More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0106 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0106  butyrate kinase  100 
 
 
357 aa  725  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0591  butyrate kinase  70.34 
 
 
362 aa  532  1e-150  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0109  butyrate kinase  64.62 
 
 
356 aa  473  1e-132  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1041  butyrate kinase  58.24 
 
 
357 aa  419  1e-116  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.496289  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1071  butyrate kinase  57.67 
 
 
357 aa  416  1e-115  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1470  butyrate kinase  54.06 
 
 
362 aa  400  1e-110  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0939  butyrate kinase  52.97 
 
 
355 aa  378  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2307  butyrate kinase  48.17 
 
 
370 aa  361  1e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2348  butyrate kinase  48.87 
 
 
352 aa  345  1e-93  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.311163  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0263  butyrate kinase  48.32 
 
 
370 aa  333  4e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2852  butyrate kinase  47.58 
 
 
361 aa  333  4e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0960  butyrate kinase  45.2 
 
 
367 aa  332  6e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0659702 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0107  butyrate kinase  47.91 
 
 
363 aa  331  1e-89  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.215976  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4005  butyrate kinase  44.63 
 
 
367 aa  331  2e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.140021  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2858  butyrate kinase  45.2 
 
 
367 aa  331  2e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1680  butyrate kinase  46.89 
 
 
358 aa  329  5e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00170652  normal  0.0185756 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0936  butyrate kinase  48.31 
 
 
353 aa  328  8e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4274  butyrate kinase  44.92 
 
 
367 aa  328  9e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4294  butyrate kinase  44.63 
 
 
367 aa  327  1e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3916  butyrate kinase  44.63 
 
 
367 aa  327  2e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0615579  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4069  butyrate kinase  44.63 
 
 
367 aa  327  2e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3907  butyrate kinase  44.63 
 
 
367 aa  327  2e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4386  butyrate kinase  44.63 
 
 
367 aa  327  2e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4236  butyrate kinase  44.63 
 
 
367 aa  327  2e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4184  butyrate kinase  44.63 
 
 
367 aa  327  2e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.89222e-06 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3544  butyrate kinase  44.66 
 
 
362 aa  326  3e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.505108  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2128  butyrate kinase  46.09 
 
 
362 aa  325  5e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1069  butyrate kinase  45.4 
 
 
375 aa  323  2e-87  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2700  butyrate kinase  48.31 
 
 
352 aa  323  3e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2656  butyrate kinase  45.2 
 
 
356 aa  322  9e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2342  butyrate kinase  44.92 
 
 
356 aa  320  3e-86  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21870  butyrate kinase  46.15 
 
 
359 aa  318  9e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0108  butyrate kinase  45.56 
 
 
361 aa  317  2e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.835306  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06760  butyrate kinase  45.61 
 
 
356 aa  311  1e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1109  butyrate kinase  42.62 
 
 
361 aa  310  2e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0590  butyrate kinase  44.82 
 
 
361 aa  309  6e-83  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2844  butyrate kinase  44.63 
 
 
358 aa  306  3e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1472  butyrate kinase  45.07 
 
 
355 aa  298  9e-80  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3152  butyrate kinase  41.69 
 
 
357 aa  295  8e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2358  butyrate kinase  43.58 
 
 
362 aa  292  5e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0714814  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2106  butyrate kinase  45.04 
 
 
359 aa  288  1e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01633  butyrate kinase  42.61 
 
 
360 aa  278  8e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0045  butyrate kinase  41.57 
 
 
366 aa  271  1e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.90675 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0042  butyrate kinase  40.91 
 
 
368 aa  269  5e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.36526  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0058  butyrate kinase  41.43 
 
 
376 aa  267  2e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.870551  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0046  butyrate kinase  41.14 
 
 
376 aa  251  1e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.248068  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1366  butyrate kinase  37.9 
 
 
370 aa  249  5e-65  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3128  butyrate kinase  36.44 
 
 
372 aa  239  4e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2626  butyrate kinase  32.67 
 
 
453 aa  226  4e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0454  butyrate kinase  36.13 
 
 
359 aa  222  7e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2330  butyrate kinase  38.44 
 
 
372 aa  215  1e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108416 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1383  butyrate kinase  32.49 
 
 
356 aa  186  5e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  1.42085e-05  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0258  Butyrate kinase  31.79 
 
 
333 aa  111  2e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1936  acetate kinase  27.08 
 
