More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0088 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0088  ROK family protein  100 
 
 
313 aa  623  1e-177  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1141  ROK family protein  69.68 
 
 
308 aa  411  1e-114  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1363  ROK family protein  61.34 
 
 
314 aa  367  1e-100  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0520337  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1323  ROK family protein  61.34 
 
 
314 aa  367  1e-100  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000170604  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1217  ROK family protein  49.68 
 
 
316 aa  315  5e-85  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0018  ROK family protein  40.38 
 
 
321 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0049  ROK family glucokinase  41.99 
 
 
315 aa  217  2e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00642511  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  38.73 
 
 
322 aa  216  4e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3865  glucokinase  41.28 
 
 
347 aa  215  9e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  40 
 
 
315 aa  212  5.999999999999999e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  40 
 
 
315 aa  212  5.999999999999999e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  38.01 
 
 
315 aa  206  5e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0799  glucokinase, ROK family  37.14 
 
 
317 aa  205  7e-52  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5489  ROK family protein  38.33 
 
 
321 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.269543 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5226  ROK family protein  36.39 
 
 
321 aa  196  6e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  36.28 
 
 
320 aa  195  8.000000000000001e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2378  glucokinase, ROK family  38.76 
 
 
318 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0195  glucokinase, ROK family  40.07 
 
 
317 aa  190  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  37.86 
 
 
312 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2309  glucokinase  34.92 
 
 
323 aa  189  5e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00114411  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0552  glucokinase, ROK family  41.96 
 
 
316 aa  189  5.999999999999999e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3188  ROK family protein  34.38 
 
 
318 aa  187  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00496766  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2512  ROK family protein  39.03 
 
 
340 aa  185  7e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.615457  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0037  ROK family protein  35.13 
 
 
317 aa  184  1.0000000000000001e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2075  ROK family protein  36.11 
 
 
328 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214155  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4343  glucokinase  36.84 
 
 
327 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4165  glucokinase  36.84 
 
 
327 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4004  glucokinase  36.84 
 
 
327 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4014  glucokinase  36.84 
 
 
327 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0552724  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4487  glucokinase  36.84 
 
 
327 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.693624  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4396  glucokinase  36.84 
 
 
327 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4283  glucokinase  36.84 
 
 
327 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2991  ROK family glucokinase  36.51 
 
 
327 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.922063  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2754  ROK family protein  39.35 
 
 
332 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2265  ROK  35.1 
 
 
311 aa  183  3e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4339  glucokinase  33.86 
 
 
316 aa  183  3e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1690  ROK family protein  35.09 
 
 
332 aa  182  6e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4116  ROK family glucokinase  37.77 
 
 
327 aa  182  7e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0857  glucokinase  36.22 
 
 
327 aa  181  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1908  glucokinase, putative  31.83 
 
 
313 aa  181  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4377  glucokinase  36.22 
 
 
327 aa  181  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1061  ROK family glucokinase  39.81 
 
 
312 aa  180  2e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204957  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3072  glucokinase, ROK family  38.78 
 
 
314 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1821  ROK family protein  37.19 
 
 
318 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0894  ROK family protein  34.5 
 
 
300 aa  179  7e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0471  glucokinase  37.5 
 
 
322 aa  178  1e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1953  ROK family protein  37.34 
 
 
321 aa  177  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.109027  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3573  ROK family protein  33.77 
 
 
299 aa  177  2e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.406671  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0770  glucose kinase  39.3 
 
 
322 aa  176  5e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000145403  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0887  N-acylmannosamine kinase  38.26 
 
 
317 aa  176  6e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  36.1 
 
 
400 aa  175  9.999999999999999e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4056  ROK family protein  32.48 
 
 
302 aa  174  1.9999999999999998e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2111  xylose repressor  32.79 
 
 
302 aa  174  1.9999999999999998e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.044241  normal  0.767119 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  36.66 
 
 
352 aa  174  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1566  ROK family protein  32.19 
 
 
322 aa  171  1e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5352  ROK family protein  32.25 
 
 
298 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6562  ROK family protein  36.33 
 
 
321 aa  169  4e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  32.49 
 
 
395 aa  169  5e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  33.87 
 
 
418 aa  169  6e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2897  ROK family protein  35.87 
 
 
312 aa  169  7e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0086  glucokinase, ROK family  36.66 
 
 
313 aa  168  1e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  34.73 
 
 
342 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2938  glucokinase  37.5 
 
 
317 aa  166  5e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6210  ROK family protein  31.61 
 
 
302 aa  165  8e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.115608  normal  0.43177 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3649  ROK family protein  34.09 
 
 
297 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3703  ROK family protein  34.09 
 
 
297 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428812  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0493  ROK family protein  35.41 
 
 
300 aa  164  1.0000000000000001e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.241953 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1308  ROK family glucokinase  37.38 
 
 
313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.301963  normal  0.189583 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2701  ROK family protein  37.1 
 
 
314 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0819401  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0259  transcriptional regulator  39.08 
 
 
336 aa  164  2.0000000000000002e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4867  ROK family protein  29.06 
 
 
389 aa  164  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0889  glucokinase  38.06 
 
 
319 aa  162  9e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1326  ROK family protein  36.07 
 
 
306 aa  161  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0533007  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1206  glucokinase  34.91 
 
 
323 aa  160  3e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000192168  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1643  glucokinase  31.83 
 
 
313 aa  159  6e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1856  NagC family Transcriptional regulator  33.33 
 
 
316 aa  158  1e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  30.62 
 
 
408 aa  158  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2357  ROK family protein  34.7 
 
 
397 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0676  glucokinase  33.65 
 
 
321 aa  157  2e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1548  glucokinase  37.1 
 
 
363 aa  157  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0569057  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  33.86 
 
 
396 aa  157  3e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  30.23 
 
 
405 aa  157  3e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4866  glucokinase ROK family  36.22 
 
 
313 aa  155  6e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0395352 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  30.06 
 
 
422 aa  155  9e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2550  ROK family protein  31.79 
 
 
297 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2459  ROK family protein  33.92 
 
 
313 aa  154  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0122294  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14840  transcriptional regulator/sugar kinase  30.15 
 
 
443 aa  154  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0390  ROK domain-containing protein  32.92 
 
 
404 aa  154  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3170  ROK family protein  35.9 
 
 
314 aa  154  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  32.2 
 
 
396 aa  153  2.9999999999999998e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1825  ROK family glucokinase  36.36 
 
 
323 aa  153  4e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.064318  normal  0.188614 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2015  ROK family protein  30.98 
 
 
330 aa  152  5e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.217755 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3047  glucokinase, ROK family  34.48 
 
 
315 aa  152  5e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00154361  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02870  hypothetical protein  30.23 
 
 
434 aa  153  5e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2957  ROK family protein  34.21 
 
 
306 aa  152  7e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0661  ROK family protein  34.63 
 
 
321 aa  152  8.999999999999999e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1181  ROK family protein  30.9 
 
 
336 aa  150  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0920  glucokinase  32.71 
 
 
323 aa  150  2e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.635044  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1902  glucokinase, ROK family  35.78 
 
 
312 aa  150  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.132143  hitchhiker  0.000235661 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2404  ROK family protein  32.32 
 
 
333 aa  150  2e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.9022  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>