More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0105 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0105  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 411 aa  832    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0592  putative transcriptional regulator, GntR family  72.51 
 
 		 411 aa  657    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0110  GntR family transcriptional regulator  71.29 
 
 		 411 aa  621  1e-177  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1680  GntR family transcriptional regulator  65.21 
 
 		 411 aa  581  1e-164  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.733042  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1614  GntR family transcriptional regulator  63.99 
 
 		 411 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1469  GntR family transcriptional regulator  61.14 
 
 		 413 aa  514  1.0000000000000001e-145  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1434  putative transcriptional regulator, GntR family  42.5 
 
 		 400 aa  331  1e-89  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1659  2-aminoadipate aminotransferase  41.83 
 
 		 399 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0665896 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0851  GntR family transcriptional regulator  41.69 
 
 		 395 aa  312  7.999999999999999e-84  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0242467  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1532  GntR family transcriptional regulator  41.21 
 
 		 399 aa  309  5e-83  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.192742  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1080  putative transcriptional regulator, GntR family  41.6 
 
 		 401 aa  309  8e-83  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1028  GntR family transcriptional regulator  40.95 
 
 		 399 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000302984 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1466  GntR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 386 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.677019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1095  GntR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 395 aa  302  6.000000000000001e-81  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.435284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2328  aminotransferase, class I and II  41.21 
 
 		 433 aa  302  9e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1108  GntR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 395 aa  300  3e-80  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5940  putative transcriptional regulator, GntR family  39.5 
 
 		 463 aa  300  4e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2120  GntR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 401 aa  299  6e-80  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.265686 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0421  GntR family transcriptional regulator  41.21 
 
 		 403 aa  298  9e-80  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.493071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1964  GntR family transcriptional regulator  40.49 
 
 		 409 aa  298  1e-79  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39710  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  38.3 
 
 		 446 aa  296  5e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1580  GntR family transcriptional regulator  39.9 
 
 		 395 aa  293  5e-78  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136638  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4214  putative transcriptional regulator, GntR family  38.21 
 
 		 438 aa  289  6e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4022  aminotransferase, class I and II  36.71 
 
 		 433 aa  287  2e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9047  putative transcriptional regulator, GntR family  36.99 
 
 		 437 aa  285  1.0000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.779817  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3370  putative transcriptional regulator, GntR family  38.07 
 
 		 611 aa  283  5.000000000000001e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0532019  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6710  GntR family transcriptional regulator  36.87 
 
 		 416 aa  283  6.000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.614277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37960  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  36.87 
 
 		 436 aa  282  6.000000000000001e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3812  putative transcriptional regulator, GntR family  36.5 
 
 		 435 aa  281  1e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0318  putative transcriptional regulator, GntR family  38.52 
 
 		 432 aa  280  4e-74  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.024163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2549  putative transcriptional regulator, GntR family  36.11 
 
 		 436 aa  279  7e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.49034  normal  0.185545 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0115  putative transcriptional regulator, GntR family  39.13 
 
 		 396 aa  278  1e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2237  putative transcriptional regulator, GntR family  37.79 
 
 		 440 aa  276  5e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0384062  normal  0.194146 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2567  putative transcriptional regulator, GntR family  36.88 
 
 		 397 aa  275  8e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1641  valine-pyruvate aminotransferase  37.56 
 
 		 440 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.320192  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0315  putative transcriptional regulator, GntR family  38.68 
 
 		 403 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.665801  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5087  putative transcriptional regulator, GntR family  36.67 
 
 		 454 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7090  putative transcriptional regulator, GntR family  34.78 
 
 		 438 aa  273  5.000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.635615  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5405  putative transcriptional regulator, GntR family  37.08 
 
 		 446 aa  272  9e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1154  aminotransferase, class I/II  38.04 
 
 		 393 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5690  aminotransferase, class I and II  37.44 
 
 		 393 aa  268  1e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0865  putative transcriptional regulator, GntR family  38.44 
 
 		 404 aa  268  1e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000909191  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1681  putative transcriptional regulator, GntR family  36.78 
 
 		 401 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0708  transcriptional regulator  37.05 
 
 		 400 aa  265  8.999999999999999e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.471024  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0928  GntR family transcriptional regulator  36.93 
 
 		 393 aa  265  1e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511381  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0951  aminotransferase family protein  37.53 
 
 		 393 aa  265  1e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2387  aminotransferase, class I and II  36.68 
 
 		 393 aa  265  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462658  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2269  GntR family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 393 aa  265  1e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3055  putative transcriptional regulator, GntR family  37.53 
 
