285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0129 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0129  histidine ammonia-lyase  100 
 
 
489 aa  998    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1777  histidine ammonia-lyase  65.58 
 
 
505 aa  673    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.229891  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0719  histidine ammonia-lyase  51.84 
 
 
498 aa  471  1.0000000000000001e-131  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.281657  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3903  histidine ammonia-lyase  45.53 
 
 
520 aa  444  1e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.23664  normal  0.18215 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2170  histidine ammonia-lyase  49.78 
 
 
508 aa  444  1e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0239  histidine ammonia-lyase  49.22 
 
 
516 aa  444  1e-123  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0486483  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3680  histidine ammonia-lyase  44.9 
 
 
505 aa  426  1e-118  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0108236  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1637  histidine ammonia-lyase  48.58 
 
 
506 aa  427  1e-118  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.798951 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0281  histidine ammonia-lyase  45.27 
 
 
508 aa  428  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1556  histidine ammonia-lyase  44.69 
 
 
505 aa  423  1e-117  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000269736  normal  0.0117376 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3442  histidine ammonia-lyase  44.69 
 
 
505 aa  424  1e-117  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0533045  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3405  histidine ammonia-lyase  44.88 
 
 
505 aa  424  1e-117  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000956551  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3354  histidine ammonia-lyase  44.49 
 
 
505 aa  422  1e-117  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3760  histidine ammonia-lyase  44.69 
 
 
506 aa  424  1e-117  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00715091  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3712  histidine ammonia-lyase  44.69 
 
 
505 aa  424  1e-117  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000019442  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2312  histidine ammonia-lyase  44.08 
 
 
505 aa  422  1e-117  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.01107  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1410  histidine ammonia-lyase  46.76 
 
 
516 aa  425  1e-117  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0341381 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2820  histidine ammonia-lyase  44.83 
 
 
507 aa  424  1e-117  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1022  histidine ammonia-lyase  44.02 
 
 
509 aa  425  1e-117  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3685  histidine ammonia-lyase  44.67 
 
 
505 aa  423  1e-117  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000336671  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3662  histidine ammonia-lyase  44.69 
 
 
505 aa  425  1e-117  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0588  histidine ammonia-lyase  46.56 
 
 
507 aa  420  1e-116  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2378  histidine ammonia-lyase  47.77 
 
 
509 aa  419  1e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.43897  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3339  histidine ammonia-lyase  44.29 
 
 
505 aa  419  1e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000343122  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2730  histidine ammonia-lyase  46.6 
 
 
499 aa  416  9.999999999999999e-116  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2331  histidine ammonia-lyase  48.82 
 
 
506 aa  416  9.999999999999999e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.962359 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0822  histidine ammonia-lyase  45.79 
 
 
511 aa  416  9.999999999999999e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107913  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0916  histidine ammonia-lyase  45.73 
 
 
511 aa  414  1e-114  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03126  histidine ammonia-lyase  43.76 
 
 
538 aa  409  1e-113  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.840651  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4837  histidine ammonia-lyase  44.99 
 
 
510 aa  409  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4446  histidine ammonia-lyase  43.75 
 
 
510 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3756  histidine ammonia-lyase  44.15 
 
 
510 aa  402  1e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0185291 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3952  histidine ammonia-lyase  44.58 
 
 
512 aa  403  1e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1265  histidine ammonia-lyase  44.95 
 
 
504 aa  403  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003723  histidine ammonia-lyase  43.65 
 
 
511 aa  401  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00913143  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1814  histidine ammonia-lyase  46.4 
 
 
508 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4168  histidine ammonia-lyase  43.26 
 
 
510 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02072  histidine ammonia-lyase  43.78 
 
 
514 aa  400  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0080  histidine ammonia-lyase  43.84 
 
 
513 aa  398  1e-109  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2046  histidine ammonia-lyase  46.22 
 
 
508 aa  398  1e-109  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.034077  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0098  histidine ammonia-lyase  43.64 
 
 
513 aa  398  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4251  histidine ammonia-lyase  43.43 
 
 
513 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0103  histidine ammonia-lyase  43.64 
 
 
513 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1335  histidine ammonia-lyase  44.73 
 
 
506 aa  397  1e-109  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1331  histidine ammonia-lyase  43.7 
 
 
506 aa  398  1e-109  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0103  histidine ammonia-lyase  43.43 
 
 
513 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0576  histidine ammonia-lyase  43.4 
 
 
509 aa  396  1e-109  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000203792  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0098  histidine ammonia-lyase  43.64 
 
 
513 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0100  histidine ammonia-lyase  43.23 
 
