More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0108 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0108  butyrate kinase  100 
 
 
361 aa  737    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.835306  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0590  butyrate kinase  78.67 
 
 
361 aa  593  1e-168  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0107  butyrate kinase  71.15 
 
 
363 aa  536  1e-151  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.215976  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1069  butyrate kinase  63.2 
 
 
375 aa  485  1e-136  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1472  butyrate kinase  60.62 
 
 
355 aa  441  1e-123  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0939  butyrate kinase  60.8 
 
 
355 aa  434  1e-120  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2307  butyrate kinase  58.19 
 
 
370 aa  428  1e-119  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2858  butyrate kinase  56.37 
 
 
367 aa  419  1e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4236  butyrate kinase  55.24 
 
 
367 aa  410  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4069  butyrate kinase  55.24 
 
 
367 aa  410  1e-113  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3907  butyrate kinase  55.24 
 
 
367 aa  410  1e-113  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3916  butyrate kinase  55.24 
 
 
367 aa  410  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0615579  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0960  butyrate kinase  55.52 
 
 
367 aa  410  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0659702 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4294  butyrate kinase  55.24 
 
 
367 aa  410  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4184  butyrate kinase  55.24 
 
 
367 aa  410  1e-113  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000389222 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4386  butyrate kinase  55.24 
 
 
367 aa  410  1e-113  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4005  butyrate kinase  55.24 
 
 
367 aa  410  1e-113  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.140021  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0263  butyrate kinase  57.63 
 
 
370 aa  409  1e-113  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4274  butyrate kinase  54.96 
 
 
367 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1680  butyrate kinase  56.66 
 
 
358 aa  400  9.999999999999999e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00170652  normal  0.0185756 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2656  butyrate kinase  54.67 
 
 
356 aa  388  1e-106  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2342  butyrate kinase  54.39 
 
 
356 aa  386  1e-106  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2700  butyrate kinase  54.52 
 
 
352 aa  366  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06760  butyrate kinase  52.27 
 
 
356 aa  364  1e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2852  butyrate kinase  52.41 
 
 
361 aa  363  2e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2358  butyrate kinase  51.05 
 
 
362 aa  362  6e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0714814  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0936  butyrate kinase  51.13 
 
 
353 aa  361  1e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2128  butyrate kinase  48.18 
 
 
362 aa  359  5e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1109  butyrate kinase  49.44 
 
 
361 aa  357  9.999999999999999e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2348  butyrate kinase  50.85 
 
 
352 aa  358  9.999999999999999e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.311163  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2844  butyrate kinase  47.88 
 
 
358 aa  352  7e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3152  butyrate kinase  48.59 
 
 
357 aa  349  5e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21870  butyrate kinase  48.04 
 
 
359 aa  346  4e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0109  butyrate kinase  49.44 
 
 
356 aa  341  1e-92  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3544  butyrate kinase  46.89 
 
 
362 aa  331  1e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.505108  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1366  butyrate kinase  48.26 
 
 
370 aa  325  5e-88  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1041  butyrate kinase  47.03 
 
 
357 aa  320  3e-86  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.496289  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0106  butyrate kinase  45.56 
 
 
357 aa  317  2e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2106  butyrate kinase  47.73 
 
 
359 aa  317  3e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1071  butyrate kinase  46.18 
 
 
357 aa  317  3e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01633  butyrate kinase  45.61 
 
 
360 aa  315  8e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1470  butyrate kinase  45.3 
 
 
362 aa  308  1.0000000000000001e-82  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3128  butyrate kinase  44.66 
 
 
372 aa  301  2e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0591  butyrate kinase  43.14 
 
 
362 aa  286  4e-76  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2626  butyrate kinase  38.97 
 
 
453 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2330  butyrate kinase  43.73 
 
 
372 aa  279  4e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108416 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0045  butyrate kinase  42.42 
 
 
366 aa  271  1e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.90675 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0042  butyrate kinase  42.05 
 
 
368 aa  259  6e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.36526  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0058  butyrate kinase  41.48 
 
 
376 aa  258  8e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.870551  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0454  butyrate kinase  39.83 
 
