More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0159 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0356  ATP-dependent metalloprotease FtsH  68.99 
 
 
610 aa  861    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0063  cell division protein FtsH  54.04 
 
 
633 aa  635    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0868  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.13 
 
 
607 aa  660    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.63 
 
 
620 aa  649    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0997  ATP-dependent zinc protease/ cell division protein  53.72 
 
 
616 aa  644    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000353226  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0159  ATP-dependent metalloprotease FtsH  100 
 
 
614 aa  1249    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.794037  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.88 
 
 
639 aa  650    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0793  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.55 
 
 
611 aa  656    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000170708  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1052  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.44 
 
 
643 aa  637    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0848  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.07 
 
 
630 aa  674    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.810549  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  68.82 
 
 
610 aa  860    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0818  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.63 
 
 
630 aa  652    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000142168  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00580  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.16 
 
 
630 aa  655    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119838  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.55 
 
 
615 aa  655    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0453  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.42 
 
 
653 aa  657    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0873  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.51 
 
 
645 aa  688    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0168176  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0206  ATP-dependent metalloprotease FtsH  77.78 
 
 
617 aa  989    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.84 
 
 
639 aa  676    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0064  cell division protein FtsH  53.87 
 
 
633 aa  634  1e-180  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.651636  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0060  cell division protein  53.87 
 
 
633 aa  634  1e-180  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0060  cell division protein  53.87 
 
 
633 aa  634  1e-180  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.527958  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0076  cell division protein FtsH  53.87 
 
 
633 aa  634  1e-180  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0454651  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0064  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.55 
 
 
635 aa  634  1e-180  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000323168  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0064  cell division protein FtsH  53.87 
 
 
633 aa  634  1e-180  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.550597  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0072  cell division protein FtsH  53.87 
 
 
633 aa  633  1e-180  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.12055  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0081  FtsH-2 peptidase. Metallo peptidase. MEROPS family M41, membrane protease FtsH catalytic subunit  53.8 
 
 
693 aa  634  1e-180  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00746794  normal  0.780653 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0073  cell division protein FtsH  53.87 
 
 
633 aa  634  1e-180  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.755624 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2185  FtsH-2 peptidase  52.31 
 
 
627 aa  629  1e-179  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0095  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.61 
 
 
599 aa  630  1e-179  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.87 
 
 
633 aa  629  1e-179  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0062  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.56 
 
 
632 aa  630  1e-179  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5244  cell division protein FtsH  53.87 
 
 
633 aa  630  1e-179  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.293032 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0200  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.23 
 
 
602 aa  627  1e-178  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0400462  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2639  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.98 
 
 
612 aa  627  1e-178  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  51.75 
 
 
608 aa  625  1e-178  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1595  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.15 
 
 
612 aa  628  1e-178  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.25 
 
 
676 aa  627  1e-178  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  50.89 
 
 
614 aa  624  1e-177  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0145  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.75 
 
 
657 aa  623  1e-177  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000285756  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2895  Mername-AA223 peptidase  51.67 
 
 
682 aa  625  1e-177  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0253  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.68 
 
 
637 aa  624  1e-177  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0503698  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.42 
 
 
621 aa  625  1e-177  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000390574  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0642  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61.62 
 
 
616 aa  619  1e-176  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1513  FtsH peptidase  51.66 
 
 
665 aa  621  1e-176  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000097295  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0064  FtsH peptidase  52.38 
 
 
637 aa  620  1e-176  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0204  Mername-AA223 peptidase  58.9 
 
 
654 aa  618  1e-176  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.176031  normal  0.159439 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0055  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.17 
 
 
671 aa  619  1e-176  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0105  FtsH-2 peptidase  52.49 
 
 
645 aa  617  1e-175  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0152057  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0551  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.03 
 
 
652 aa  618  1e-175  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3447  ATP-dependent metalloprotease FtsH  62.55 
 
 
679 aa  614  9.999999999999999e-175  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.311187  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0463  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.6 
 
 
662 aa  613  9.999999999999999e-175  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1722  peptidase M41, FtsH  51.63 
 
 
631 aa  613  9.999999999999999e-175  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.139159 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1673  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.65 
 