 		 394 aa  265  1e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0985  aminotransferase protein  38.13 
 
 		 406 aa  264  2e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0572002  normal  0.184063 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2350  aminotransferase, class I and II  38.27 
 
 		 394 aa  264  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3332  putative aminotransferase  36.18 
 
 		 398 aa  264  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.381382 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1584  GntR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 393 aa  264  2e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2513  aminotransferase  38.44 
 
 		 404 aa  264  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1739  aminotransferase, class I and II  36.93 
 
 		 393 aa  263  4e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0871  putative GntR family transcriptional regulator  36.83 
 
 		 405 aa  263  4e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.707228 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2351  aminotransferase, class I and II  36.93 
 
 		 393 aa  263  4e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.654815  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2372  GntR family transcriptional regulator  36.93 
 
 		 393 aa  263  4e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9379  putative transcriptional regulator, GntR family  35.95 
 
 		 441 aa  263  4e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.938507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03480  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  38.35 
 
 		 416 aa  263  6e-69  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.147628 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2152  aminotransferase, class I and II  36.13 
 
 		 416 aa  261  1e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4690  aminotransferase, class I and II  35.97 
 
 		 439 aa  262  1e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4583  aminotransferase, class I and II  35.37 
 
 		 437 aa  261  2e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000597747 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1163  aminotransferase, class I/II  38.04 
 
 		 393 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.488636  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00093  valine-pyruvate aminotransferase  36.39 
 
 		 417 aa  259  5.0000000000000005e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.947467  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2117  GntR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 398 aa  259  6e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483945  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1952  aminotransferase family protein  38.04 
 
 		 393 aa  259  6e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1314  aminotransferase family protein  38.04 
 
 		 393 aa  259  6e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.693851  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0285  aminotransferase family protein  38.04 
 
 		 393 aa  259  6e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1001  aminotransferase family protein  38.04 
 
 		 393 aa  259  6e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0863  aminotransferase family protein  38.04 
 
 		 393 aa  259  6e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1213  putative transcriptional regulator, GntR family  35.93 
 
 		 398 aa  259  7e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5101  GntR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 437 aa  259  9e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000307944 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4975  putative transcriptional regulator, GntR family  36.18 
 
 		 430 aa  258  1e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2514  aminotransferase, class I and II  38.7 
 
 		 397 aa  258  1e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.483717  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0902  GntR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 399 aa  258  2e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.215501  normal  0.458926 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3581  putative GntR family transcriptional regulator  35.31 
 
 		 441 aa  258  2e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0915  putative transcriptional regulator, GntR family  37.37 
 
 		 396 aa  257  3e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0846  putative transcriptional regulator, GntR family  37.37 
 
 		 396 aa  256  4e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0129506  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6427  putative transcriptional regulator, GntR family  35.01 
 
 		 414 aa  256  5e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.93178 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4020  GntR family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 399 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.761483  normal  0.199262 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6594  putative transcriptional regulator, GntR family  37.66 
 
 		 398 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.394989  normal  0.110882 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  34.97 
 
 		 397 aa  254  3e-66  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2084  aminotransferase, class I and II  37.9 
 
 		 406 aa  254  3e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0411  aminotransferase  42.06 
 
 		 405 aa  253  3e-66  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.894171  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 397 aa  253  4.0000000000000004e-66  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3003  putative transcriptional regulator, GntR family  36.75 
 
 		 394 aa  253  5.000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3498  aminotransferase, class I and II  40.5 
 
 		 399 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  35.87 
 
 		 402 aa  250  3e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0081  putative transcriptional regulator, GntR family  35.63 
 
 		 402 aa  249  8e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2576  putative aminotransferase  37.82 
 
 		 398 aa  248  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.124725 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3440  GntR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 399 aa  247  3e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 383 aa  246  4.9999999999999997e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2654  aminotransferase, class I and II  39.5 
 
 		 424 aa  245  8e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.422177  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1378  aminotransferase, class I  34.53 
 
 		 410 aa  245  9.999999999999999e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5262  aminotransferase, class I and II  39.25 
 
 		 399 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.276106  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1336  aminotransferase, class I  34.53 
 
 		 410 aa  244  1.9999999999999999e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.102288  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4240  aminotransferase, class I and II  36.13 
 
 		 406 aa  243  3.9999999999999997e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2616  putative transcriptional regulator, GntR family  33.08 
 
 		 395 aa  243  5e-63  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.791152  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3125  GntR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 393 aa  243  6e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>