 
404 aa  85.9  1e-15  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0104  acetate kinase  26.43 
 
 
397 aa  84.7  2e-15  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.66342  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1158  acetate kinase  25.98 
 
 
398 aa  82.4  1e-14  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00331056  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0647  acetate kinase  27.25 
 
 
401 aa  82.4  1e-14  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6196  acetate kinase  31.87 
 
 
380 aa  77.8  3e-13  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1473  acetate kinase  29.26 
 
 
411 aa  77.4  3e-13  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.206902 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0642  acetate kinase  22.51 
 
 
399 aa  76.6  7e-13  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.376841  normal  0.374072 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11270  acetate kinase  26.44 
 
 
395 aa  75.9  9e-13  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0595808  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2303  acetate kinase  26.65 
 
 
398 aa  75.5  1e-12  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1568  acetate kinase  33.56 
 
 
400 aa  74.7  2e-12  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.489684  normal  0.769699 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0343  acetate kinase  29.7 
 
 
402 aa  73.6  5e-12  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.441374  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3242  acetate kinase  30.91 
 
 
402 aa  73.6  5e-12  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.697897  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4397  acetate kinase  27.27 
 
 
398 aa  73.2  6e-12  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0208  acetate kinase  25.96 
 
 
398 aa  72.8  8e-12  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.777111  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1295  acetate kinase  34.35 
 
 
402 aa  72  2e-11  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0206  acetate kinase  25.66 
 
 
398 aa  71.6  2e-11  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1221  acetate kinase  25.37 
 
 
394 aa  72  2e-11  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.805277  normal  0.0186268 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1865  acetate kinase  30.3 
 
 
404 aa  71.2  2e-11  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10414  acetate kinase  24.31 
 
 
385 aa  71.2  3e-11  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0655  acetate kinase  26.04 
 
 
397 aa  70.9  3e-11  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  4.14678e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0640  acetate kinase  25.29 
 
 
394 aa  70.5  4e-11  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1044  acetate kinase  25.59 
 
 
404 aa  70.9  4e-11  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1049  acetate kinase  27.12 
 
 
401 aa  70.9  4e-11  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1034  acetate kinase  25.36 
 
 
402 aa  70.1  5e-11  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00869824  normal  0.811028 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0641  acetate kinase  25.87 
 
 
405 aa  70.1  6e-11  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00773095  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1495  acetate kinase  28.87 
 
 
399 aa  69.7  7e-11  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2656  acetate kinase  31.01 
 
 
422 aa  68.9  1e-10  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6116  acetate kinase  25.95 
 
 
583 aa  68.9  1e-10  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1318  acetate kinase  25.66 
 
 
396 aa  68.9  1e-10  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1948  acetate kinase  26.18 
 
 
589 aa  69.3  1e-10  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0053  acetate kinase  33.59 
 
 
402 aa  69.3  1e-10  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0788  acetate kinase  25.22 
 
 
396 aa  68.2  2e-10  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.119296  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4428  propionate/acetate kinase  24.7 
 
 
402 aa  68.2  2e-10  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0208256 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1491  acetate kinase  27.52 
 
 
399 aa  68.6  2e-10  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000140767  normal  0.637827 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1558  acetate kinase  27.52 
 
 
399 aa  68.6  2e-10  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.115014  normal  0.14682 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1552  acetate kinase  27.52 
 
 
399 aa  68.6  2e-10  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.357591  normal  0.201508 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0712  acetate kinase  25.36 
 
 
396 aa  68.6  2e-10  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7970  acetate kinase  23.77 
 
 
378 aa  67.8  3e-10  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0701  acetate kinase  24.69 
 
 
389 aa  67.4  3e-10  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.019228 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0650  acetate kinase  27.38 
 
 
403 aa  67.4  4e-10  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.276735  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1731  acetate kinase  26.39 
 
 
401 aa  67  4e-10  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  4.22881e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5046  acetate kinase  29.17 
 
 
398 aa  67.4  4e-10  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0920  acetate kinase  25.32 
 
 
414 aa  67.4  4e-10  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0938  acetate kinase  24.19 
 
 
405 aa  67.4  4e-10  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  9.04206e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3539  acetate kinase  27.45 
 
 
398 aa  66.6  5e-10  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3242  propionate/acetate kinase  24.7 
 
 
402 aa  66.6  6e-10  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0674  acetate kinase  27.08 
 
 
403 aa  66.2  7e-10  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>