 
359 aa  258  1e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0046  butyrate kinase  41.48 
 
 
376 aa  239  5.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.248068  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1383  butyrate kinase  30.62 
 
 
356 aa  131  2.0000000000000002e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.0000142085  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0258  Butyrate kinase  29.93 
 
 
333 aa  95.5  1e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7970  acetate kinase  25.63 
 
 
378 aa  85.1  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1044  acetate kinase  31.55 
 
 
404 aa  83.2  0.000000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2303  acetate kinase  26.91 
 
 
398 aa  80.9  0.00000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6196  acetate kinase  32.28 
 
 
380 aa  80.1  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1936  acetate kinase  27.56 
 
 
404 aa  80.1  0.00000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1049  acetate kinase  32.34 
 
 
401 aa  79.7  0.00000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1028  acetate kinase  26.5 
 
 
399 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000413101  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3176  acetate kinase  29.05 
 
 
412 aa  77.8  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2656  acetate kinase  30.41 
 
 
422 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0642  acetate kinase  26.52 
 
 
399 aa  77  0.0000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.376841  normal  0.374072 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1170  acetate kinase  30.47 
 
 
397 aa  75.5  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.185662 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1495  acetate kinase  31.46 
 
 
399 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2476  acetate kinase  30.34 
 
 
400 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0641  acetate kinase  31.18 
 
 
405 aa  74.7  0.000000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00773095  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1473  acetate kinase  26.84 
 
 
411 aa  74.7  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.206902 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3504  acetate kinase  25.46 
 
 
405 aa  73.9  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1034  acetate kinase  31.18 
 
 
402 aa  73.6  0.000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00869824  normal  0.811028 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1493  acetate kinase  32.09 
 
 
399 aa  73.2  0.000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0874579  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0343  acetate kinase  29.82 
 
 
402 aa  73.2  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.441374  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0712  acetate kinase  25.42 
 
 
396 aa  73.2  0.000000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1669  acetate kinase  30.72 
 
 
398 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0184295  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0788  acetate kinase  25.14 
 
 
396 aa  72.4  0.00000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.119296  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3539  acetate kinase  32.08 
 
 
398 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2393  acetate kinase  30.34 
 
 
398 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.451887  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3088  acetate kinase  30.17 
 
 
425 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.273293  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2886  acetate kinase  30.12 
 
 
398 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00530496  decreased coverage  0.000000557586 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1318  acetate kinase  25.42 
 
 
396 aa  72  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1158  acetate kinase  24.85 
 
 
398 aa  71.6  0.00000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00331056  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2409  acetate kinase  29.21 
 
 
413 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2708  acetate kinase  28.05 
 
 
397 aa  71.6  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0186296  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0640  acetate kinase  25.07 
 
 
394 aa  71.6  0.00000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1948  acetate kinase  26.37 
 
 
589 aa  71.2  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3242  acetate kinase  27.57 
 
 
402 aa  70.9  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.697897  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4397  acetate kinase  29.11 
 
 
398 aa  70.5  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3316  acetate kinase  30.05 
 
 
400 aa  70.5  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00011444  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2953  acetate kinase  31.01 
 
 
402 aa  70.1  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.845819  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7535  acetate kinase  25.45 
 
 
381 aa  70.1  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.315075  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28510  acetate kinase  28.99 
 
 
409 aa  69.7  0.00000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.170304 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1865  acetate kinase  26.99 
 
 
404 aa  68.9  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1705  acetate kinase  28.92 
 
 
399 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0458561  hitchhiker  0.00694718 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0731  acetate kinase  28.96 
 
 
396 aa  68.9  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2921  acetate kinase  26.99 
 
 
772 aa  69.3  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.602994 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1491  acetate kinase  29.21 
 
 
399 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000140767  normal  0.637827 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1558  acetate kinase  29.21 
 
 
399 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.115014  normal  0.14682 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1552  acetate kinase  29.21 
 
 
399 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.357591  normal  0.201508 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3528  acetate kinase  25.69 
 
 
394 aa  68.9  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.18649  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1162  acetate kinase  23.24 
 
 
399 aa  68.2  0.0000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>