 
653 aa  613  9.999999999999999e-175  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.720537  normal  0.0669803 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8426  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.81 
 
 
672 aa  615  9.999999999999999e-175  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0229  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.89 
 
 
608 aa  615  9.999999999999999e-175  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1787  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.66 
 
 
656 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.124146 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2734  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.32 
 
 
617 aa  609  1e-173  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000099937  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2522  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.99 
 
 
635 aa  609  1e-173  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000162887  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9175  Microtubule-severing ATPase  58.66 
 
 
656 aa  610  1e-173  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.785348  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0426  FtsH peptidase  55.72 
 
 
652 aa  611  1e-173  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.405966  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1098  membrane protease FtsH catalytic subunit  50.16 
 
 
640 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.13074  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4314  Mername-AA223 peptidase  61.7 
 
 
753 aa  608  9.999999999999999e-173  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.492417 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0298  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61.9 
 
 
753 aa  607  9.999999999999999e-173  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.370393 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1806  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.16 
 
 
651 aa  606  9.999999999999999e-173  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.266956  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2786  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.09 
 
 
601 aa  607  9.999999999999999e-173  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2472  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.33 
 
 
601 aa  605  9.999999999999999e-173  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0438  membrane protease FtsH catalytic subunit  50.49 
 
 
673 aa  605  9.999999999999999e-173  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000747191  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4970  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.84 
 
 
685 aa  606  9.999999999999999e-173  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.259213 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1848  cell division protein FtsH  50.5 
 
 
638 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0627  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.47 
 
 
682 aa  602  1.0000000000000001e-171  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0250398  normal  0.798069 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0358  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.72 
 
 
652 aa  604  1.0000000000000001e-171  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4505  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61.67 
 
 
672 aa  604  1.0000000000000001e-171  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0150  cell division protein FtsH, putative  50.41 
 
 
700 aa  601  1e-170  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1727  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.66 
 
 
636 aa  598  1e-170  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0229617  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.84 
 
 
634 aa  600  1e-170  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0391  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.32 
 
 
608 aa  597  1e-169  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0391  peptidase M41, FtsH  50.89 
 
 
662 aa  595  1e-169  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0150338  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1495  FtsH peptidase  50.67 
 
 
635 aa  597  1e-169  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.629279  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02030  membrane protease FtsH catalytic subunit  57.29 
 
 
783 aa  598  1e-169  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000829689  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2460  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.51 
 
 
635 aa  596  1e-169  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1736  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.83 
 
 
630 aa  597  1e-169  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.195499  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2372  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.67 
 
 
635 aa  597  1e-169  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2623  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.08 
 
 
645 aa  595  1e-169  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0370  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.87 
 
 
604 aa  593  1e-168  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000686263  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1784  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.16 
 
 
660 aa  593  1e-168  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0518301 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0533  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.51 
 
 
697 aa  593  1e-168  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.37995  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1133  membrane protease FtsH catalytic subunit  51.17 
 
 
630 aa  593  1e-168  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0177636  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2569  peptidase M41, FtsH  49.67 
 
 
641 aa  593  1e-168  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000845189  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1268  membrane protease FtsH catalytic subunit  48.51 
 
 
640 aa  593  1e-168  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399956  normal  0.37717 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1207  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.36 
 
 
643 aa  594  1e-168  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.390556  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0546  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.51 
 
 
697 aa  593  1e-168  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2817  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.36 
 
 
634 aa  589  1e-167  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2170  peptidase M41, FtsH  49.59 
 
 
627 aa  590  1e-167  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.415072  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0772  membrane protease FtsH catalytic subunit  50 
 
 
635 aa  591  1e-167  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000087079  normal  0.0618887 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2029  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.17 
 
 
628 aa  589  1e-167  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0483  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.5 
 
 
631 aa  591  1e-167  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.0000161272  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0714  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.34 
 
 
634 aa  588  1e-167  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.87442  normal  0.0617842 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2188  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.75 
 
 
649 aa  590  1e-167  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.350229  normal  0.438236 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02180  membrane protease FtsH catalytic subunit  52.17 
 
 
759 aa  591  1e-167  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.203861  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0444  Mername-AA223 peptidase  49.83 
 
 
681 aa  591  1e-167  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>