More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0169 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0169  50S ribosomal protein L31  100 
 
 
70 aa  147  7e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  4.57438e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1165  50S ribosomal protein L31  72.73 
 
 
69 aa  114  7e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  3.6585e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0980  50S ribosomal protein L31  64.79 
 
 
71 aa  104  5e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  1.92079e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1150  50S ribosomal protein L31  63.38 
 
 
71 aa  101  4e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  4.42402e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1806  50S ribosomal protein L31  63.64 
 
 
71 aa  97.4  5e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  5.45345e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2060  50S ribosomal protein L31  51.43 
 
 
75 aa  77  7e-14  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.725226  normal  0.0217721 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0061  50S ribosomal protein L31  51.52 
 
 
66 aa  73.6  9e-13  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  1.49068e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0471  ribosomal protein L31  45.45 
 
 
73 aa  73.2  1e-12  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  3.94944e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1117  ribosomal protein L31  51.52 
 
 
153 aa  72.4  2e-12  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  3.20944e-09  hitchhiker  2.56974e-13 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0801  ribosomal protein L31  48.48 
 
 
68 aa  72.4  2e-12  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  1.58788e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1861  50S ribosomal protein L31  47.76 
 
 
72 aa  72  2e-12  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.985858  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2172  50S ribosomal protein L31P  45.45 
 
 
70 aa  72  2e-12  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.316232  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0163  ribosomal protein L31  50.72 
 
 
66 aa  72  2e-12  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0237125  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1150  50S ribosomal protein L31  50.72 
 
 
66 aa  72  3e-12  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2399  ribosomal protein L31  46.97 
 
 
67 aa  71.6  4e-12  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00761276  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0170  50S ribosomal protein L31  51.52 
 
 
65 aa  70.9  5e-12  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0828  50S ribosomal protein L31  53.03 
 
 
66 aa  71.2  5e-12  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00960478  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1712  ribosomal protein L31  43.28 
 
 
76 aa  70.9  5e-12  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00361207  normal  0.842415 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0191  50S ribosomal protein L31  51.52 
 
 
66 aa  70.9  6e-12  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0151  50S ribosomal protein L31  51.52 
 
 
66 aa  70.9  6e-12  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.515789  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0223  50S ribosomal protein L31  51.52 
 
 
66 aa  70.1  9e-12  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0287  50S ribosomal protein L31  49.28 
 
 
66 aa  70.1  1e-11  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0385  50S ribosomal protein L31  44.78 
 
 
75 aa  69.7  1e-11  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  1.43362e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04660  ribosomal protein L31  45.59 
 
 
144 aa  68.9  2e-11  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000382809  hitchhiker  4.89926e-05 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1420  50S ribosomal protein L31  50 
 
 
66 aa  68.9  2e-11  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2874  LSU ribosomal protein L31P  46.97 
 
 
66 aa  68.9  2e-11  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  8.02115e-12  hitchhiker  6.1454e-09 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1910  ribosomal protein L31  48.48 
 
 
67 aa  69.3  2e-11  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2073  50S ribosomal protein L31  43.28 
 
 
75 aa  68.6  3e-11  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  2.64126e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1472  50S ribosomal protein L31P  48.53 
 
 
77 aa  68.6  3e-11  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  2.5459e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0349  50S ribosomal protein L31  47.76 
 
 
75 aa  68.2  3e-11  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  4.14614e-05  normal  0.989516 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3438  50S ribosomal protein L31  45.45 
 
 
66 aa  68.2  4e-11  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3375  ribosomal protein L31  48.48 
 
 
69 aa  68.2  4e-11  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00476029  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0327  50S ribosomal protein L31  45.71 
 
 
70 aa  68.2  4e-11  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.127242  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2402  50S ribosomal protein L31  44.78 
 
 
75 aa  68.2  4e-11  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.115749  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3328  50S ribosomal protein L31  45.45 
 
 
66 aa  67.8  5e-11  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  4.10329e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1910  50S ribosomal protein L31  45.45 
 
 
66 aa  67.8  5e-11  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2301  50S ribosomal protein L31  46.27 
 
 
70 aa  67.8  5e-11  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0377  50S ribosomal protein L31  42.42 
 
 
66 aa  67.4  6e-11  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.71245e-10  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09270  ribosomal protein L31  46.97 
 
 
175 aa  67.8  6e-11  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0668884 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0114  ribosomal protein L31  47.06 
 
 
139 aa  67.4  7e-11  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.434874  normal  0.146385 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0062  ribosomal protein L31  43.28 
 
 
68 aa  67.4  7e-11  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  3.50095e-10  hitchhiker  0.00194298 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18000  ribosomal protein L31  45.45 
 
 
68 aa  67  9e-11  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  3.15531e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1810  ribosomal protein L31  42.42 
 
 
74 aa  67  9e-11  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.731859  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0929  50S ribosomal protein L31  46.97 
 
 
115 aa  66.2  1e-10  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  1.40602e-06  hitchhiker  1.58847e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3712  50S ribosomal protein L31  42.42 
 
 
73 aa  66.2  1e-10  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  1.69936e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0553  50S ribosomal protein L31  46.27 
 
 
70 aa  65.9  2e-10  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00728  50S ribosomal protein L31  45.59 
 
 
72 aa  65.5  3e-10  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3172  50S ribosomal protein L31  42.42 
 
 
66 aa  65.1  3e-10  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  4.31599e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3107  50S ribosomal protein L31  40.91 
 
