  419  1e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000988982  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0462  exoribonuclease II  35.29 
 
 		 750 aa  422  1e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1447  ribonuclease R  35.88 
 
 		 817 aa  421  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>