90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0065 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_1618  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
138 aa  280  6.000000000000001e-75  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0065  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
138 aa  280  6.000000000000001e-75  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1183  transposase IS3/IS911 family protein  31.75 
 
 
132 aa  73.6  0.0000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2663  transposase IS3/IS911 family protein  38 
 
 
134 aa  49.7  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.333405  normal  0.149935 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2283  transposase IS3/IS911 family protein  38 
 
 
134 aa  49.7  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00244066  normal  0.0121146 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2280  transposase IS3/IS911 family protein  38 
 
 
134 aa  49.7  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00249906  normal  0.0576324 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0887  transposase IS3/IS911 family protein  38 
 
 
134 aa  49.7  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2803  transposase IS3/IS911  42.22 
 
 
99 aa  48.5  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.227333  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0123  ISPsy8, transposase OrfA  44.68 
 
 
171 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0449  ISPsy8, transposase OrfA  44.68 
 
 
171 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0515  ISPsy8, transposase OrfA  44.68 
 
 
171 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5065  ISPsy8, transposase OrfA  44.68 
 
 
171 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.313858  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5508  ISPsy8, transposase OrfA  44.68 
 
 
171 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1842  transposase IS3/IS911 family protein  34.38 
 
 
102 aa  47.8  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2653  ISPsy8, transposase OrfA  44.68 
 
 
171 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.223836  normal  0.730107 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4859  ISPsy8, transposase OrfA  44.68 
 
 
171 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3316  ISPsy8, transposase OrfA  44.68 
 
 
171 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.395591 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1976  ISPsy8, transposase OrfA  44.68 
 
 
171 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.2483 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2991  transposase IS3/IS911 family protein  42.22 
 
 
99 aa  47  0.00008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4623  transposase IS3/IS911 family protein  40.82 
 
 
124 aa  46.6  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.453344  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4140  transposase IS3/IS911  29.85 
 
 
133 aa  46.2  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2942  transposase IS3/IS911  25.32 
 
 
124 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.95779  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1263  transposase IS3/IS911  26.39 
 
 
121 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3105  transposase IS3/IS911  25.32 
 
 
124 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2880  transposase IS3/IS911  25.32 
 
 
124 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.301854  normal  0.784208 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2864  transposase IS3/IS911  25.32 
 
 
124 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2434  transposase IS3/IS911  25.32 
 
 
124 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0591246 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2408  transposase IS3/IS911  25.32 
 
 
124 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.285932  normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0869  transposase IS3/IS911  25.32 
 
 
124 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.428884 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1144  transposase IS3/IS911  25.32 
 
 
124 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.731855 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9079  transposase  38.78 
 
 
124 aa  45.1  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9019  transposase  38.78 
 
 
124 aa  45.1  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8059  transposase  38.78 
 
 
124 aa  45.1  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.877817  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4903  transposase IS3/IS911 family protein  28.17 
 
 
128 aa  45.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.294667 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5506  transposase IS3/IS911 family protein  26.76 
 
 
124 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5452  transposase IS3/IS911 family protein  26.76 
 
 
124 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6452  transposase IS3/IS911 family protein  34.69 
 
 
124 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1413  transposase IS3/IS911 family protein  39.66 
 
 
82 aa  43.5  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0015724  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5395  transposase IS3/IS911 family protein  34.69 
 
 
99 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.182536  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0639  transposase IS3/IS911  30.61 
 
 
124 aa  42.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.198474  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0866  transposase IS3/IS911  30.61 
 
 
124 aa  42.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0783  transposase IS3/IS911  30.61 
 
 
124 aa  42.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.857983  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0659  transposase IS3/IS911  30.61 
 
 
124 aa  42.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1057  transposase IS3/IS911 family protein  29.33 
 
 
135 aa  42  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.905137  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1090  transposase IS3/IS911 family protein  29.33 
 
 
135 aa  42  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1480  transposase IS3/IS911 family protein  29.33 
 
 
135 aa  42  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.10456 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1944  transposase IS3/IS911  30.61 
 
 
124 aa  42.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1241  IS3 family transposase OrfA  34.55 
 
 
91 aa  42.4  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00141321  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2081  transposase IS3/IS911  30.61 
 
 
124 aa  42.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2100  transposase IS3/IS911  30.61 
 
 
124 aa  42.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1491  transposase IS3/IS911  30.61 
 
 
124 aa  42.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0660911  normal  0.178212 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1298  transposase IS3/IS911  30.61 
 
 
109 aa  42.7  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2666  transposase IS3/IS911  30.61 
 
 
124 aa  42.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0465233  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2357  transposase IS3/IS911  30.61 
 
 
124 aa  42.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0428135  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2673  transposase IS3/IS911  30.61 
 
 
124 aa  42.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2820  transposase IS3/IS911  30.61 
 
 
124 aa  42.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2867  transposase IS3/IS911  30.61 
 
 
124 aa  42.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2136  transposase IS3/IS911  30.61 
 
 
124 aa  42.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1017  transposase IS3/IS911  30.61 
 
 
124 aa  42.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.700598 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2046  transposase IS3/IS911  30.61 
 
 
124 aa  42.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1965  transposase IS3/IS911  30.61 
 
 
124 aa  42.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3087  putative transposase  30.61 
 
 
124 aa  42.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.809013  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0871  transposase IS3/IS911  30.61 
 
 
124 aa  42.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.433518 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1931  transposase IS3/IS911  30.61 
 
 
124 aa  42.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.749366 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0346  transposase  47.83 
 
 
106 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0508  transposase  47.83 
 
 
106 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1098  transposase  47.83 
 
 
106 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.93923e-58 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1366  transposase  47.83 
 
 
106 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.38752e-22 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1521  transposase  47.83 
 
 
106 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.6028199999999995e-37 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1364  transposase IS3/IS911 family protein  29.33 
 
 
135 aa  41.2  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.059427 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2608  hypothetical protein  47.62 
 
 
223 aa  41.6  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4076  transposase  47.83 
 
 
125 aa  41.2  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0985983  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2995  transposase  47.83 
 
 
125 aa  41.2  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2861  IS150-like protein  47.83 
 
 
125 aa  41.2  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.476556  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4724  transposase IS3/IS911  40.91 
 
 
71 aa  41.2  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.240633  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2330  transposase IS3/IS911  30.61 
 
 
124 aa  41.2  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.449623  normal  0.490803 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0590  transposase IS3/IS911  34.88 
 
 
97 aa  41.2  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.139932  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2023  transposase  47.83 
 
 
125 aa  41.2  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000284165  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1313  transposase  47.83 
 
 
125 aa  41.2  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000204726  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0514  transposase  47.83 
 
 
125 aa  41.2  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3113  transposase IS3/IS911  30.61 
 
 
124 aa  41.2  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0537  putative transposase  28.38 
 
 
102 aa  40.8  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0640  IS3 family transposase OrfA  34.55 
 
 
91 aa  40.8  0.006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0835  transposase IS3/IS911  32.65 
 
 
125 aa  40.8  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.907814  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1382  putative transposase or inactivated derivative  28.38 
 
 
102 aa  40.8  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1352  putative transposase  28.38 
 
 
102 aa  40.8  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5937  transposase IS3/IS911  32.69 
 
 
102 aa  40.4  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.653759  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0853  transposase  33.9 
 
 
193 aa  40.4  0.008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000147737  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2416  transposase  33.9 
 
 
193 aa  40.4  0.009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3959  transposase IS3/IS911  32.61 
 
 
94 aa  40.4  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.546667  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>