More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0075 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0075  aspartate kinase  100 
 
 
400 aa  820    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1412  aspartate kinase  64.84 
 
 
401 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0255759  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1274  aspartate kinase  64.84 
 
 
401 aa  513  1e-144  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164271  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1878  aspartate kinase  54.36 
 
 
399 aa  449  1e-125  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1221  aspartate kinase  51.87 
 
 
399 aa  430  1e-119  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08040  aspartate kinase  46.17 
 
 
427 aa  347  2e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000887302  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1377  aspartate kinase  44.75 
 
 
400 aa  344  1e-93  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000378473  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1044  aspartate kinase  48.38 
 
 
411 aa  344  2e-93  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0969  aspartate kinase  44.69 
 
 
409 aa  340  2e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2515  aspartate kinase  45.68 
 
 
406 aa  336  2.9999999999999997e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00310544  normal  0.299295 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1650  aspartate kinase  41.9 
 
 
403 aa  334  1e-90  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00485759  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2117  aspartate kinase  46.52 
 
 
404 aa  333  5e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.203177 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2609  aspartate kinase  44.03 
 
 
407 aa  330  3e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0578539  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0567  aspartate kinase  43.95 
 
 
408 aa  330  3e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.475671  normal  0.793189 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0043  aspartate kinase  44.87 
 
 
423 aa  329  6e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2012  aspartate kinase  43.86 
 
 
422 aa  329  7e-89  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.506578  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1425  aspartate kinase  44.67 
 
 
599 aa  328  9e-89  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1230  aspartate kinase  48 
 
 
411 aa  327  2.0000000000000001e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0111  aspartate kinase  43.3 
 
 
411 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.357195  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2048  aspartate kinase  43.81 
 
 
409 aa  327  3e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.122311  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1167  aspartate kinase  45.52 
 
 
412 aa  327  3e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000835866  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3762  aspartate kinase  43.32 
 
 
411 aa  324  1e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.216913  normal  0.392085 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4813  aspartate kinase  42.82 
 
 
423 aa  323  2e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52580  aspartate kinase  42.82 
 
 
412 aa  324  2e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1300  aspartate kinase  43.81 
 
 
408 aa  323  3e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000018313  normal  0.0162978 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0963  aspartate kinase  41.19 
 
 
400 aa  323  4e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3978  aspartate kinase  43.07 
 
 
411 aa  322  6e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0685  aspartate kinase  43.56 
 
 
400 aa  322  8e-87  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.985937  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0276  aspartate kinase  45.68 
 
 
409 aa  322  9.000000000000001e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.067186 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13741  aspartate kinase  45.26 
 
 
421 aa  321  9.999999999999999e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.500059  normal  0.255092 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1087  aspartate kinase  43.32 
 
 
400 aa  321  9.999999999999999e-87  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0999  aspartate kinase  43 
 
 
401 aa  321  9.999999999999999e-87  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.419107  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4611  aspartate kinase  42.82 
 
 
412 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1965  aspartate kinase  43.7 
 
 
405 aa  320  1.9999999999999998e-86  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0866474  hitchhiker  0.000866025 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0787  aspartate kinase  44 
 
 
404 aa  321  1.9999999999999998e-86  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5257  aspartate kinase  44.61 
 
 
421 aa  320  3e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.541049 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4889  aspartate kinase  44.61 
 
 
421 aa  320  3e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.213019  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4978  aspartate kinase  44.61 
 
 
421 aa  320  3e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.922524  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5504  aspartate kinase  43.66 
 
 
421 aa  320  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0983688 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4886  aspartate kinase  43.9 
 
 
422 aa  319  6e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4473  aspartate kinase  42.82 
 
 
411 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1442  aspartate kinase  42.82 
 
 
411 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0731797  normal  0.880113 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1304  aspartate kinase  43.6 
 
 
440 aa  318  1e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.928497 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0282  aspartate kinase  42.18 
 
 
434 aa  318  1e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5290  aspartate kinase  43.92 
 
 
415 aa  317  2e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34450  aspartate kinase  43.07 
 
 
411 aa  317  2e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0250796  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1075  aspartate kinase  45.77 
 
 
410 aa  317  2e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352103  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0610  aspartate kinase  42.82 
 
 
400 aa  316  4e-85  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0463  aspartate kinase  42.75 
 
 
446 aa  316  5e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.27288 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2702  aspartate kinase  43.7 
 
 
426 aa  315  6e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0773  aspartate kinase  45.41 
 
