46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0082 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0082  hypothetical protein  100 
 
 		 295 aa  580  1.0000000000000001e-165  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.590083  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0927  hypothetical protein  32.49 
 
 		 351 aa  178  1e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3833  hypothetical protein  38.43 
 
 		 364 aa  176  4e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0514  hypothetical protein  35.84 
 
 		 351 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.241085  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1931  hypothetical protein  31.75 
 
 		 354 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.349657  normal  0.547729 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0371  hypothetical protein  33.89 
 
 		 345 aa  157  3e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1995  hypothetical protein  34.04 
 
 		 371 aa  145  5e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.153544  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2746  hypothetical protein  33.09 
 
 		 359 aa  144  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0768  hypothetical protein  38.1 
 
 		 346 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000331369  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0034  hypothetical protein  35.71 
 
 		 327 aa  137  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.749355 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2875  hypothetical protein  38.12 
 
 		 435 aa  136  3.0000000000000003e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.140163  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0332  membrane protein  39.66 
 
 		 422 aa  124  2e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.797962  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1901  hypothetical protein  36.62 
 
 		 435 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0822  membrane protein  35.98 
 
 		 310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000142099  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6773  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  35.67 
 
 		 1925 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2962  hypothetical protein  31.84 
 
 		 326 aa  72  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0055172  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4716  hypothetical protein  38.53 
 
 		 337 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.147365 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1250  hypothetical protein  32.93 
 
 		 541 aa  60.8  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1512  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  28.73 
 
 		 2107 aa  58.2  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.821841  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1000  Hemolysin-type calcium-binding region  31.71 
 
 		 844 aa  58.5  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.862975  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1648  hemolysin-type calcium binding protein  28.49 
 
 		 940 aa  57.8  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1963  hypothetical protein  32.82 
 
 		 1306 aa  57  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0327  hemolysin-type calcium binding protein  28.74 
 
 		 1814 aa  57  0.0000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0391395  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1194  type I secretion target GGXGXDXXX repeat-containing protein  33.94 
 
 		 928 aa  57.4  0.0000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1191  ApxIVA Var3  35.96 
 
 		 428 aa  57  0.0000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.171556  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  34.32 
 
 		 4798 aa  56.2  0.0000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0594  type I secretion target GGXGXDXXX repeat-containing protein  34.86 
 
 		 466 aa  55.8  0.0000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.353541  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0597  ApxIVA Var3  35.19 
 
 		 548 aa  55.8  0.0000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1592  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  28.49 
 
 		 1789 aa  55.8  0.0000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0991  hypothetical protein  34.32 
 
 		 679 aa  55.8  0.0000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  31.55 
 
 		 3598 aa  55.8  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0299  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  30.26 
 
 		 1607 aa  55.1  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  31.33 
 
 		 4687 aa  53.5  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1754  large exoprotein involved in heme utilization or adhesion  31.85 
 
 		 1809 aa  53.5  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0481615 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  34.91 
 
 		 1499 aa  52.8  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2204  peptidase M23  36.11 
 
 		 999 aa  51.6  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2298  hemolysin-type calcium binding protein  36.11 
 
 		 1480 aa  52  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.880239  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0994  hypothetical protein  32.88 
 
 		 585 aa  50.1  0.00004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0997  hypothetical protein  30.82 
 
 		 582 aa  49.7  0.00005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1438  type I secretion target GGXGXDXXX repeat-containing protein  30.63 
 
 		 677 aa  49.7  0.00006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.191778  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1199  hemolysin-type calcium binding protein  32.41 
 
 		 532 aa  49.3  0.00008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.506347  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0104  putative hemolysin-type calcium-binding protein  34.38 
 
 		 960 aa  48.5  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0140  hypothetical protein  32.03 
 
 		 172 aa  47.8  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06448  hemolysin A  30.77 
 
 		 1112 aa  46.6  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1433  hypothetical protein  30.91 
 
 		 320 aa  45.8  0.0008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0949231  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4924  serine protease  26.83 
 
 		 1805 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>