 
65 aa  65.1  3e-10  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.938901  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0453  50S ribosomal protein L31  41.79 
 
 
71 aa  65.5  3e-10  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3670  50S ribosomal protein L31  46.27 
 
 
70 aa  64.7  4e-10  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0459  50S ribosomal protein L31  46.27 
 
 
70 aa  64.7  4e-10  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3493  50S ribosomal protein L31  46.27 
 
 
70 aa  64.7  4e-10  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1026  50S ribosomal protein L31  42.42 
 
 
66 aa  64.3  5e-10  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000398278  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001744  LSU ribosomal protein L31p  45.59 
 
 
73 aa  64.3  5e-10  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00827277  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4125  ribosomal protein L31  44.29 
 
 
71 aa  63.9  6e-10  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  6.65259e-09  hitchhiker  4.07647e-07 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3807  50S ribosomal protein L31  40.91 
 
 
72 aa  63.9  7e-10  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2252  50S ribosomal protein L31  44.12 
 
 
72 aa  63.9  8e-10  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.200856  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4064  50S ribosomal protein L31  39.39 
 
 
65 aa  63.5  8e-10  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  4.59753e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2781  ribosomal protein L31  40.91 
 
 
71 aa  63.5  9e-10  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00270559  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4424  50S ribosomal protein L31  47.76 
 
 
70 aa  63.5  1e-09  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0477  50S ribosomal protein L31  44.12 
 
 
70 aa  63.5  1e-09  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2003  ribosomal protein L31  44.78 
 
 
100 aa  63.5  1e-09  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.14904  normal  0.58507 
 
 
-
 
NC_002936  DET1327  50S ribosomal protein L31  41.43 
 
 
68 aa  63.2  1e-09  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00511873  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0447  50S ribosomal protein L31  47.76 
 
 
70 aa  63.2  1e-09  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0498  50S ribosomal protein L31  44.12 
 
 
70 aa  63.5  1e-09  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1138  50S ribosomal protein L31  41.43 
 
 
68 aa  63.2  1e-09  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000594554  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3842  50S ribosomal protein L31  44.12 
 
 
70 aa  63.5  1e-09  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1109  ribosomal protein L31  41.43 
 
 
68 aa  63.2  1e-09  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  4.39538e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0501  50S ribosomal protein L31  44.12 
 
 
70 aa  63.5  1e-09  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1504  50S ribosomal protein L31  42.03 
 
 
67 aa  62.8  2e-09  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.063569  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2156  ribosomal protein L31  37.88 
 
 
67 aa  62.8  2e-09  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000333298  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0039  50S ribosomal protein L31  44.12 
 
 
68 aa  62  2e-09  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.196539 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1256  ribosomal protein L31  45.59 
 
 
82 aa  62.4  2e-09  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0693718  normal  0.0676561 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4120  50S ribosomal protein L31  46.27 
 
 
70 aa  62.8  2e-09  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4340  50S ribosomal protein L31  44.12 
 
 
74 aa  62  2e-09  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.062409 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2858  50S ribosomal protein L31  41.79 
 
 
70 aa  62.4  2e-09  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2469  50S ribosomal protein L31  45.59 
 
 
68 aa  62.4  2e-09  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2179  50S ribosomal protein L31  45.59 
 
 
82 aa  62.4  2e-09  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00985809  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0490  ribosomal protein L31  41.79 
 
 
94 aa  62.8  2e-09  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6576  ribosomal protein L31  39.34 
 
 
70 aa  62.8  2e-09  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.770296 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0604  50S ribosomal protein L31P  43.28 
 
 
71 aa  62.4  2e-09  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2744  50S ribosomal protein L31  44.12 
 
 
72 aa  62  3e-09  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2650  50S ribosomal protein L31  37.88 
 
 
66 aa  62  3e-09  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  1.89789e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2086  50S ribosomal protein L31  46.27 
 
 
75 aa  62  3e-09  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0689  50S ribosomal protein L31  39.39 
 
 
121 aa  61.2  4e-09  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.649908  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0818  ribosomal protein L31  41.18 
 
 
76 aa  61.6  4e-09  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  1.68077e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0640  50S ribosomal protein L31P  47.06 
 
 
86 aa  61.2  4e-09  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.045358 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03520  50S ribosomal subunit protein L31  46.27 
 
 
70 aa  61.2  5e-09  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0381  50S ribosomal protein L31  44.78 
 
 
70 aa  60.8  5e-09  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5087  50S ribosomal protein L31  44.78 
 
 
71 aa  61.2  5e-09  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3758  50S ribosomal protein L31  44.78 
 
 
70 aa  61.2  5e-09  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5137  50S ribosomal protein L31  44.78 
 
 
71 aa  60.8  5e-09  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4960  ribosomal protein L31  44.78 
 
 
100 aa  61.2  5e-09  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1908  ribosomal protein L31  44.12 
 
 
75 aa  61.2  5e-09  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.188174  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4188  ribosomal protein L31  44.93 
 
 
71 aa  60.8  6e-09  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3793  ribosomal protein L31  44.12 
 
 
71 aa  60.8  6e-09  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3776  50S ribosomal protein L31  44.78 
 
 
70 aa  60.8  6e-09  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.653741  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2381  ribosomal protein L31  42.65 
 
 
67 aa  60.8  6e-09  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00476114  normal  0.0805503 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2999  50S ribosomal protein L31  44.12 
 
 
74 aa  60.5  7e-09  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00163219  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>