 
406 aa  315  6e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0117085  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1145  aspartate kinase  42.72 
 
 
599 aa  315  8e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3528  aspartate kinase  43.07 
 
 
424 aa  315  9e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.305275  normal  0.739035 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1251  aspartate kinase  44.94 
 
 
408 aa  314  9.999999999999999e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.545654 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9025  aspartate kinase  44.5 
 
 
422 aa  314  1.9999999999999998e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3627  aspartate kinase  42.96 
 
 
413 aa  314  1.9999999999999998e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000937685  decreased coverage  0.000000109716 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1843  aspartate kinase, monofunctional class  42.08 
 
 
410 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.369756  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3555  aspartate kinase  42.08 
 
 
410 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00961214  normal  0.594079 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1961  aspartate kinase  44.17 
 
 
409 aa  312  4.999999999999999e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000119099  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1141  aspartate kinase  42.96 
 
 
411 aa  312  6.999999999999999e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1515  aspartate kinase, monofunctional class  42.86 
 
 
405 aa  312  6.999999999999999e-84  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000110315  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1633  aspartate kinase  43.35 
 
 
405 aa  311  9e-84  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000255158  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3243  aspartate kinase  43.54 
 
 
601 aa  311  9e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0927  aspartate kinase  42.43 
 
 
413 aa  311  1e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1001  aspartate kinase  43.13 
 
 
616 aa  311  1e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0493  aspartate kinase  43.98 
 
 
421 aa  311  1e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.481845  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3600  aspartate kinase  44.67 
 
 
404 aa  311  1e-83  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000134751  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36380  aspartate kinase  44.01 
 
 
420 aa  310  2e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.881518 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2902  aspartate kinase  42.47 
 
 
424 aa  310  2e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1799  aspartate kinase  43.92 
 
 
405 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00100247  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4274  aspartate kinase  42.61 
 
 
413 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000967452  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1941  aspartate kinase  44.44 
 
 
409 aa  310  2.9999999999999997e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.122463  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04740  aspartate kinase  42.89 
 
 
435 aa  310  2.9999999999999997e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.230747  normal  0.356353 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04060  aspartate kinase  42.22 
 
 
427 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.53456 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1378  aspartate kinase  42.86 
 
 
405 aa  310  2.9999999999999997e-83  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000455127  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0966  aspartate kinase  43.92 
 
 
412 aa  310  2.9999999999999997e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00725941  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9311  Aspartate kinase  42.34 
 
 
424 aa  309  6.999999999999999e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.202676  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0419  aspartate kinase  43.58 
 
 
424 aa  308  9e-83  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.736746 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1454  aspartate kinase  40.2 
 
 
401 aa  308  1.0000000000000001e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.418783  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0504  aspartate kinase  42.96 
 
 
422 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1483  aspartate kinase  40.2 
 
 
401 aa  308  1.0000000000000001e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0559  aspartate kinase  43.55 
 
 
424 aa  307  2.0000000000000002e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0669  aspartate kinase  44.31 
 
 
400 aa  307  2.0000000000000002e-82  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1880  aspartate kinase  43.67 
 
 
405 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000266682  hitchhiker  0.0000823679 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2018  aspartate kinase  42.79 
 
 
399 aa  307  2.0000000000000002e-82  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000759653  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1175  aspartate kinase  42.48 
 
 
599 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3379  aspartate kinase  43.32 
 
 
410 aa  307  2.0000000000000002e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000124538  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2173  aspartate kinase  41.38 
 
 
417 aa  306  6e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1430  aspartate kinase  41.98 
 
 
410 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.039188  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1006  aspartate kinase  45.16 
 
 
410 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000423126  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1570  aspartate kinase  43.03 
 
 
399 aa  304  2.0000000000000002e-81  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2318  aspartate kinase  44.17 
 
 
407 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000267569  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0571  aspartate kinase  42.93 
 
 
408 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0407  aspartate kinase, monofunctional class  42.93 
 
 
408 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0390  aspartate kinase  43.32 
 
 
409 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1589  aspartate kinase  42.65 
 
 
408 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1370  aspartate kinase  43.1 
 
 
407 aa  303  5.000000000000001e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1290  aspartate kinase  43.81 
 
 
409 aa  302  6.000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.686916  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1480  aspartate kinase  43.46 
 
 
416 aa  301  1e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.630457  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3014  aspartate kinase  42.96 
 
 
406 aa  301  1e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000193467  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>