 
513 aa  396  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0095  histidine ammonia-lyase  43.23 
 
 
513 aa  396  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2116  histidine ammonia-lyase  46.22 
 
 
508 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00707629  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0101  histidine ammonia-lyase  43.23 
 
 
513 aa  396  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2880  histidine ammonia-lyase  43.09 
 
 
518 aa  395  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0084  histidine ammonia-lyase  43.56 
 
 
510 aa  395  1e-108  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0708  histidine ammonia-lyase  43.76 
 
 
510 aa  394  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.085386  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3901  histidine ammonia-lyase  41.73 
 
 
511 aa  393  1e-108  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.912183  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2474  histidine ammonia-lyase  44.28 
 
 
518 aa  389  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2576  histidine ammonia-lyase  43.58 
 
 
523 aa  392  1e-107  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0804  histidine ammonia-lyase  42.5 
 
 
511 aa  389  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.422259  normal  0.987509 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1029  histidine ammonia-lyase  42.91 
 
 
510 aa  389  1e-107  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0827766  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2100  histidine ammonia-lyase  42.21 
 
 
514 aa  389  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0193312  normal  0.149962 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3094  histidine ammonia-lyase  44.88 
 
 
513 aa  388  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2646  histidine ammonia-lyase  42.71 
 
 
518 aa  383  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0281382  normal  0.523313 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5275  histidine ammonia-lyase  40.45 
 
 
515 aa  382  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0850  histidine ammonia-lyase  42.25 
 
 
519 aa  382  1e-105  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.03365 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1458  histidine ammonia-lyase  40.65 
 
 
515 aa  385  1e-105  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0209656  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2642  histidine ammonia-lyase  42.83 
 
 
518 aa  385  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.459699  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2716  histidine ammonia-lyase  42.51 
 
 
526 aa  380  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0918  histidine ammonia-lyase  41.84 
 
 
506 aa  381  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.19052  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1043  histidine ammonia-lyase  42.61 
 
 
514 aa  380  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.693412  normal  0.100833 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0886  histidine ammonia-lyase  41.84 
 
 
506 aa  381  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0941  histidine ammonia-lyase  41.72 
 
 
506 aa  381  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.895576 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0855  histidine ammonia-lyase  41.84 
 
 
506 aa  381  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.628758  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0254  histidine ammonia-lyase  41.57 
 
 
517 aa  375  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0908  histidine ammonia-lyase  42.11 
 
 
514 aa  375  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6451  histidine ammonia-lyase  45.13 
 
 
515 aa  376  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4833  histidine ammonia-lyase  40.24 
 
 
515 aa  378  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.63081 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0366  histidine ammonia-lyase  40.24 
 
 
510 aa  378  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.814528 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5482  histidine ammonia-lyase  40.24 
 
 
507 aa  377  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.211889  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3837  histidine ammonia-lyase  40.46 
 
 
536 aa  375  1e-103  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.783362  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1301  histidine ammonia-lyase  41.98 
 
 
514 aa  376  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3619  histidine ammonia-lyase  43.15 
 
 
514 aa  378  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30965  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0058  histidine ammonia-lyase  40.65 
 
 
511 aa  377  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3001  histidine ammonia-lyase  42.11 
 
 
534 aa  378  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.463238  normal  0.112166 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2855  histidine ammonia-lyase  41.9 
 
 
522 aa  377  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.288537  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1297  histidine ammonia-lyase  42.91 
 
 
511 aa  375  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11158  histidine ammonia-lyase  45.45 
 
 
503 aa  377  1e-103  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.926565  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0827  histidine ammonia-lyase  41.63 
 
 
506 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.294508  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1335  histidine ammonia-lyase  45.21 
 
 
528 aa  374  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.863562  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2550  histidine ammonia-lyase  42.68 
 
 
513 aa  374  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1594  histidine ammonia-lyase  46.07 
 
 
508 aa  372  1e-102  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4040  histidine ammonia-lyase  44.81 
 
 
524 aa  375  1e-102  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4629  histidine ammonia-lyase  43.49 
 
 
528 aa  369  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2006  histidine ammonia-lyase  40.81 
 
 
522 aa  370  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.34717  normal  0.214546 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5831  histidine ammonia-lyase  43.7 
 
 
524 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1264  histidine ammonia-lyase  41.61 
 
 
506 aa  369  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0158  histidine ammonia-lyase  44.32 
 
 
517 aa  369  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5082  histidine ammonia-lyase  42.98 
 
 
510 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150624  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1038  histidine ammonia-lyase  46.47 
 
 
515 aa  369  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.116739  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2796  histidine ammonia-lyase  41.57 
 
 
529 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>